Voorstelling lopend onderzoek van de groep Huisdierengenetica. Prof. N. Buys

Maat: px

Weergave met pagina beginnen:

Download "Voorstelling lopend onderzoek van de groep Huisdierengenetica. Prof. N. Buys"

Victor van der Zee
4 jaren geleden
Aantal bezoeken:

1 Voorstelling lopend onderzoek van de groep Huisdierengenetica Prof. N. Buys

2 Onderzoeksgroep Huisdierengenetica Situering binnen de K.U.Leuven K.U.Leuven Groep Wetenschap en Techniek Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen Departement Biosystemen Afdeling Gentechnologie Vaccin design (Prof. Bruno Goddeeris) Gentechnologie (Prof. Guido Volckaert en Prof. Rob Lavigne) Huisdierengenetica (Prof. Nadine Buys) Het ontrafelen van genetische complexiteit in dierlijke genomen

3 Genetisch onderzoek bij huisdieren Het ontrafelen van genetische complexiteit in dierlijke genomen Tal van eigenschappen worden gecontroleerd door verschillende genen (complexen) Twee methoden 1. We kennen al die genen niet => we proberen de genetische aanleg voor een eigenschap in te schatten op basis van uiterlijke kenmerken => fokwaardeschatting 2. We proberen de individuele genen die de eigenschap beïnvloeden te karakteriseren en de causale mutaties te identificeren => genetische test => merker ondersteunde selectie Toepassingen in de fokkerij

4 Twee disciplines Kwantitatieve genetica: het inschatten van de erfelijke aanleg van een dier op basis van het fenotype van het dier zelf en zijn verwanten P = G + E Fenotype = Genotype + Omgeving Moleculaire genetica: het vinden van juiste genetische oorzaak van een bepaald fenotype en het eventueel ontwikkelen van een genetische test hiervoor Databanken COMPUTER DNA stalen LABORATORIUM

5 Genetisch onderzoek bij huisdieren? Sommige dieren scoren hoger voor bepaalde kenmerken zijn gevoelig(er) voor bepaalde ziekten dan andere dieren in dezelfde omgeving en geven dit ook door aan de nakomelingen Waarin verschillen ze? => genetische aanleg Welke kenmerken? => vraag vanuit de praktijk => vraag voor samenwerking van andere onderzoekers => vraag vanuit de maatschappij 5

Huisdierengenetica: Varkens Onderwerp Periode Fonds

Moleculair genetische basis van aangeboren afwijkingen :

enterotoxigene diarree Selectie tegen berengeur als alternatief

Vlaams Fokkerijcentrum 2009-2011 IWT-post-doctoraal mandaat

Landbouwkundig onderzoek (project) Uitwisseling onderzoekers

6 Huisdierengenetica: Varkens Onderwerp Periode Fonds Fokwaardeschattingen Berekenen en controle van inteelt Moleculair genetische basis van aangeboren afwijkingen : liesbreuken Genetische aspecten van gevoeligheid voor enterotoxigene diarree Selectie tegen berengeur als alternatief voor castratie van berenbiggen Overheidsopdracht Vlaams Fokkerijcentrum IWT-post-doctoraal mandaat IWT- Landbouwkundig onderzoek (project) IWT- Landbouwkundig onderzoek (project) Uitwisseling onderzoekers vleeskwaliteit varkens EU-Marie Curie (project) Netwerk onderzoekers Pig Genome EU-COST action

Huisdierengenetica: Paarden Onderwerp Periode Fonds Fokwaardeschattingen

2009-2012 Overheidsopdracht Vlaams Fokkerijcentrum Moleculaire analyse van

Identificatie en ouderschapscontrole 2009- ISAG: VFBT +.

zomereczeem bij Belgisch Trekpaard en Belgisch Warmbloedpaard Moleculair

7 Huisdierengenetica: Paarden Onderwerp Periode Fonds Fokwaardeschattingen (springen, dressuur, lineaire kenmerken) Berekenen en controle van inteelt Overheidsopdracht Vlaams Fokkerijcentrum Moleculaire analyse van inteelt bij Belgisch Trekpaard 2009 Vlaamse Fokkers Belgisch Trekpaard (VFBT) Identificatie en ouderschapscontrole ISAG: VFBT +. Kwantitatief en moleculair genetische analyse van gevoeligheid voor zomereczeem bij Belgisch Trekpaard en Belgisch Warmbloedpaard Moleculair genetische basis van chronisch progressief lymfoedeem (CPL) bij het Belgisch Trekpaard IWT-bursaal FWO-project

8 Huisdierengenetica : Schapen en Kippen Onderwerp Periode Fonds Fokwaardeschattingen (worpgrootte, groei lammeren) Overheidsopdracht Vlaams Fokkerijcentrum Onderwerp Periode Fonds Genetische diversiteit bij kippen IWT kunst en wetenschap

Technieken Fokwaardeschattingen (BLUP) Schatten van genetische parameters (MCMC, Gibbs

(associatiestudies, sequentie-analyse) Whole genome scan mbv SNP-chips (paarden-kippen-varkens)

microsatellieten Expressiestudies mbv Real time PCR Diagnostische test zomereczeem (ELISA

Sire line (IGF2+/IGF2+) Dam line boar (igf2-/igf2-) Terminal sire x Parent sow (IGF2+/IGF2+)

9 Technieken Fokwaardeschattingen (BLUP) Schatten van genetische parameters (MCMC, Gibbs sampling) Genetische diversiteit op basis van pedigree-analyse Kandidaatgen-screening (associatiestudies, sequentie-analyse) Whole genome scan mbv SNP-chips (paarden-kippen-varkens) Paterniteitscontrole mbv microsatellietanalyse Berekenen van inteelt op basis van microsatellieten Expressiestudies mbv Real time PCR Diagnostische test zomereczeem (ELISA histamine) Merker-ondersteunde selectie Marker assisted selection for parentally imprinted QTN Sire line (IGF2+/IGF2+) Dam line boar (igf2-/igf2-) Terminal sire x Parent sow (IGF2+/IGF2+) (igf2- paternal = fatter) Prolificacy Slaughter pig (IGF2+ paternal = lean / igf2- maternal = silent) Carcass quality and uniformity

10 Subsidies partners COVAMEAT N.V.

11 Wetenschappelijke partners Diergenomica Prof. Johan Van Arendonck Prof. Martien Groenen Dr. Bart Ducro U. Wageningen, Nederland Prof. Michel Georges U. Luik Huisdieren Prof. Eddy Decuypere Dr. Nadia Everaert Fysiologie Prof. Bruno Goddeeris Immunulogie Dr. Jose Luis Noguera Dr. Romi Pena IRTA, Spanje Prof. Leif Andersson Uppsala, Zweden Prof. Theo Niewold Voeding en Gezondheid Dierproductie Prof. Stefaan De Smet UGent Dr. Daniël De Brabander ILVO-dier Diergeneeskunde Prof. Frank Gasthuys Prof. Rik Ducatelle Prof. E. Cox Prof. L.Peelman UGent Bioinformatica Prof. Yves Moreau Menselijke erfelijkheid Prof. Jean-Jacques Cassiman Prof. Harry Cuppens Prof. P. Marynen Menselijke erfelijkheid

Wie is wie? Diensthoofd Prof. Nadine Buys Ellen Liesbet Anneleen Tom Steven Post-docs Dr. Steven Janssens Kwantitatieve genetica Fokwaardeschattingen Dr.

12 Wie is wie? Diensthoofd Prof. Nadine Buys Ellen Liesbet Anneleen Tom Steven Post-docs Dr. Steven Janssens Kwantitatieve genetica Fokwaardeschattingen Dr. Anneleen Stinckens Moleculaire genetica Liesbreuken biggen Ir. Ellen Ons Diversiteit kippen Martine Rhea Chris Kirsten Nadine Laboranten Chris Lamberights Tom Luyten Doctorandi: Ir. Martine Schroyen (Bio-ir) Ir. Liesbet Peeters (Bio-ir) Kirsten De Keyser (DVM) Rhea De Wael (DVM) E.coli resistentie biggen Zomereczeem paarden Lymfoedeem trekpaarden Berengeur varkens

Vergelijkbare documenten

Genetische analyse van de gevoeligheid voor zomereczeem bij Belgische warmbloed paarden

3 de Vlaamse fokkerijdag 26 oktober 2011 Genetische analyse van de gevoeligheid voor zomereczeem bij Belgische warmbloed paarden LIESBET PEETERS Onderzoeksgroep Huisdierengenetica Departement Biosystemen