Wat heeft de veehouder aan Genomics

Transcriptie

1 2/1/21 Wat heeft de veehouder aan Genomics Mario Calus en Johan van Arendonk Wageningen UR Livestock Research en Wageningen University Wat wil de veehouder? Een goed inkomen halen van het bedrijf door het melken van koeien die: voldoende melk van goede kwaliteit produceren passen binnen het bedrijf prettig zijn om mee te werken goede gezondheid en vruchtbaarheid hebben Fokkerij kan bijdragen aan het realiseren hiervan Fokkerij op melkveebedrijf Stap 1: Bepalen van het fokdoel: welke kenmerken zijn belangrijk bij selecteren van koeien en stieren Stap 2: Selecteren van de stieren op basis van fokwaarden, beschikbaarheid en prijs Stap 3: Selecteren van koeien Stap 4: Paring en hopen op een vaarskalf Fokkerij op melkveebedrijf: rol van Genomics Stap 1: Bepalen van het fokdoel: welke kenmerken zijn belangrijk bij selecteren van koeien en stieren Stap 2: Selecteren van de stieren op basis van fokwaarden, beschikbaar beschikbaarheid en prijs Stap 3: Selecteren van koeien Stap 4: Paring en hopen op een vaarskalf toekomst Voortplanting en genetische variatie De rol van genomics: nader toegelicht Door meiose: unieke combinaties van genen in elke nakomeling (variatie binnen-familie) Deze binnen-familie variatie vormt belangrijke bron voor genetische verbetering Hoe vinden we de beste? 1

2 V e t p e r c e n t a g e % 2/1/21 Nakomelingenonderzoek: cruciale rol Genomic selection Metingen aan dieren in populatie Familierelaties Model genetische achtergrond Aantal (n) Fokstieren 6k SNP-chip Genotype= typering van genetisch materiaal Per dier zijn dan 4.1 SNP s bekend, verdeeld over het hele genoom (alle chromosomen) SNP=verschil op 1 plaats in DNA Zo ziet het er dan uit: dier 1 A A G T A T T A T C T T A A G T A T T A T C T T. En dat dan 4.1x dier 2 A A G T A T T A T C T T A A G A A T T A T C T T Genomic selection bij melkvee (r 2 IH ) EBV jonge stieren (CRV, 29) Stap 1: Schatting van effecten van SNP Op basis van stieren met bekende fokwaarde en genotypen (=referentiepopulatie) Stap 2. Bereken fokwaarden voor jonge dieren op basis van SNP genotypen Som van geschatte SNP effecten Voordeel Fokwaarde met hoge betrouwbaarheid op jonge leeftijd (zonder nakomelingen onderzoek) 2

3 2/1/21 Genomic fokwaarden Genomics is nieuwe informatie bron genomics fokwaarde vergelijkbaar met ~1 melkgevende dochters NVI Fokwaarden publicatie augustus Nationaal Interbull Genomic -2 Genomics fokwaarden op jonge leeftijd relatief hoog, maar lager dan van fokstieren Kan eenzijdig gebruik van 1 jonge Genomics stier leiden tot teleurstelling? => Welke verandering mogen we verwachten, gegeven de betrouwbaarheid??? Verandering individuele fokwaarden (augustus) Genomics stieren Gem abs diff

4 2/1/ Gem abs diff Maximale verandering: 1 vs. team genomics stieren Maximale verandering (NVI) voor 9% van de stieren stier team met stieren Genomics fokwaarden Individuele fokwaarde kan redelijk wijzigen van een groep jonge GS stieren is wel hoog => Gebruik van team jonge GS stieren voorkomt gemiddeld genomen teleurstellingen Genomic fokwaarden: ontwikkelingen Verhoging betrouwbaarheid door meer merkers+verbetering methoden Genomic fokwaarden ook voor andere rassen mogelijk Toepassing door meerdere organisaties (+omrekening via Interbull) Genomics op koeien binnen bedrijf? Goedkope testen op basis van 3. merkers Wat betekent Genomics voor moeilijke kenmerken Bijv. levensduur => gegevens pas laat beschikbaar In de toekomst mogelijkheid om: Jongvee te testen: welke vaarzen aanhouden? Nauwkeuriger fokwaarde van koeien Met genomics: Optimaal gebruik van informatie stieren met veel dochters Direct een fokwaarde met redelijke betrouwbaarheid voor jonge dieren grotere kans op selectie 4

5 2/1/21 Selectie voor nieuwe kenmerken Genomic selection: niet langer nodig om dochtergegevens van iedere stier te verzamelen Conclusies Genomic fokwaarden zijn relatief nieuw: staan aan het begin van nieuw tijdperk Mogelijkheden voor nieuwe kenmerken als: Voerefficiëntie Methaan emissie Melkeiwitsamenstelling Veelbelovende stieren komen sneller aan het licht Voordeel veehouder: hogere genetische vooruitgang door Breder aanbod van stieren Testen van dieren op eigen bedrijf Stelling 1 Ik gebruik komend jaar 8% genomics stieren Stelling 2 In Nederland is er behoefte aan een genomics test voor veehouders om koe en stierkalveren te testen Stelling 3 Unieke kans om te selecteren op verbetering van voerefficientie en verlaging methaanuitstoot