Data mining uit diverse bronnen. Tomas Janssen, Ph.D. Resident medical physicist

Transcriptie

1 Data mining uit diverse bronnen Tomas Janssen, Ph.D. Resident medical physicist

2 Registratie van: - Kwaliteit van leven - Patient reported Outcome Registratie van: - Ziekteprogressie - Tumorrespons - Metastases Hoe gaat het met de Registratie patient? van: - Accute toxiciteit -Heeft Late de toxiciteit straling de tumor aangetast? Wat voor overige schade heeft de straling verricht?

3

4 Hoe gaat het met de patient? Registratie van: - Kwaliteit van leven - Patient reported Outcome Heeft de straling de tumor aangetast? Registratie van: - Ziekteprogressie - Tumorrespons - Metastases Wat voor overige schade heeft de straling verricht? Registratie van: - Accute toxiciteit - Late toxiciteit Welke behandeling is gegeven? Registratie van: - Gegeven dosis - fractionering - Behandelinformatie Waarom is voor deze behandeling gekozen? Registratie van: - Patient informatie - Diagnostische informatie

5 Knowledge management Vragen Data Infrastructuur

6 Vragen? Operationele vragen Efficientie workflow? Linac bezetting? Financiele administratie? Klinische vragen? Toxiciteit? Kwaliteit van leven? Decission support? Kwaliteit van de behandeling?

7 (Image adapted from Elekta Knowledge management platform) Infrastructuur Data Sources ETL Data Warehouse Oncology Analytics Apps HIS/EHR Data Extraction Clinical & Operational Dashboards Registries Data Cleansing Staged data sources Clinicians Ad-hoc & Enterprise Reporting Treatment Planning Data Transforming Predictive Analytics Management Clinical Research Data Aggregating Mapped and Secure Metadata Visual Data Discovery Clinical Researchers Data Warehouse /Data Marts Excel CSV PDF XML Data Loading Alerting & Notification

8 Voorbeeld 1: doorlooptijden Bron Data Vraag Mosaiq QCLs Hoe zijn de doorlooptijden van de processtappen? Infrastructure: Mosaiq QCL DATA / afspraken data Reports (webserver)

9 Voorbeeld 1: doorlooptijden

10 Voorbeeld 1: doorlooptijden PlanRT CT scan Intekenen Complete Doelgebiedenbespreking Complete BSU Complete De datum waarop het PlanRT wordt ingediend (de careplandatum in Mosaiq). De datum en tijd van de eerste (PET-)CT scan afspraak in Mosaiq na de PlanRT datum. De datum en tijd van het completen van het QCL item "V: Intekenen" of "V: TRAJECT Intekenen" na de PlanRT datum. De datum en tijd van het completen van het QCL item "V:Bespreking Doelgeb" of "V:Bespreking Doelgeb. locatie" na de PlanRT datum. De datum en tijd van het completen van het QCL item "V: TRAJECT Vsim" of "V: V/Sim" of "V: BSU" of "V: TRAJECT BSU" na de PlanRT datum. BSU Bespreking Complete De datum en tijd van het completen van het QCL item "V:Bespreking V/Sim" of "V: Bespreking BSU" of "V: Bespreking BSU locatie." of "V: Bespreking BSU locatie" na de PlanRT datum. Planning Complete Voorbereiding Toestel Complete De datum en tijd van het completen van het QCL item "V: Planning" of "V: TRAJECT Planning" na de PlanRT datum. Dit item is op dit moment onduidelijk/foutief benoemd. Dit is het moment van de laatste handeling door de planning, dus het moment waarop de planning klaar is en het toestel de invoer kan afmaken. Dit is de datum en tijd van het toevoegen van het QCL item "RT Calendar Maken". Eerste RT De datum en tijd van de eerste bestralingsafspraak op het toestel.

11 Voorbeeld 2: productie Datasource Data Question Mosaiq, ChipSoft Behandelgegevens MQ; DBC registratie Wat voor trends zijn er in de productie? Infrastructure: Mosaiq Behandelgege vens DWH Reports (webserver) ChipSoft DBC registratie

12 Aantal patienten Voorbeeld 2: productie Month (2014)

13 Voorbeeld 2: productie Aantal externe doorverwijzingen (Careplans) per verwijzer

14 Project REBUS Registratie vd Behandeling, Uniform en Structureel. 2 uitdagingen: Zorgen dat de registraties er uberhaupt zijn Zorgen dat de registraties toegankelijk zijn Gestart in 2012 Dec 2012 : 1. Digitale toxiciteitsregistratie Nov 2014: 2. Digitale registratie ziekteverloop Mei 2015 : 3. Digitale registratie PROMs Doorlopend: 4. Databronnen aan elkaar koppelen

15 Relative #Patients Cumulative incidence Rebus example data KM Estimate of Dysphagia grade 2+ grade 3+ censor days FU since first RT KM estimate of grd2+ Dysphagia 30 days after first RT (90% c.i.) for treatment KNO Q Q Q Q Q Q Q Q Quarter

16 Voorbeeld vraag - For alle long bestralingen - Prescription 24 x 275 cgy, - Eerste RT na , - Geen herbestralingen - Wat is de relatie tussen de esophagus V50Gy en het optreden van dysphagie.

17 Verschillende data bronnen Datasource Data Mosaiq, ChipSoft, PACS Behandel informatie, dosis informatie, toxiciteitsdata Infrastructure: Mosaiq Behandelinformatie PACS RT DICOM DVH calc DWH ChipSoft Toxiciteitsregistratie Reports (webserver)

18 4. Data ontsluiting Data Octopus : een tool die alle relevante data bronnen kan koppelen Mosaiq PACS Chipsoft

19 Mosaiq stukje - Lokale dump van de database (MasterMiniDB)

20 Mosaiq stukje - Lokale dump van de database (MasterMiniDB) - Careplan - Start RT - Primaire diagnose - # Courses - # Sites - Fractionering - Totale Dosis - Patient ID - Plan ID PACS Chipsoft

21 Octopus voorbeeld

22 Octopus voorbeeld

23 Octopus voorbeeld

24 Incidence Octopus voorbeeld KM-curve: Esophagitis (gr2+) V 50Gy (Esophagus) > 30 % V 50Gy (Esophagus) < 30 % Kwint (2012) Days since start RT V50Gy esophagus van 30% Grd 2 dysphagia NTCP ~ 57%

25 Conclusies Er staat een hoop interessante data in MQ Echt interessant wordt het als je data gaat koppelen. Het is niet altijd triviaal hoe dat moet