2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie. 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

Transcriptie

1 MICROBIOLOGIE - DEEL I - LES 1 Prof. Dr. ir. J. Swings «Biology of Microorganisms», 9de ed. (2000) LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) 1

2 Volg links: research, education log in om de dias te bekomen LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) 2

3 Faculty of Sciences Laboratory of Microbiology Prof. Dr. ir. J. Swings Prof. Dr. M. Gillis Prof. Dr. P. De Vos Prof. Dr. P. Vandamme Wetenschappelijk personeel: 24 Administratief en technisch personeel: 25 GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCES LABORATORY OF MICROBIOLOGY TEACHING TEACHING UNIVERSITY STUDENTS IN BIOLOGY, BIOTECHNOLOGY, BIOCHEMISTRY Master of Science in Applied Microbial Systematics 3

4 GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCES LABORATORY OF MICROBIOLOGY RESEARCH GROUPS RESEARCH on CLASSIFICATION, PHYLOGENY, IDENTIFICATION AND TYPING OF BACTERIA, related to ECOLOGY, BIODIVERSITY, BIOTECHNOLOGY Rhizosphere bacteria (N 2 -fixers), plant pathogenic bacteria Bacillus and allied groups Lactic acid bacteria (probiotics) Drinking waters Antarctic mats, fresh waters, tropical soils Biodegradation of bioplastics, xenobiotics Antibiotic resistance genes in the environment and the food chain Bacteria from clinical, veterinary and industrial environments GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCES LABORATORY OF MICROBIOLOGY BCCM /LMG BACTERIA COLLECTION PRESERVATION and DISTRIBUTION of BACTERIAL CULTURES SERVICES RESEARCH Phylogeny, classification, identification and typing of acetic acid bacteria, Vibrio, lactic acid bacteria, streptomycetes Taxonomy of bacteria from clinical, veterinary and industrial environments Optimising fine strain typing Automation/robotisation 4

5 GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCES LABORATORY OF MICROBIOLOGY GENOMIC TECHNIQUES TECHNIQUES DNA sequencing % GC determination DNA:DNA hybridisations DNA fingerprinting (DGGE, ARDRA, t-rna, REP, RAPD, PFGE, AFLP) PHENOTYPIC TECHNIQUES gaschromatographic analysis of cellular fatty acids (FAMEs) gelelectrophoresis of cellular proteins (SDS-PAGE) metabolic fingerprinting (breathprints, conventional characterization) BIOINFORMATICS and BIONUMERICAL techniques for database construction data mining data analysis INTRODUCE NEW MOLECULAR TECHNIQUES American Society for Microbiology (ASM) 5

6 LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) MICRO-ORGANISMEN Algen Afmetingen: 1µm 10cm Protozoa 2 200µm EUKARYOTEN Fungi (gisten en schimmels) 2 10µm Bacteriën 0.3 2µm PROKARYOTEN soms tot 100µm Virussen µm 6

7 Life is first and foremost a microbiological phenomenon Oudste fossielen Zijn aanwezig in de biosfeer sinds 3/4 van het ontstaan van het leven Leeuwenaandeel van het globaal metabolisme, biomassa en diversiteit A definition of life Living organisms are autopoietic systems capable of evolution by natural selection 7

8 The mystery of life De kenmerken van het cellulair leven Fig

9 Fig. 1.3 Metaforen over de cel Chemische fabriek Informatie opslagplaats Groei Fig

10 LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) Fig

11 Virussen Virussen 11

12 Bacteriofagen zijn virussen van bacteriën LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) 12

13 Fig. 1.8 Bacterie Archaea Eukaryoot Fig

14 LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) Uitzuiveringsent = uitstrijk Fig

15 Steriele overenting Fig LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) 15

16 Micro-organisms are part of your life They are your ancestors You carry them with you De impact van micro-organismen op de mens Fig

17 Fig LES 1 1. INLEIDING 2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie 1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2) 1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1) 1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3) 1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3) 1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3) 1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4) 1.8 De historiek van Microbiologie (1.5) 17

18 Antonie van Leeuwenhoek ( ) De microscoop van A. van Leeuwenhoek 18

19 Louis Pasteur ( ) Pasteur s experiment Fig. 1.18a 19

20 Fig. 1.18b Fig. 1.18c 20

21 Robert Koch ( ) Koch de ontdekker Anthrax Bacillus anthracis (1877) Reinculturen (1881) Tuberculose Mycobacterium tuberculosis (1882) Cholera Vibrio cholera (1883) Kochse postulaten (1884) 21

22 Koch s tekeningen van Mycobacterium tuberculosis Fig Postulaten van Koch Fig. 1.19a 22

23 Fig. 1.19b Fig. 1.19c 23

24 Fig. 1.19d Martinus Beijerinck Fig

25 Sergei Winogradsky Fig jaar Microbiologie 1684 Van Leeuwenhoek 1860 Pasteur Koch s reinculturen 1929 Penicilline 1983 HIV 1995 Eerste complete bacteriële genoomsequentie Tabel