Volgens onze gegevens hebt u ten minste één kit met de getroffen partijnummers ontvangen. Buffers and. No ) , ,

Transcriptie

1 QIAGEN GmbH QIAGEN Strasse Hilden Germany 16 januari 2018 Dringende veiligheidsmededeling omtrent: therascreen KRAS Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen BRAF Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen EGFR Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen GIST RapidScreen Pyro-kit (REF ), therascreen NRAS Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen RAS Extension Pyro-kit (REF ), PyroMark Gold Q24-reagentia (5 x 24) CE (REF ) Geachte klant die van ons therascreen Pyrosequencing heeft gekocht, We sturen u deze dringende veiligheidsmedeling omdat we voor de therascreen Pyrosequencing-assays hebben geconstateerd dat er sprake is van een toenemend aantal gevallen met gewijzigde verhoudingen in de patronen van pieken van de Pyrogrammen. Voor de producten van de onderstaande partijnummers geldt dat ze in verband worden gebracht met een hogere ongeldigheidsmarge en er vaker een hertest voor nodig is. Daarnaast geeft het gebruik van een product van de onderstaande partijnummers een verhoogd risico op foutpositieve resultaten voor A59T met betrekking tot de Pyrosequencing-analyse van NRAS codon 59 met de therascreen RAS Extension Pyro-kit (REF ). Voor de andere mutaties in de therascreen RAS Extension Pyro-kit of in de andere therascreen Pyro-kits is er geen bewijs van dat ze zorgen voor een verhoogd risico op zulke foutpositieve resultaten. Volgens ons onderzoek hangt het probleem samen met een aantal partijen PyroMark Q24 Gold-reagentia (Mat. nr ) die hieronder zijn weergegeven. Deze zitten in meerdere partijen van de therascreen Pyro-buffers en -reagentiadoos (Mat. nr ) die zijn meegeleverd met de therascreen Pyro-kits met CE-IVD-markering, zoals in het kopje hierboven weergegeven. Alle partijnummers van de producten zijn vrijgegeven volgens de specificaties van de kwaliteitscontrole. Volgens onze gegevens hebt u ten minste één kit met de getroffen partijnummers ontvangen. Overzicht van het getroffen materiaal: Materiaal Partijnr. Zit in Partijnummers PyroMark Gold Q24 Reagents (Mat. No ) therascreen Pyro , Buffers and Reagents (Mat No ) , , ; PROM

2 Beschrijving van het probleem In Pyrosequencing-runs die met het getroffen materiaal worden uitgevoerd, wordt de verhouding van de piekhoogte voor datp-pieken in Pyrograms kunstmatig verhoogd, terwijl tegelijkertijd de piekhoogte voor dgtp verlaagd kan zijn. Dit kan resulteren in een gewijzigde verhouding van de piekhoogtes, wat leidt tot een verkeerd vaststelling van de frequenties van de allelmutatie. Als de vastgestelde frequentie van de allelmutatie de detectiegrens (LOD) overschrijdt, kan dit ertoe leiden dat de Pyrosequencing-software ten onrechte handmatig of automatisch de bijbehorende potential low level mutations (potentiëel laag niveau mutaties) of in sommige gevallen een mutation (mutatie) oproept. Daarbij kan de afwijking middels de bijbehorende algoritmen van de Pyrosequencing-software de kwaliteitsscore beïnvloeden. De afwijking beïnvloedt onafhankelijk controle-wildtypes (WT) en onbekende monsters. Voor zover wij weten, leidt dit voor geen van de assays, behalve voor NRAS59, tot een potentieel hogere foutpositieve score wanneer de Pyrosequencing-resultaten aan de hand van de bijbehorende gebruiksinstructies worden geëvalueerd. Het kan in deze gevallen echter voor elke assay voorkomen dat er vaker een hertest moet worden uitgevoerd. Wanneer de NRAS codon 59-mutaties (A59T) in de getroffen partijen als resultaat mutation hebben: Er is een grotere kans op het oproepen van een A59T-mutatie als de mutatie in de allelfrequenties lager is dan 15%, terwijl de controle-wt geldig is (geen mutatie gedetecteerd) en de kwaliteitsscore niet negatief wordt beïnvloed. Door de klant/gebruiker te ondernemen acties Controleer of de bijbehorende plug-in voor de verslagen van de assay, die de resultaten automatisch intepreteert, wordt gebruikt. Deze plug-ins bevatten ook voorbeelden van Pyrogrammen waardoor het gemakkelijker wordt om afwijkingen in de patronen van pieken vast te stellen. De actuele Plug-ins zijn rechtstreeks op de website van QIAGEN ( op de desbetreffende productpagina('s) te vinden. Ga daarvoor naar het tabblad Product Resources (hulpbronnen product), onder de rubriek Analysis Software (Analysesoftware). Als u nog een restvoorraad hebt met de getroffen partijnummers, dan mag u die niet meer gebruiken. Neem contact op met onze afdeling technische service om kosteloos de resterende partijen Pyromark Gold-reagentia te laten vervangen. Verstrek daarbij het partijnummer van de Pyromark Gold, alsook het referentienummer en de naam van de therascreen-kit. Verstrek ook een voorbeeldbestand van een pyro-run met onbekende monsters en controle-wt's die dienovereenkomstig zijn gelabeld. Als u de getroffen partijen hebt gebruikt, dan adviseren wij u met klem om de desbetreffende resultaten nogmaals te bekijken. Gebruik de volgende criteria om het probleem van de gewijzigde verhouding van de pieken in uw Pyrosequencing-runs vast te stellen: Als er een hoger aantal dan gebruikelijk van de DNA-monsters van de controle-wt boven de LOD ligt en dat resulteert in een potentiële low-level-mutatie of een mutatie, dan is dat een aanwijzing dat de afwijking aanwezig is. 2

3 Als er een hoger aantal van de monsters dan gebruikelijk is gemarkeerd met een beoordeling van verminderde kwaliteit, zoals "check" (controle) of "failed" (mislukt), volgens het algoritme dat automatische de score berekent, dan is dat een aanwijzing dat de afwijking aanwezig is. Een bovengemiddelde detectiefrequentie voor potential low-level mutation of mutation impliceert onbekende monsters in vergelijking met de natuurlijke prevalentie van deze mutatie binnen het onderzochte ziektebeeld van de kanker en de onderzochte etniciteit. De natuurlijke prevalentie van bepaalde mutaties die door de Pyrosequencing-assays zijn geanalyseerd, kan lager zijn dan 5%. Elke verhoogde frequentie van het oproepen van mutaties voor zulke zeldzame varianten (zoals meerdere oproepen binnen een kort tijdsbestek) kan erop duiden dat het probleem aanwezig is. Als er meerdere (2 of meer) mutations of potential low-level mutations worden opgeroepen in verschillende codons van hetzelfde gen van hetzelfde monster, dan kan dat erop duiden dat het probleem aanwezig is. Wanneer u door een of meerdere van de bovenstaande criteria hebt geconstateerd dat het probleem aanwezig is, dan adviseren we met klem om de betrokken Pyrosequencing-resultaten opnieuw te evalueren. Volg nauwgezet de interpretatie van de analyseresultaten, zoals beschreven in de bijbehorende gebruiksinstructies van de therascreen Pyro-kit. Let daarbij op de onderstaande observaties en bijbehorende acties: Herevaluatie Observatie Actie voor monsters waarvan het oproepen van de A59T-mutatie onder de mutatiefrequentie in NRAS59 van 15% ligt 1. Het opnieuw evalueren van de controle-wt's onafhankelijk van het mutatieresultaat voor een onbekend monster 2. Herevaluatie van onbekende monsters met een mutatie in de allelfrequenties tussen de LOD en de mutatiefrequentie van 15%, maar met geldige resultaten voor de controle-wt. De gedetecteerde mutatiefrequentie voor elke controle-dna van het WT in een run ligt boven de LOD. Dit resulteert voor deze controle-wt in het oproepen van een potentiële low-levelmutatie of mutatie. 1) De gemeten pieken in het Pyrogram stemmen niet overeen met de hoogte van de balken in het histogram en kunnen niet worden verklaard door zeldzame of onverwachte mutaties. Als u de plug-ins gebruikt voor automatische verslagen, dan kunt u elke Pyrogram afzonderlijk vergelijken met een voorbeeld-pyrogram om zulke afwijkingen op te sporen. Volgens de gebruiksinstructies is de run voor deze assay ongeldig. Gebruik voor elke hertest de omgeruilde partijen PyroMark Q24 Goldreagentia. Houd rekening met een hogere kans op foutpositieve resultaten. Voer een hertest uit met de omgeruilde partijen Pyromark Goldreagentia ter bevestiging van alle resultaten met een positieve A59T- mutation en potential low-level mutation die onder de allelfrequentie van 15% liggen en waarvoor ten minst een van de observaties geldt. Als een hertest niet Actie voor alle andere therascreen-assays Volgens de gebruiksinstructies is de run voor deze assay ongeldig. Gebruik voor elke hertest de omgeruilde partijen PyroMark Q24 Goldreagentia. Als de analyse volgens de gebruiksinstructies is uitgevoerd, dan is een extra hertest ter bevestiging niet nodig. 3

4 2) Een verhoogde achtergrondkleuring voor een mutatie zoals gedetecteerd door de allelfrequenties voor de controle-dna van de WT tussen de Limit of Blank (blancolimiet of LOB) en LOD, zoals vermeld in het handboek voor deze mutatie. mogelijk is, beoordeel dan elk geval afzonderlijk. Bespreek deze mededeling met uw laboratorium- of medisch directeur. BELANGRIJK: Stuur deze informatie door naar alle personen en afdelingen binnen uw organisatie die de hierboven aangegeven kits gebruiken. Als u niet de eindgebruiker bent, stuur deze mededeling dan door naar de eindgebruiker van het product. Handelspartners moeten deze mededeling doorsturen naar hun klanten. Voer het getroffen product af in overeenstemming met uw nationaal en plaatselijk geldende veiligheidsen milieubepalingen. Vul de aan deze brief gehechte Bevestiging van ontvangst in. Handelspartners: o o o Staak de distrubutie van de productien die in deze mededeling staan vermeld Stuur deze medeling door aan uw klanten Ga na of uw klanten de ontvangst hebben bevestigd Invullen van de Bevestiging van ontvangst Om te garanderen dat alle getroffen gebruikers op de hoogte zijn gesteld, en in overeenstemming met de toepasselijke nationale wettelijke voorschriften, zijn wij verplicht om de autoriteiten bewijs te leveren van het in kennis stellen van de markt. Stuur daarom de bijgesloten 'Bevestiging van ontvangst' vóór 29 januari 2018 ingevuld en ondertekend per terug aan: quality.communications@qiagen.com. Acties ondernomen door QIAGEN De restererende voorraad van het getroffen materiaal in alle opslagplaatsen van Qiagen is geblokkeerd. Als onmiddellijke corrigerende actie is er voor alle partijen van PyroMark Gold-reagentia een exta test voor de kwaliteitscontrole aan toegevoegd. Er wordt op dit moment onderzoek gedaan naar de hoofdoorzaak van het probleem. 4

5 Wij bieden u onze welgemeende excuses aan voor het eventuele ongemak dat dit alles zou kunnen veroorzaken, en wij danken u bij voorbaat voor uw begrip en uw hulp. Mocht u vragen hebben, neem dan contact op met uw plaatselijke afdeling technische services van QIAGEN. Kijk op de volgende webpagina's voor de contactinformatie: QIAGEN dochtermaatschappijen: QIAGEN handelspartners en importeurs Met vriendelijke groet, QIAGEN 5

6 Dringende veiligheidsmededeling omtrent: therascreen KRAS Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen BRAF Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen EGFR Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen GIST RapidScreen Pyro-kit (REF ), therascreen NRAS Pyro-kit (24) CE (REF ), therascreen RAS Extension Pyro-kit (REF ), PyroMark Gold Q24-reagentia (5 x 24) CE (REF ) Bevestiging van ontvangst (Formulier invullen met blokletters en aangeven met een 'X' dat u elke instructie hebt gevolgd) Wij hebben de in deze mededeling voorgestelde vereiste acties ondernomen: Wij hebben de resterende voorraden van de betrokken partijen niet gebruikt. Als we een partij met het betrokken nummer hebben gebruikt, dan hebben we de bijbehorende resultaten opnieuw bekeken. We hebben een hertest overwogen van samples met een A59T-mutatie waarvan de mutatiefrequentie lager was dan 15%. Wij hebben deze mededeling besproken met onze laboratorium-/medisch directeur. Deze informatie is doorgestuurd naar alle personen en afdelingen binnen onze organisatie die deze producten gebruiken. We hebben het getroffen product afgevoerd in overeenstemming met de nationaal en plaatselijk geldende veiligheids- en milieubepalingen. Handelspartners: we zijn gestopt met de distributie van de betrokken producten. Deze informatie is doorgestuurd naar onze klanten/partners. We zijn nagegaan of onze klanten de ontvangst hebben bevestigd. Naam laboratorium: Adres: Naam contactpersoon: Titel: adres: Telefoonnummer: Handtekening: Datum: 6