Wenst u ook een respiratoir panel, collega? Katrien Lagrou
Multiplex PCR versus panel Multiplex Panel Pathogeen A Pathogeen B Pathogeen C Pathogeen D 12 PCR reacties waarin telkens 2-3 pathogenen worden opgespoord
Respiratoire panels: heel wat keuze Commercieel FilmArray Respiratory panel (biomérieux) FilmArray Respiratory panel EZ (biomérieux) Respiratory TaqMan array card (Thermo Fisher Scientific) eplex Respiratory Pathogen Panel (GenMark) Verigene Respiratory Pathogens Flex test (Luminex) NxTAG Respiratory Pathogen Panel (Luminex)... Lab-ontwikkeld Gedetecteerde pathogenen Expertise om zelf testen te ontwikkelen beschikbaar Enkel kwalitatief resultaat versus semi-kwantitatief Black box versus inspectie amplificatiecurve mogelijk Benodigde apparatuur Hands-on-time Turn-around-time Kostprijs Te overwegen aspecten
Respiratoir panel UZ Leuven VIRUSSEN BACTERIEN FUNGI Influenza A & B RSV A & B hmpv A & B Parainfluenzavirus 1-4 Adenovirus Enterovirus Cytomegalovirus Parechovirus Coronavirus NL63, 229E, OC43, HKU-1, SARS en MERS Herpes simplex virus 1 & 2 Bocavirus Rhinovirus Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila pneumoniae Chlamydophila psittaci Streptococcus pneumoniae Legionella pneumophila Coxiella burnetti Pneumocystis jirovecii Rood: therapie beschikbaar
Immuungecompromitteerde patiënten: menginfecties!
CAP: een brede waaier aan co-gedetecteerde pathogenen Pathogenen gedetecteerd in 2222 kinderen uit de V.S. met radiologische evidentie voor community acquired pneumonie waarvoor hospitalisatie Multicenter (Memphis, Nashville, Salt Lake City), EPIC studie = Etiology of Pneumonia in the Community) Prospectief, populatie-gebaseerd Jan 2010- juni 2012 Uitgebreide microbiologische diagnostiek (cultuur, PCR, serologie) Exclusie van recent gehospitaliseerde of ernstig immuungecompromitteerde kinderen S. Jain et al. N Engl J Med. 2015;372:835-45
CAP: een brede waaier aan co-gedetecteerde pathogenen Lage prevalentie bacteriële pathogenen reflecteert waarschijnlijk de effectiviteit van bacteriële conjugaat vaccins alsook de relatieve ongevoeligheid van diagnostische testen. Donkere kleur: detectie van deze enkele pathogeen AdV adenovirus, CoV coronavirus, Flu influenza A or B virus, HMPV human metapneumovirus, HRV human rhinovirus, PIV parainfluenza virus, and RSV respiratory syncytial virus S. Jain et al. N Engl J Med. 2015;372:835-45
The burden of community-acquired pneumonia in children was associated with multiple different and co-detected pathogens, underscoring a need for the enhancement of sensitive, inexpensive, and rapid diagnostic tests to accurately identify pneumonia pathogens. Respiratoir panel S. Jain et al. N Engl J Med. 2015;372:835-45
Impact van multipele virale respiratoire infecties op uitkomst bij kritische zieke kinderen DESIGN EN METHODEN Retrospectief, single-center (tertiair kinderziekenhuis, Nemours Alfred I. dupont Hospital for Children, Wilmington, DE, US) cohort studie Jan 2012- maart 2015 Kinderen < 5 jaar, opgenomen op de PICU met respiratoir falen en een positief respiratoir moleculair panel Exclusie indien majeure comorbiditeit of geschiedenis van gelijkaardige infecties Vergelijking uitkomst infectie door één virus meerdere virussen Inclusie van 477 kinderen: Detectie van 1 virus: 432 kinderen (90,5%) (= groep 1) Detectie van meerdere virussen: 45 kinderen (9,5%) (= groep 2) Groep 1 (n = 432) Groep 2 (n = 45) Leeftijd (maand) 8 7 0,33 Vrouwelijk % 50 38 0,11 Duur PICU verblijf (dagen) 3 4,5 0,002 p J.C. Chauhan et N.B. Slamon. Pediatr Crit Care Med 2017; 18:e333-e338.
Impact van multipele virale respiratoire infecties op uitkomst bij kritische zieke kinderen J.C. Chauhan et N.B. Slamon. Pediatr Crit Care Med 2017; 18:e333-e338.
Impact van multipele virale respiratoire infecties op uitkomst bij kritische zieke kinderen Multi-virale infecties zijn geassocieerd met langer PICU verblijf, langdurige mechanische ventilatie, bacteriële lage luchtweginfecties en de noodzaak tot een centrale lijn. J.C. Chauhan et N.B. Slamon. Pediatr Crit Care Med 2017; 18:e333-e338.
Impact respiratoir panel DESIGN EN METHODEN Retrospectief, single-center, tertiair ziekenhuis (New York-Presbyterian Morgan Stanley Children s hospital), cohort studie Juni 2010-juni 2012: non-mpcr groep versus okt 2012-mei 2014 mpcr groep (Film Array Respiratory Panel) Kinderen < 18j (exclusie neonaten) Testing voor respiratoir pathogeen op spoedgevallen of binnen de eerste 2 dagen van opname 4779 patiënten geïncludeerd: 2349 non-mpcr versus 2430 mpcr mpcr groep: ouder, meer complexe chronische condities of opname in de PICU A. Subramony et al. J Pediatr. 2016;173:196-201
Impact multiplex PCR respiratoire pathogenen A. Subramony et al. J Pediatr 2016;173:196-201
Aangevraagde testen UZ Leuven (2017-2018): de cijfers spreken voor zich. Aantal uitgevoerde testen bij patiënten 16 jaar Respiratoir panel 1997 (83%) Mycoplasma pneumoniae 143 (6%) Influenza 219 (9%) RSV 43 (2%) Aantal uitgevoerde testen bij patiënten > 16 jaar Respiratoir panel 4753 (50%) Mycoplasma pneumoniae 167 (2%) Influenza 4501 (48%) RSV 37 (<1%) Respiratoir panel: Kostprijs: 75 euro (indien < 10 PCR testen/jaar) Mediane TAT: 21 uur Influenza + RSV: Vanaf okt 2018 Kostprijs: 20 euro Mediane TAT: 6 uur Vóór okt 2018: Kostprijs: influenza (35 euro), RSV/hMPV (35 euro) Vanaf 1 april 2019: respiratoir panel via RIZIV vergoed voor orgaantransplant patiënten
Respiratoir panel: enkele reflecties Verhoogt de kans tot detectie van verwekker(s) bij een pneumonie Belangrijk om epidemiologische gegevens te verzamelen Vereenvoudigt de workflow in het klinisch lab Geeft een meer compleet beeld voor isolatiebeslissingen Vooral interessant bij heel ernstig zieke kinderen en immuungecompromitteerde kinderen MAAR: bovenste luchtwegstaal is niet geschikt voor detectie meeste bacteriële en fungale verwekkers panels detecteren niet noodzakelijk alle relevante pathogenen Klinische impact afhankelijk van turn-around-time en patiëntpopulatie