Laboratoria Stichting PAMM. Pathologie en Medische Microbiologie

Transcriptie

1 Laboratoria Stichting PAMM Pathologie en Medische Microbiologie

2 Na Lunchtijd

3 Na Lunchtijd

4 Locatie

5 Adherentie gebied van de PAMM voor medische microbiologie mensen Zuid-Oost Brabant Onderzoeken voor 4 ziekenhuizen, verzorgingstehuizen en 400 huisartsen, GGD, verloskundigen real-time PCR testen in 2012 MMC

6

7 Medische Microbiologie Bacteriën Schimmels Parasieten Virussen Antibiogram

8 Medische Microbiologie Supercoiled DNA Strand DNA Strand Double Helix DNA Strand Chromosome Medisch Microbiologisch Analist

9 Moleculaire Biologie SOA - pakket: Chlamydia trachomatis Neisseria gonorrhoeae Trichomonas vaginalis Mycoplasma genitalum Feces pakket: Salmonella Shigella Yersinia Campylobacter Giardia lamblia Cryptosporidium parvum/hominis Entamoeba histolytica Dientamoeba fragilis STEC Norovirus GI / GII Clostridium difficile (BD MAX TM ) Luchtweg pakket Bacterieel Chlamydophila pneumoniae Mycoplasma pneumoniae Legionella pneumophilla Chlamydophila psittaci Viraal Respiratory syncytial virus (RSV) Rhinovirus Influenza A / B / H1N1 Liquor - pakket Herpes simplex virus 1 / 2 Varicella zoster virus Enterovirus Parechovirus Overig Actinobaculum schaalii Coxiella burnetii Chlamydia trachomatis LGV Streptococcus pneumoniae Mycobacterium tuberculosis MTB typering MTB resistentie Bordetella pertussis Bordetella parapertussis PCP Dermatophyten ESBL (extended spectrum ß-lactamases) Carbapenemases MRSA VRE Hepatitis B (kwantitatief) Hepatitis C (kwantitatief/genotypering) CMV (kwantitatief) EBV (kwantitatief)

10 Laboratorium automatisering en de implementatie hiervan in de moleculaire diagnostiek; robottisering en middle-ware 1982

11 Automatisering moleculaire biologie past (1993) Boom extractie

12 Automatisering moleculaire biologie past (1993) Automatisering? Detectie van de amplicon m.b.v. E.I.A.

13 Automatisering moleculaire biologie past (1997) Commerciële testen SOA komen beschikbaar Echter nog vele handmatige pipetteerstappen

14 Automatisering moleculaire biologie past (1997) En vele administratieve handelingen

15 Automatisering moleculaire biologie past (1997) LIMS Schrijven van de werklijst Voorbehandeling van de materialen Pipetteren van de materialen in de easy-mag Handmatig invoeren van de laboratoriumnummer in de easy-mag Pipetteren van de mastermix Pipetteren van DNA uit de easy-mag Pipetteren van DNA bij mastermix Handmatig invoeren van de laboratoriumnummers in ABI 7500 fast Resultaten noteren op de werklijst Handmatig invoeren van de resultaten in LIMS Handmatig CQ waarden invoeren in excellijst voor Levy Jennings curves

16 Automatisering moleculaire biologie past (2010)

17 Automatisering moleculaire biologie past (2010) Sexueel Overdraagbare Aandoening Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae TOP 1: onderzoeken per jaar Geen pipetteerhandelingen bij SOA

18 Automatisering moleculaire biologie past (2010)?

19 Automatisering moleculaire biologie past (2010)

20 Automatisering moleculaire biologie past (2010)

21 Huidige werkwijze CT/NG/TV Aanvraag Neg resultaat Pos resultaat

22 Automatisering moleculaire biologie past (2012) Verder terugdringen van handmatige pipetteerhandelingenbij met name feces PCR Installatie pipetteerrobot EVO 150, firma TECAN Validatie op een 5-tal criteria 48 van de 50 monsters minimaal 190 ul pipetteren (vettige laag) nauwkeurigheid/reproduceerbaarheid; 12 dispense stappen 10 ul en gepipetteerde vloeistof wegen CQ waarde 75 pos en 25 neg monsters vergelijken handmatig / robot Controle contaminatie 48 pos en 48 neg schaakbord-model Twee weken alle fecesmonsters huidige manier en met EVO 150; 100% correlatie

23 Automatisering moleculaire biologie past (2012)

24 Opstelling materialen in de EVO150 Patiëntenmateriaal Easy-mag bootjes Patiëntenmateriaal na ophopingskweek

25 Opstelling materialen in de EVO150 ABI platen, pcr setup Mastermix Geëxtraheerd patiëntenmateriaal (DNA/RNA)

26 Prolongatie EVO150

27 Evaluatie EVO150

28 Huidige werkwijze feces PCR Aanvraag Neg resultaat Pos resultaat

29 Automatisering moleculaire biologie

30 Automatisering moleculaire biologie We think, we re on the right track!

31 Track and Trace Materiaal arriveert bij AKL Materiaal arriveert Med. Micro. Materiaal op desbetreffende afd.

32 Automatisering moleculaire biologie toekomst BD-Max, firma Becton-Dickinson één apparaat waarin extractie, amplificatie en detectie plaatsvindt NGS, Next Generation Sequencing Ziekenhuisuitbraken met resistentie bacteriën Typeren Stroomlijnen van alle data en gegevens

33 Bedankt voor jullie aandacht!