EMBASE: Vergelijking met PubMed & zoekstrategie NELE PAUWELS I N F O R M AT I E D E S K U N D I G E K C G G N E L E. PA U W E L S @ U G E N T. B E 0 9 / 3 3 2. 2 4. 4 3 1
Kenniscentrum voor de Gezondheidszorg Gent (KCGG) Bibliotheek voor het UZ en de faculteiten Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen en Farmaceutische Wetenschappen Kerntaken o Toegang tot kennis faciliteren o Kennis up-to-date houden o Informatievaardigheden verder ontwikkelen en up-to-date houden o Mogelijkheid tot netwerking creëren o Verhogen van de visibiliteit o Datamanagement optimaliseren o Informatie verlenen 2
Inhoud Toegang tot Embase Quick search in Embase Wat kan er fout gaan bij het zoeken in Embase? Embase versus PubMed/MEDLINE Coverage en focus van Embase Waarom zoeken in Embase én PubMed/MEDLINE Indexering in Embase Zoeken in Embase Tips & Tricks om specifieker te zoeken Tips & Tricks om een zoekstrategie voor een systematische review op stellen Appendix: bijkomende uitgewerkte voorbeelden 3
TOEGANG TOT EMBASE 4
KCGG portaal www.kcgg.be Embase is toegankelijk via het UGent/UZ Gent netwerk Extern: via Athena 5
Online ondersteuning Informatiefiche van KCGG Help sectie op Embase.com website Opleidingen http://www.kcgg.ugent.be/events/embase 6
QUICK SEARCH IN EMBASE 7
8
Quick search Autocomplete Suggestie Emtree term 9
Quick Search - Resultaat => emtree en free text 10
Is de vertaling van de zoekopdracht door de databank wenselijk? Ter informatie: heart attack /exp = heart infarction /exp (= de indexterm = emtree term) PubMed! 11
ZOEKEN IN EMBASE: WAT KAN ER FOUT GAAN? 12
Wat kan er fout gaan bij het zoeken? Zoekopdracht: Aids Vertaling Embase: 'aids'/exp OR aids De resultaten bevatten ook artikels over visual aids, navigational aids, diabetes aids, aids for people with disabilities Voorbeeld: 13
Wat kan er fout gaan bij het zoeken? Zoekopdracht: Parkinson Vertaling Embase: parkinson De resultaten bevatten ook > 4000 artikels met Dhr/Mevr. Parkinson als (co-)auteur Voorbeeld: 14
Wat kan er fout gaan bij het zoeken? Zoekopdracht: chronic disease /exp OR chronic disease AND quality of life /exp OR quality of life De resultaten bevatten ook artikels met chronic disease in naam instituut Voorbeeld: zie volgende slide 15
Wat kan er fout gaan bij het zoeken? Zoekopdracht: chronic disease /exp OR chronic disease AND quality of life De resultaten bevatten ook artikels met chronic disease in naam instituut Voorbeeld: 16
Workshop (1.1 1.2)
EMBASE VERSUS PUBMED/MEDLINE 18
Embase versus PubMed/MEDLINE Embase PubMed/MEDLINE Eigenaar ELSEVIER (uitgeverij) National Library of Medicine (US) Inhoud wetenschappelijke artikels; conference proceedings (vanaf 2009); articles in press Troeven - Bevat meer Europese en farmacologische referenties dan PubMed/MEDLINE - Indexering (gebeurt snel en op 3 niveaus) - Focus op de medicatie en apparatuur Unieke records (Embase vs. PubMed/MEDLINE) Indexering/Thesaurus Ja Emtree (> termen dan MeSH) - 3x/jaar geactualiseerd wetenschappelijke artikels; articles in press; e-boeken - Abstracten zijn gratis te lezen voor iedereen - Indexering op 2 niveaus - Focus op de pathologie Ja MeSH jaarlijks geactualiseerd Filteropties Tijdens en na je search (slimme filters) Tijdens en na je search Export naar bijv. EndNote Ja Ja E-mail alerting/rss Feed Ja Ja Ondersteunende tools voor opbouw zoekstrategie Intern: PICO search builder Extern: GoPubMed ; PubReMiner ; MeSHonDemand 19
Coverage en focus van Embase 85.000 tijdschriften 30 miljoen records > 5000 records worden dagelijks toegevoegd 20
Waarom zoeken in Embase én PubMed/MEDLINE? Indexering is uniek Iedere databank bevat unieke records Bijv. bepaalde artikelen en tijdschriften (nl. meer dan 6 miljoen referenties in meer dan 2900 tijdschriften) zijn niet in MEDLINE opgenomen, dus kan je uitsluitend via Embase consulteren. Bijv. de meest recente artikelen in PubMed/MEDLINE zijn nog niet van MeSH trefwoorden voorzien, en vind je dus uitsluitend via PubMed/MEDLINE terug. Embase (uniek) MEDLINE PubMed (niet geïndexeerd) Via embase.com Via PubMed.gov 21
22
Je kan via de filter Sources kiezen voor om uitsluitend de unieke records in Embase te zien 23
INDEXERING IN EMBASE 24
Indexering in Embase Manuele indexering Door indexers met een biomedische achtergrond (op basis van de full tekst) Duurt gemiddeld 5 dagen Voor full articles (Major) focus (Key) subheadings Triple linkage Automatische indexering Onmiddellijk Voor Conference Proceedings (permanente indexering) en voor articles in press en articles in process (tijdelijke indexering) Voordeel: Emtree termen gebruiken verhoogt de sensitiviteit van je zoekstrategie. De publicaties komen met andere woorden in je zoekresultaten voor, ongeacht de terminologie die de auteurs gebruikt hebben. 25
26
27
ivadantin furadantin furolin furolin 3 resultaten 528 resultaten 2 resultaten 28 Op 22/2/2017
Embase versus PubMed EMBASE Elsevier (uitgeverij) Publicatie PubMed/MEDLINE National Library of Medicine Indexering - Emtree / Major Focus - Subheadings - Triple linkage Indexering - MeSH / Major Topic - Subheadings 29
Gele markering = termen uit je zoekopdracht Groene markering = termen t.g.v. exploderen van Emtree termen 30
Indexering in Embase: voorbeeld 31
Workshop (2.1 2.5)
ZOEKEN IN EMBASE: ALGEMENE TIPS & TRICKS 33
Zoektips in Embase - Booleaanse operatoren: AND, OR en NOT (AND is de default setting) - Truncatie operatoren:? (exact 1 karakter); * (meerdere karakters) Voorbeeld: heart attack* ; sul*ur (sulfur, sulphur) - Proximity operatoren: NEXT/n (exacte volgorde); NEAR/n (volgorde vrij te bepalen) Voorbeeld: Hip NEXT/3 prosthesis => rheumatoid arthritis, joint surgery, hip or knee prosthesis Voorbeeld: Cardiac NEAR/5 catheter => patients undergoing catheter ablation for cardiac arrhythmias - Phrase searching: enkele aanhalingstekens Voorbeeld heart failure - Gericht zoeken, zodanig zoektermen uitsluitend in titel, abstract en/of author keywords mogen voorkomen Voorbeeld 'heart failure':ti,ab,kw (via Fields) - Combinaties Voorbeeld: (symptom* NEAR/5 (headache* OR head ache* )):ti,ab,kw 34
ZOEKEN IN EMBASE: TIPS & TRICKS MET FOCUS OP SPECIFICITEIT OF SENSITIVITEIT 35
Wide search = sensitieve zoekopdracht + je kan een significant deel van de relevante literatuur vinden - Je zal ook veel irrelevante referenties hebben Narrow search = specifieke zoekopdracht + resultaten zijn gerichter - Je zal relevante literatuur missen 36
Focus op specificiteit 37
Voorbeeld zoekstrategie met focus op specificiteit Onderzoeksvraag: is bewegingstherapie effect bij de behandeling van osteoartritis van de heup? kinesiotherapy /de AND hip osteoarthritis /exp/dm_rh,dm_th Indextermen Subheadings (disease subheadings: rehabilitation & therapy) 38
indexering Specificiteit van je zoekopdracht - Emtree term niet exploderen (syntax /de ) - Gebruik van subheadings - Emtree term: major focus Concept Drug Drug Key subheading Adverse drug reaction Drug combination - Gebruik van Triple linking (uitsluitend bij key subheadings) Drug Drug Drug comparison Drug interaction - Veldcodes toevoegen aan de vrije tekstwoorden (bijv. uitsluitend zoeken in titel, abstract en author keywords) - Limieten toepassen (bijv. species, age groups, gender, article language, date of publication, enz.) Drug Device Device Disease Disease Drug therapy Adverse device effect Device comparison Drug therapy Side effect 39
Zoekvraag: Informatie omtrent de nevenwerking van bepaald medicijn eg. incidentie niertoxiciteit van cisplatine Zoekstrategie 1. Start in Emtree (Browse > Emtree) 2. Add to Query Builder OF ga naar Drug Search om Drug-specifieke subheadings toe te voegen 40
Subheadings na de zoekopdracht toevoegen 41
Subheadings vooraf aan de zoekopdracht toevoegen Drug, Disease en Device search: assisteren gebruikers om specifiek te zoeken naar bepaald aspect van medicijn, ziekte en apparaat dankzij toevoegen van subheadings Article search & Authors search Single Citation Matcher in PubMed 42
Major focus Specificiteit 43
Triple linking = 3 concepten aan elkaar gekoppeld nl (1) term (drug of device of disease), (2) key subheading (relationship) en (3) linked term (drug of disease) - Gestart voor drugs in 2007, voor diseases in 2009 en devices in 2014 Cisplatin Adverse drug reaction Nephrotoxicity - Syntax: 'cisplatin'/'adverse drug reaction'/ nephrotoxicity Referenties die nephrotoxiciteit áls bijwerking van ciplatine beschrijven! 44
Triple linking 45
Veldcodes toevoegen aan vrije tekstwoorden Specificiteit 46
Filteropties 47
Similar records: minstens 2 major termen zijn gemeenschappelijk. Tot max 100 similar records worden getoond. Deze worden gesorteerd op basis van aantal overeenkomstige major termen Index miner: inspiratietool voor indextermen (op basis van de zoekresultaten) Filter opties 48
Workshop (3.1 3.6)
Focus op sensitiviteit (bijv. systematische review) 50
Voorbeeld zoekstrategie met focus op sensitiviteit Onderzoeksvraag: is bewegingstherapie effect bij de behandeling van osteoartritis van de heup? hip osteoarthritis /exp OR ((arthritis/de OR osteoarthritis/de) AND (hip/de OR hip pain /exp)) OR ((( hip OR cox ) NEAR/2 (arthros* OR arthrit* OR artheros* OR osteoarthr*)) OR coxarth* OR malum coxae senilis ):ab,ti AND kinesiotherapy /exp OR exercise/exp OR physiotherapy/exp OR conservative treatment /de OR (((movement* OR motion OR manual OR phys* OR conservative* OR nonoperat* OR nonsurg* OR non-operative OR non-surgical OR paramedic* OR para-medical OR exercise) NEAR/5 (technique* OR therap* OR treat* OR isokinet* OR isomet* OR management*)) OR kinesitherap* OR kinesiotherapy* OR gymnastic* OR ((muscle* OR muscul*) NEAR/3 train*)):ab,ti Indextermen Vrij tekstwoorden (in titel en abstract) 51
Sensitiviteit van je zoekopdracht - Emtree termen exploderen (syntax /exp ) - Synoniemen onder de vorm van vrije tekstwoorden opnemen in je zoekstrategie Zie ook PICO search en PV Wizard 52
Start! 53
Sensitiviteit 54
Overzicht zoekmodaliteiten in Embase PICO & PV (Pharmacovigilance) wizard: assisteren gebruikers bij opbouw sensitieve zoekstrategie dankzij toevoegen van synoniemen 55
Workshop (4.1)
Contact Kenniscentrum voor de Gezondheidszorg Gent (KCGG) Campus UZ - K3 gelijkvloers (ingang 42) 09/332.22.91 (balie) kcgg@ugent.be Nele Pauwels 09/332.24.43 nele.pauwels@ugent.be 57
Bijkomende uitgewerkte voorbeelden Appendix 58
Zoekstrategie in Embase (focus op specificiteit) Informatie omtrent dosering van geneesmiddelen bijvoorbeeld amoxicilline-clavulaanzuur bij intermittente hemodialyse patiënten 59
60
+ aandoening 61
+ emtree term en/of vrij tekstwoord 62
Emtree-tak! 63
Zoekopdracht verder op punt stellen nl. verbreden of verfijnen afhankelijk van de doelstelling, de vraag, de tijd, enz. (cf. sensitiviteit en specificiteit) 64
Zoekstrategie in Embase (focus op specificiteit) Informatie omtrent het gebruik van geneesmiddelen bijvoorbeeld het gebruik van antibiotica bij prostatitis 65
66
Zoekstrategie in Embase (focus op sensitiviteit) Informatie omtrent het gebruik van een lidocaïne-gel bij een scheurwond bij kinderen 67
Voorbeeld 2 68
Zoekstrategie in Embase (focus op sensitiviteit) Evidentie omtrent gebruik van een bepaald medicijn in welbepaalde indicatie bijvoorbeeld Spiriva Respimat tov handihaler bij COPD 69
PICO search = add to query = add all occurences 70
Klik om toe te voegen Aanpassing is mogelijk per synoniem 71
72
Zoekstrategie in Embase (focus op sensitiviteit) Evidentie omtrent de behandeling van kinderen met streptokokkenfaryngitis 73
Andere vormen van vragen (dan PICO) zijn ook mogelijk. Een AND relatie wordt toegepast tussen de 4 concepten (in dit geval van PICO) 74
Bijv. Analytical equipment of culture medium 75