Agrobacterium, niet elke wortel even gek?! Lien Bosmans 20/10/2015

Transcriptie

1 1 Agrobacterium, niet elke wortel even gek?! Lien Bosmans 20/10/2015

2 2 Wat ziet de tuinder? Plant Uitbundig groeiende planten Zeer vegetatief Veel blad Onderaan sterk verdikte stam Vrucht Tomaat: kniktrossen, fijnere vruchten Aubergine: bloemabortie, problemen met vruchtzetting

3 3 Wat ziet de tuinder? Wortels Overvloedige wortelgroei: begint in de buurt van de druppelaar Zeer fijn vertakte wortels Soms een paar dikke wortels Substraatblokken overgroeid met wortels Matten zwellen op

4 Agrobacterium rhizogenes Plantwortel Ri-plasmide met T-DNA

5 Agrobacterium rhizogenes Plantencel Ri-plasmide met T-DNA Overmatige wortelgroei

6 6 Wortels Wat zijn de problemen? Water loopt over de potten af + Verstikken van de wortels wortelsterfte Productieverlies: Tomaat: 5 à 10% Aantasting: gaat van 1% tot 100% Probleem breidt uit!

7 7 Wat zijn de problemen? Percentage van aangetaste bedrijven *Nederlandse telers die aanleveren op Belgische veilingen

8 8 Het onderzoek- genotypering Weinig geweten over Agrobacterium, diversiteit, verspreiding, Genotypering

9 Het onderzoek- genotypering Einstein Agrobacterium 15 mei

10 Het onderzoek- genotypering Albert Einstein Agrobacterium biovar 1 Genogroup X 15 mei

11 Agrobacterium Biovar 1: 9 verschillende soorten Agrobacterium tumefaciens species complex Agrobacterium tumefaciens species complex Incl. Vlaamse isolaten Agrobacterium Biovar 2: Rhizobium rhizogenes

12 Rhizogene Agrobacterium Agrobacterium Biovar 1: 9 verschillende soorten Agrobacterium tumefaciens species complex Agrobacterium tumefaciens species complex Incl. Vlaamse isolaten Agrobacterium Biovar 2: Rhizobium rhizogenes

13 Rhizogene Agrobacterium beter aangepast aan de omstandigheden in hydrocultuursystemen Agrobacterium tumefaciens species complex Incl. Vlaamse isolaten Vlaamse telers: allemaal in biovar 1 Agrobacterium Biovar 2: Rhizobium rhizogenes

14 Veel variatie binnen groep: Genotypering (op basis van DNA): Niet elke Agrobacterium is even gek (op basis van DNA)! Agrobacterium tumefaciens species complex Incl. Vlaamse isolaten

15 Veel variatie binnen groep: Genotypering (op basis van DNA): Niet elke Agrobacterium is even gek (op basis van DNA)! Agrobacterium tumefaciens species complex Incl. Vlaamse isolaten

16 Het onderzoek- fenotypering Fenotypering Temperatuur: 4 C/ 28 C/ 44 C Biofilmvormend vermogen: ja/neen Swarming: ja/neen Katalase + of - 16

17 Het onderzoek- fenotypering Vertoont elk isolaat eenzelfde schadebeeld? Proef PCH 10 isolaten werden artificieel toegediend Wekelijkse opvolging wortel- en gewassymptomen

18 Gecumuleerde wortelscore 18 Het onderzoek- fenotypering Verschillen in ernst van infectie Fenotypering (op basis van eigenschappen): Niet elke Agrobacterium is even gek Weeknummer Cumulatief effect op 12 planten Afhankelijk van isolaat: verschil in ernst infectie

19 19 Teelttechnisch Het onderzoek- beheersing Chemisch Biologisch

20 Het onderzoek- beheersing; chemisch 1) Pilootopstelling labo Chemische beheersing Tijdens de teelt Tijdens de teeltwissel Efficiëntie nagaan van: Waterstofperoxide Chloor ECA water!! bron van infectie = biofilm waaruit Agrobacterium vrijkomt die het gietwater besmet 20

21 Het onderzoek- beheersing; chemisch 1) Pilootopstelling labo

22 Bestrijding biofilms: beste methode is Isolaat afhankelijk

23 23 Het onderzoek- beheersing; chemisch 2) Monitoring op praktijkbedrijven

24 24 Het onderzoek- beheersing; chemisch 2) Monitoring op praktijkbedrijven (dosering 60 ppm ingesteld) eerste druppelbeurt derde druppelbeurt vijfde druppelbeurt

25 Het onderzoek- beheersing; chemisch 2) Monitoring op praktijkbedrijven (dosering 60 ppm ingesteld) eerste druppelbeurt derde druppelbeurt vijfde druppelbeurt Vijf druppelbeurten nodig voordat gewenste concentratie overal bereikt wordt Klein verschil tussen begin en einde leiding blijft bestaan na vijfde druppelbeurt 25

26 26 Het onderzoek- beheersing; chemisch 2) Monitoring op praktijkbedrijven % Aantasting Peroxide 24/03/ /04/2015

27 Het onderzoek- beheersing; chemisch 3) Tips Beheersing via chemische ontsmetting tijdens de teelt Eerst spoelen dan ontsmetten Continu gebeuren: van eerste tot laatste dag Homogene concentratie nastreven Beheersing via chemische ontsmetting tijdens de teeltwissel Voorzie voldoende tijd Opletten voor chemische reacties bij combinatie van producten Lange inwerkingsduur heeft voorkeur: effect = concentratie x tijd Volledig systeem ontsmetten Irrigatiesysteem regelmatig op druk brengen (opletten voor verstoppingen) 27

28 28 Het onderzoek- beheersing; biologisch Onderzoek staat gepland in 2016!

29 29 Agrobacterium, niet elke wortel is dus even gek! Bedankt voor je aandacht! KU Leuven: Lien Bosmans