Voor een uitdagend en weinig onderzocht doelwit zoals DXS, bleek de strategie om meerdere hit-identificatie en optimalisatie strategieën in parallel
|
|
- Peter ten Hart
- 8 jaren geleden
- Aantal bezoeken:
Transcriptie
1 Samenvatting
2 Belangrijke pathogenen zoals Mycobacterium tuberculosis en Plasmodium falciparum, de ziekteverwekkers van respectievelijk tuberculose en malaria, maken gebruik van de 2-Cmethyl-D-erythritol 4-fosfaat (MEP) route voor de biosynthese van isopentenyl difosfaat (IDP) en dimethylallyl difosfaat (DMADP), universele bouwstenen van isoprenoïden. Aangezien mensen uitsluitend de alternatieve mevalonaat route benutten voor de synthese van IDP en DMADP, in combinatie met het feit dat de MEP route onmisbaar is voor veel organismen, maakt dat de enzymen van de MEP route aantrekkelijke doelwitten zijn voor de ontwikkeling van ontstekingsremmende medicijnen. De ontwikkeling van verschillende multi- en superresistente stammen van M. tuberculosis en P. falciparum in het bijzonder, maakt dat er een groeiende noodzaak is voor het ontwikkelen van nieuwe ontstekingsremmers met een nieuw werkingsmechanisme. Bovendien, aangezien planten ook gebruik maken van de MEP route om de bouwstenen van isoprenoïden te synthetiseren, zijn de enzymen van deze route ook interessante doelwitten voor de ontwikkeling van onkruidverdelgers. In hoofdstuk 1 van dit proefschrift geven we een overzicht van de meest actieve remmers die gepubliceerd zijn voor elk enzym van de MEP route en bediscussieren we het biologische doelwit van dit proefschrift, 1-deoxy-D-xylulose 5-fosfaat synthase (DXS), in detail. DXS katalyseert de eerste en snelheidsbepalende stap van de MEP route, waarbij thiamine difosfaat (TDP) als cofactor wordt gebruikt. Het feit dat DXS zowel bij de biosynthese van het microbiële thiamine (vitamine B1), als bij de vitamine-b6 biosynthese betrokken is, maakt het een bijzonder interessant doelwit, aangezien op deze manier drie cruciale biosynthetische routes tegelijkertijd verhinderd kunnen worden. De twee kristalstructuren van DXS in een complex met TDP die beschikbaar zijn in de Protein Data Bank, zijn niet afkomstig van pathogene organismen, wat de ontwikkeling van remmers voor dit enzym een uitdaging maakt. Dit heeft tot resultaat dat er maar weinig voorbeelden van remmers voor DXS in de literatuur gepubliceerd zijn. In dit proefschrift presenteren we meerdere hit-identificatie strategieën gericht op de ontwikkeling van remmers voor DXS, hierbij gebruik makend van computationele studies en biofysische methoden. In hoofdstuk 2 beschrijven we de eerste toepassing van een innovatieve NMR methodologie op een fragmentgebaseerd ontwerp project. Allereerst hebben we de novo een serie fragmenten ontworpen, met als doel om in de TDP-bindingsholte van DXS te binden en de mogelijkheid om deze fragmenten in de richting van de substraat- en difosfaatholte te laten groeien. Hiervoor hebben we een driestaps NMR methodologie gebruikt, die ons in staat heeft gesteld om de bindingsmodus van de fragmenten in oplossing te valideren en de nieuwe fragment-optimisatiecyclus in te leiden, aangezien er geen betrouwbaar protocol voor eiwit kristallisatie beschikbaar was. 194
3 In hoofdstuk 3 passen we een simpele maar effectieve hit-identificatie methodologie, namelijk faagdisplay, toe om de eerste peptidische remmers voor DXS te ontwikkelen met laagmicromolaire activiteit tegen D. radiodurans DXS. We beschrijven tevens de identificatie van kernmotieven die verantwoordelijk zijn voor de activiteit van de remmers, en delen van de α-aminozuurvolgorde die verder aangepast kunnen worden om de activiteit van het peptide te verbeteren. Dit project opent de deur voor het toepassen van peptiden als potentiële ontstekingsremmers, wat vooral interessant is aangezien gedurende het afgelopen decennium het gebruik van peptiden als potentiële medicijnen steeds meer aangemoedigd en nagestreefd werd, met als resultaat dat een aantal van hen op de markt gebracht is. In hoofdstuk 4, onderzoeken we thiamine analoga als remmers voor D. radiodurans en M. tuberculosis DXS en rationaliseren we de opgemerkte verschillen in activiteit tussen de twee orthologen. Met behulp van geavanceerde docking experimenten hebben we een homologiemodel van M. tuberculosis DXS ontwikkeld en gevalideerd, dat gebruikt kan worden voor rationeel ontwerp van remmers van M. tuberculosis DXS in de afwezigheid van kristallografische informatie. Daarnaast hebben we onderzocht of suikers gebruikt kunnen worden ter vervanging van de difosfaat groep van TDP. In hoofdstuk 5, beschrijven we de ontwikkeling en het gebruik van een internetgebaseerde software genaamd TPPQuery, dat het mogelijk maakt om een farmacofoor zoektocht van anker-georiënteerde virtuele bibliotheken uit te voeren en tevens helpt om potentiële TDPcompetitieve remmers, die via multi-component reacties gesynthetiseerd kunnen worden, te identificeren. We bediscussiëren de vermeende bindingsmodi van een selectie van kernstructuren en hun synthese via de Zhu, Van Leusen en Groebke reacties. In hoofdstuk 6 demonstreren we de kracht van ligandgebaseerde virtuele screening (LBVS) als hit-identificatie methodologie, met name wanneer er zeer weinig structurele informatie beschikbaar is voor het doelwit. Uitgaand van de basisstructuren van enige fragmenten die we ontworpen en getest hebben in hoofdstuk 2, hebben we meerdere cycli van LVBS uitgevoerd om (een gedeelte van) de ZINC database te screenen. Hiermee hebben we remmers met laagmicromolaire activiteit tegen zowel D. radiodurans en M. tuberculosis DXS ontdekt, die goede activiteit vertonen tegen multi- en superresistente stammen van M. tuberculosis in celgebaseerde assays. Onze meest actieve remmers zijn tevens in hoge mate selectief voor DXS ten opzichte van pyruvaatdehydrogenase kinase, een TDP-afhankelijk zoogdier-enzym, en één van hen vertoont een zwakke activiteit tegen malariaparasieten, waarbij de parasitemie met ongeveer 20% werd gereduceerd in een celgebaseerd assay met P.falciparum 3D7. 195
4 Voor een uitdagend en weinig onderzocht doelwit zoals DXS, bleek de strategie om meerdere hit-identificatie en optimalisatie strategieën in parallel uit te voeren, zeer effectief. De meeste strategieën die we toegepast hebben, bleken elkaar zelfs goed aan te vullen. Bijvoorbeeld, de fragmenten die we de novo ontworpen hebben zoals gepresenteerd in hoofdstuk 2, zijn zwakke remmers van D.radiodurans DXS, maar dienen als referentie voor de LBVS campagne. De afwezigheid van (co)-kristallografische informatie wordt gezien als groot struikelblok voor een medicinale chemie project. Echter, we hebben laten zien dat deze barrière overwonnen kan worden, door bijvoorbeeld geavanceerde NMR technieken toe te passen, of door screening methoden te gebruiken waarvoor deze informatie niet noodzakelijk is, zoals faagdisplay. Het gebruik van structuurgebaseerde (SB) aanpakken (bijv. de novo ontwerp, SB-farmacofoor zoektochten) alleen is risicovol, vooral wanneer de enige beschikbare kristalstructuur die van een model enzym is. Desalniettemin, het gebruik van software zoals TPPQuery, heeft ons in staat gesteld om de TDP-holte te onderzoeken met ongehoorde en zeer diverse basisstructuren. Echter, de combinatie van SB- en LB-aanpakken maximaliseert de kans op succes en verkleint het risico dat geassocieerd is met onvoldoende structurele informatie. 196
5 197
6 198
Expanding the toolbox of protein-templated reactions for early drug discovery Unver, Muhammet
University of Groningen Expanding the toolbox of protein-templated reactions for early drug discovery Unver, Muhammet IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF)
Nadere informatieHoofdstuk 1 Hoofdstuk 2
Katalyse is een methode om op een snelle en selectieve manier chemicaliën te kunnen produceren. De introductie van katalyse binnen het vakgebied van de chemie was een mijlpaal voor de industriële productie
Nadere informatieThe Pd-Catalyzed Semihydrogenation of Alkynes to Z-Alkenes: Catalyst Systems and the Type of Active Species R.M. Drost
The Pd-Catalyzed Semihydrogenation of Alkynes to Z-Alkenes: Catalyst Systems and the Type of Active Species.M. Drost Samenvatting De Pd-Gekatalyseerde Z-Selectieve Semi-hydrogenering: Katalysatorsystemen
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/26922 holds various files of this Leiden University dissertation
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/26922 holds various files of this Leiden University dissertation Author: Shah, Dipen M. Title: NMR structural studies of protein-small molecule interactions
Nadere informatieDynamic combinatorial and protein-templated click chemistry in medicinal chemistry Mondal, Milon
Dynamic combinatorial and protein-templated click chemistry in medicinal chemistry Mondal, Milon IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite
Nadere informatieSamenvatting. Ontwerp en synthese van kleine liganden voor de door humaan cytomegalovirus gecodeerde receptor US28
Ontwerp en synthese van kleine liganden voor de door humaan cytomegalovirus gecodeerde receptor US28 Verschillende DA virussen, zoals herpesvirussen en pokkenvirussen, hebben chemokine receptoren van hun
Nadere informatieFiguur 1. Representatie van de dubbele helix en de structuren van de verschillende basen.
Het DNA molecuul is verantwoordelijk voor het opslaan van de genetische informatie die gebruikt wordt voor de ontwikkeling en het functioneren van levende organismen. Aangezien het de instructies voor
Nadere informatieSAMENVATTING 141 Aminozuren zijn bouwstenen voor de synthese van eiwitten die nodig zijn voor de groei van een organisme. De synthese van aminozuren kost energie dat wordt gewonnen uit de voedingstoffen
Nadere informatieChapter 9. Nederlandse samenvatting
Chapter 9 Nederlandse samenvatting Nederlandse samenvatting Nederlandse samenvatting Geschat wordt dat ongeveer 20-30% van de bevolking drager is van Staphylococcus aureus (S. aureus), een Gram-positief
Nadere informatieDe huidige wereldwijde dreiging van malaria, gecombineerd met de resistentieproblematiek en
VII.Samenvatting De huidige wereldwijde dreiging van malaria, gecombineerd met de resistentieproblematiek en de moeizame vordering in de ontwikkeling van een vaccin vormen een sterke motivatie voor de
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/18671 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Albers, Harald Title: Development of ATX and DUSP inhibitors : inhibiting phosphate
Nadere informatieNederlandse Samenvatting
Nederlandse Samenvatting Samenvatting De mogelijkheid om genen op een specifieke wijze te reguleren creëert diverse manieren om genfunctie te kunnen bestuderen of moduleren. Artificiële transcriptiefactoren
Nadere informatieVermeld op ieder antwoordvel je naam en studentnummer. Zie voor de structuren van de gebruikte co- factoren de bijgevoegde appendix
Tentamen iomoleculaire Chemie Vrijdag 3 juli 2015, 14:00-17:00 Vermeld op ieder antwoordvel je naam en studentnummer Zie voor de structuren van de gebruikte co- factoren de bijgevoegde appendix pgave 1
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/37023 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Wong, Chung Sing Title: The synthesis of mannose-derived bioconjugates and enzyme
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/29754 holds various files of this Leiden University dissertation
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/29754 holds various files of this Leiden University dissertation Author: Cao, Lu Title: Biological model representation and analysis Issue Date: 2014-11-20
Nadere informatieCitation for published version (APA): Fodran, P. (2015). Stereoselective synthesis of glycerol-based lipids [S.l.]: [S.n.]
University of Groningen Stereoselective synthesis of glycerol-based lipids Fodran, Peter IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from it.
Nadere informatieStructure-based design of ligands for vitamin transporters in bacteria Monjas Gómez, Leticia
University of Groningen Structure-based design of ligands for vitamin transporters in bacteria Monjas Gómez, Leticia IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF)
Nadere informatieSAMENVATTING. Tuberculose
SAMENVATTING Tuberculose Tuberculose (TBC) is een infectieziekte die veroorzaakt wordt door bacteriën van het Mycobacterium tuberculosis complex, waaronder M.tuberculosisde belangrijkste veroorzaker is
Nadere informatieFiguur 1 Een dobbelsteen en zijn spiegelbeeld, uitgeklapt om duidelijk weer te geven dat beide niet gelijk aan elkaar zijn.
SAMENVATTING In dit hoofdstuk is het werk dat in het proefschrift beschreven is samengevat en op een dusdanige manier verwoord dat het voor chemici in zijn algemeenheid te volgen is. Eerst worden de begrippen
Nadere informatieSamenvatting. nieuwe cyclische organofosfor-verbindingen: van ringen tot kooien
nieuwe cyclische organofosfor-verbindingen: van ringen tot kooien Het in dit proefschrift beschreven onderzoek was gericht op het vergroten van de toegang tot (multi)cyclische organofosfor verbindingen.
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/28508 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Peironcely Miguel, Julio Eduardo Title: Automated de novo metabolite identification
Nadere informatieDe kracht van een netwerk-gestuurde aanpak van medicijn-ontwikkeling en de interactie tussen metabolisme en gen-expressie in Trypanosoma brucei
Nederlandse samenvatting De kracht van een netwerk-gestuurde aanpak van medicijn-ontwikkeling en de interactie tussen metabolisme en gen-expressie in Trypanosoma brucei 244 Nederlandse samenvatting Voor
Nadere informatieNederlandse Samenvatting
149 150 Nederlandse Samenvatting Het immuunsysteem beschermt ons lichaam tegen de invasie van lichaamsvreemde eiwiten en schadelijke indringers, zoals bijvoorbeeld bacteriën. Celen die de bacteriën opruimen
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/18950 holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/18950 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Velthuis, Arend Jan Wouter te Title: A biochemical portrait of the nidovirus RNA
Nadere informatieNederlandse samenvatting
171 172 Nederlandse samenvatting NEDERLANDSE SAMENVATTING Met vaccinaties kunnen veel ziektes voorkomen worden, zoals de mazelen, de rode hond en de griep. Echter een vaccin voor het voorkomen van kanker
Nadere informatieNederlandse samenvatting. Inleiding
Nederlandse samenvatting 157 Inleiding Het immuunsysteem (afweersysteem) is een systeem in het lichaam dat werkt om infecties en ziekten af te weren. Het Latijnse woord immunis betekent vrijgesteld, een
Nadere informatieFlexibel gebruik van lab automatisering bij een dynamische voedselonderzoek bedrijf
Flexibel gebruik van lab automatisering bij een dynamische voedselonderzoek bedrijf Wednesday, April 10, 2013 Arno Wegkamp arno.wegkamp@nizo.com Project leader fermentation Overzicht presentatie Wie is
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/19980 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Khurshid, Muhammad Title: Functional analysis of ORA47, a key regulator of jasmonate
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/44797 holds various files of this Leiden University dissertation Author: Rongfang Liu Title: The activation mechanisms of G protein-coupled receptors :
Nadere informatieVitaminen. Definitie. Classificatie en functie
Vitaminen Definitie Vitaminen zijn essentiële organische voedingsstoffen, die in tegenstelling tot andere voedingsstoffen (koolhydraten, vetten, eiwitten) geen energie of bouwstoffen leveren, maar die
Nadere informatieNederlandse samenvatting
Nederlandse samenvatting Nederlandse samenvatting Het immuunsysteem Ons immuunsysteem beschermt ons tegen allerlei ziekteverwekkers, zoals bacteriën, parasieten en virussen, die ons lichaam binnen dringen.
Nadere informatieMetabolic engineering of Bacillus subtilis for terpenoids production Xue, Dan
University of Groningen Metabolic engineering of Bacillus subtilis for terpenoids production Xue, Dan IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to
Nadere informatieNederlandse samenvatting
Nederlandse samenvatting Samenvatting Agrobacterium tumefaciens is een Gram-negatieve bacterie, die van nature voorkomt in de grond. In dicotyle planten veroorzaakt hij een ziekte die zich uit in de vorming
Nadere informatieNederlandse samenvatting
Nederlandse samenvatting Het ontwikkelen van een nieuw geneesmiddel is een langdurig en kostbaar proces. Een belangrijke reden voor het stoppen van de ontwikkeling van een kandidaat-geneesmiddel is het
Nadere informatieAnalyseren van de stressreactie van de tuberculose bacterie om onderzoek naar nieuwe antibiotica te versnellen
Analyseren van de stressreactie van de tuberculose bacterie om onderzoek naar nieuwe antibiotica te versnellen Wat is tuberculose en waarom doen wij er onderzoek naar? Tuberculose (TBC) wordt veroorzaakt
Nadere informatieSAMENVATTING EN ALGEMENE DISCUSSIE
SAMENVATTING EN ALGEMENE DISCUSSIE In dit proefschrift is de activiteit van het Escherichia coli UvrA eiwit bestudeerd met zgn. single-molecule microscopie technieken, waarmee individuele eiwit-complexen
Nadere informatieSamenvatting De kleurverandering van bladeren is een van de opvallendste kenmerken van de herfst voordat ze afsterven en afvallen. Tijdens de herfst worden de bouwstoffen die aanwezig zijn in het blad
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/22286 holds various files of this Leiden University dissertation Author: Nezhinsky, A.E. Title: Pattern recognition in high-throughput zebrafish imaging
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/21918 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Xie, Bangwen Title: Optical imaging of cancer and cell death Issue Date: 2013-10-08
Nadere informatieVermeld op ieder antwoordvel je naam en studentnummer
ertentamen MC 15-08-2013 9:00 uur 12:00 uur Vermeld op ieder antwoordvel je naam en studentnummer pgave 1 D-Apiose is een typische suiker, die alleen in planten voorkomt. et wordt gesynthetiseerd vanuit
Nadere informatieDUTCH SUMMARY NEDERLANDSE SAMENVATTING
DUTCH SUMMARY NEDERLANDSE SAMENVATTING Dutch Summary / Nederlandse Samenvatting Sinds de ontdekking van de ADAM eiwitfamilie, twee decennia geleden, heeft het ADAM onderzoek zich voornamelijk gericht op
Nadere informatieAlgemene Samenvatting
Algemene Samenvatting e vitamine metaboliet 1,25-dihydroxyvitamine ( ) speelt een sleutelrol bij het handhaven van de calcium homeostase door middel van effecten op de darm, het bot en de nier. e metaboliet
Nadere informatieDirect Activation of Allylic Alcohols in Palladium Catalyzed Coupling Reactions Y. Gümrükçü
Direct Activation of Allylic Alcohols in Palladium Catalyzed Coupling eactions Y. Gümrükçü Alhoewel er de afgelopen jaren al geweldig veel gedaan is om de effecten van het menselijk handelen op het milieu
Nadere informatieSamenvatting. Het gebruik van ultrafiltratie (UF) membranen als oppervlakte water zuiveringstechnologie
Samenvatting Het gebruik van ultrafiltratie (UF) membranen als oppervlakte water zuiveringstechnologie is in de laatste vijftien jaar enorm toe genomen. Ultrafiltratie membranen zijn gemakkelijk op te
Nadere informatieNEDERLANDSE SAMENVATTING
NEDERLANDSE SAMENVATTING Analyse van chromosomale afwijkingen in gastrointestinale tumoren In het ontstaan van kanker spelen vele moleculaire processen een rol. Deze processen worden in gang gezet door
Nadere informatieSamenvatting CHAPTER9
Samenvatting CHAPTER9 Samenvatting Primaire hooggradige hersentumoren vormen een ernstig probleem voor zowel volwassenen als kinderen. Ondanks de multimodale behandeling van deze hersentumoren, bestaande
Nadere informatieNiet-technische samenvatting
Niet-technische samenvatting 2016403 1 Algemene gegevens 1.1 Titel van het project Geneesmiddelenontwikkeling voor malaria 1.2 Looptijd van het project 1-4-2016-1-4-2021 1.3 Trefwoorden (maximaal 5) malaria,
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/18977 holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/18977 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Filali, Mariam el Title: Knowledge-based treatment in uveal melanoma Date: 2012-05-22
Nadere informatieAssembleren van het DNA van organismen uit miljoenen korte fragmenten
Assembleren van het DNA van organismen uit miljoenen korte fragmenten Stap 1: chemisch proces 1. CGGTTC 2. ACGCGG 3. TTCCGG 4. CGGGCT 5. TCACGG 6. CGGACG. korte stukjes DNA TCA TTC CGG GCT ACG Stap 2:
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/20172 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Hogendorf, Wouter Frederik Johan Title: Synthetic methods to glycerol teichoic
Nadere informatieStudiehandleiding Biochemie I
Studiehandleiding Biochemie I 2006-2007 1 Proeftentamen Biochemie I 1. Vul de juiste term uit de lijst op de open plaatsen in onderstaande tekst in. Elke term mag maar éénmaal worden gebruikt maar niet
Nadere informatieInleiding. Chapter 11. Achtergrond en doel van het onderzoek
Chapter 11 Inleiding Achtergrond en doel van het onderzoek Kanker is na hart en vaatziekten de belangrijkste doodsoorzaak in Nederland. Per jaar wordt in Nederland bij ongeveer 70.000 mensen kanker vastgesteld
Nadere informatieNederlandse samenvatting
Nederlandse samenvatting De rol van proteïne kinase A in de vorming van galkanaaltjes door levercellen Een mens is opgebouwd uit cellen. Iedere cel is omgeven door een membraan die de inhoud van de cel
Nadere informatieSamenvatting Hoofdstuk 1 Hoofdstuk 2 NNOH2 NNOISQ NNO
Samenvatting Veel homogene en heterogene katalysatoren bevatten één of meerdere overgangsmetalen. De redenen hiervoor zijn de toegankelijke d-orbitalen van deze metalen die nodig zijn chemische bindingen
Nadere informatieControlling Radical-Type Reactivity with Transition Metals and Supramolecular Cages P.F. Kuijpers
Controlling Radical-Type Reactivity with Transition Metals and Supramolecular Cages P.F. Kuijpers Controleren van Radicaal-Type reactiviteit met Overgangsmetalen en Supramoleculaire Capsules In de moderne
Nadere informatieMulti-Omics Analyses of the Molecular Physiology and Biotechnology of Escherichia Coli and Synechocystis sp. PCC6803 O. Borirak
Multi-Omics Analyses of the Molecular Physiology and Biotechnology of Escherichia Coli and Synechocystis sp. PCC6803 O. Borirak Samenvatting O. BORIRAK Het hoofddoel van het onderzoek beschreven in dit
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/35896 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Viana de Carvalho, Rafael Title: Computational modeling of mycobacterium infection
Nadere informatiestudie waarmee we de principes van de analyse willen demonstreren. Een volledig beschrijving van de algoritmen en de resultaten zijn te vinden in
Bio-informatica kan omschreven worden als het toepassen van algoritmen om meerwaarde te verkrijgen uit data afkomstig van biomedisch en/of biologisch onderzoek. In bio-informatica wordt onderzoek gedaan
Nadere informatieSamenvatting. Figuur 1: Anabolisme en katabolisme van glucosylceramide. +UDP-Glc. Glucose + HN 13 O O HO HO. Ceramide. OH Glucosylceramide.
Iminosuikers zijn suiker (koolhydraat) derivaten waarin de ring-zuurstof is vervangen door een stikstof. Deze groep van gehydroxyleerde alkaloïden heeft interessante biologische eigenschappen. Ze blijken
Nadere informatieSamenvatting. (Summary in Dutch)
(Summary in Dutch) Biokatalyse & Multicomponentenreacties: De Ideale Synergie Asymmetrische Synthese van Gesubstitueerde Proline Derivaten De vraag naar snelle, schone, atoom- en stap- efficiënte chemische
Nadere informatieSamenvatting (Summary in Dutch)
Samenvatting (Summary in Dutch) Zowel beleidsmakers en zorgverleners als het algemene publiek zijn zich meer en meer bewust van de essentiële rol van kwaliteitsmeting en - verbetering in het verlenen van
Nadere informatieImmuunreactie tegen virussen
Samenvatting Gedurende de laatste eeuwen hebben wereldwijde uitbraken van virussen zoals pokken, influenza en HIV vele levens gekost. Echter, vooral in de westerse wereld zijn de hoge sterftecijfers en
Nadere informatieSamenvatting. Samenvatting
Samenvatting Introductie Wat zijn T cellen? T cellen zijn witte bloedcellen die een cruciale rol spelen bij het beschermen tegen ziekteverwekkers zoals virussen en bacteriën. Dit doen zij door middel van
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/20749 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Hashemi Shabestari, Maryam Title: Spin-label EPR on disordered and amyloid proteins
Nadere informatieTissue factor pathway inhibitor (TFPI) is een protease remmer die is opgebouwd
Samenvatting Appendix 234 238 Samenvatting Tissue factor pathway inhibitor (TFPI) is een protease remmer die is opgebouwd uit een negatief geladen N-terminus gevolgd door drie Kunitz domeinen (K1, K2 en
Nadere informatieVirulentie van mycobacteriën - balanceren op een dun koord
SAMENVATTING Virulentie van mycobacteriën - balanceren op een dun koord Vele millennia lang veroorzaken mycobacteriën infectieziekten in de mens. De meest levensbedreigende van deze ziekten is tuberculose
Nadere informatieSAMENVATTING IN HET NEDERLANDS
SAMENVATTING IN HET NEDERLANDS Een organisme bestaat uit verschillende weefsels, die opgebouwd zijn uit cellen. Cellen zijn dus de bouwblokken van elk levend organisme. De ontwikkeling van slechts een
Nadere informatieHow to present online information to older cancer patients N. Bol
How to present online information to older cancer patients N. Bol Dutch summary (Nederlandse samenvatting) Dutch summary (Nederlandse samenvatting) Goede informatievoorziening is essentieel voor effectieve
Nadere informatieSamenvatting in het Nederlands
Samenvatting in het Nederlands Met de ontwikkeling van de milde electrospray ionisatie techniek aan het eind van de jaren 80, zijn de massaspectrometrische analyse mogelijkheden enorm toegenomen. Tegenwoordig
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/33081 holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/33081 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Stettina, Christoph Johann Title: Governance of innovation project management
Nadere informatieCHAPTER 10 SAMENVATTING
CHAPTER 10 SAMENVATTING 218 Chapter 10 Samenvatting SAMENVATTING Nemaline myopathie is een ernstige spierziekte waarvoor momenteel nog geen therapie bestaat. Dit komt onder andere omdat de oorzaak van
Nadere informatiewaarin de op dit moment relevante bron data als ook de analyse technieken worden geintegreerd.
129 Samenvatting Bioinformatica is een interdisciplinair onderzoeksveld waarbij methoden uit de computer wetenschappen, wiskunde en statistiek worden gebruikt met het specifieke doel betekenis te geven
Nadere informatieChapter 6. Nederlandse samenvatting
Chapter 6 Nederlandse samenvatting Chapter 6 122 Nederlandse samenvatting Het immuunsysteem Het immuunsysteem (of afweersysteem) beschermt het lichaam tegen lichaamsvreemde en ziekmakende organismen zoals
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/36998 holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/36998 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Dunnen, Angela den Title: Surface-structure dependencies in catalytic reactions
Nadere informatieEvolution of Races within Fusarium oxysporum f.sp. Lycopersici B.V. Chellappan
Evolution of Races within Fusarium oxysporum f.sp. Lycopersici B.V. Chellappan University of Amsterdam Evolution of races within Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici Biju Vadakkemukadiyil Chellappan Samenvatting
Nadere informatieDUTCH SUMMARY NEDERLANDSE SAMENVATTING
NEDERLANDSE SAMENVATTING 205 Het is niet zonder reden dat autoriteiten wereldwijd aandacht besteden aan programma s en interventies om mensen meer te laten bewegen. Sportactiviteiten van gemiddelde tot
Nadere informatieBlauwalgen & genomics
Workshop Blauwalgen & genomics, Amersfoort, 2010 Blauwalgen & genomics CSI in het waterbeheer Ron van der Oost CSI Overzicht Genomics Blauwalgen: traditionele analyses Alternatieven met genomics? Discussiepunten
Nadere informatieVeredeling voor inhoudstoffen
Veredeling voor inhoudstoffen 11 maart 2014 Rene Hofstede, KeyGene N.V. KeyGene N.V. Technologie platforms Accelerated Molecular Breeding Lead Discovery & validation Mutation Breeding Traits 6F gewassen
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/48860 holds various files of this Leiden University dissertation Author: Rotman, M. Title: Crossing barriers, delivery of llama antibody fragments into
Nadere informatieSAMEN ME VAT A T T I T N I G
SAMENVATTING 186 Inleiding Het renine-angiotensine-aldosteron-systeem (RAAS) is een hormonaal systeem dat in belangrijke mate betrokken is bij de regulatie van bloeddruk en nierfunctie. Het RAAS is een
Nadere informatieBehoud effectief middelenpakket: verantwoord gebruik en risico van einde toelating. Arjan de Bever Berkel Enschot 27 maart 2013
Behoud effectief middelenpakket: verantwoord gebruik en risico van einde toelating Arjan de Bever Berkel Enschot 27 maart 2013 Inhoud presentatie Emissie oppervlaktewater Normen & waarden Kaderrichtlijn
Nadere informatieNederlandse samenvatting voor geïntereseerden buiten dit vakgebied
Hoofdstuk 8 Nederlandse samenvatting voor geïntereseerden buiten dit vakgebied Alle levende wezens zijn opgebouwd uit cellen. Het menselijk lichaam heeft er 10 14 oftewel rond de 100 biljoen, terwijl bacteriën
Nadere informatieInhibition and detection of 15-lipoxygenase-1 Eleftheriadis, Nikolaos
Inhibition and detection of 15-lipoxygenase-1 Eleftheriadis, Nikolaos IMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite from it. Please check the
Nadere informatieSamenvatting. Nikkel N heterocyclische carbeencomplexen in homogene katalyse
Nikkel N heterocyclische carbeencomplexen in homogene katalyse Inleiding Hoewel de bijzondere chemie van N heterocyclische carbenen (NHCs) al ruim veertig jaar wordt onderzocht, is het gebied pas in de
Nadere informatiete onderscheiden valt van FSHD (FSHD2). Omdat deze patiënten echter meer dan 10 D4Z4 repeats hebben kon eerder de diagnose van FSHD in een DNA test
SAMENVATTING Facioscapulohumerale spierdystrofie (FSHD) is een erfelijke spierziekte die wordt gekenmerkt door verzwakking van de aangezichtspieren (facio), de spieren rond de schouderbladen (scapulo)
Nadere informatieScheikundige begrippen
Scheikundige begrippen Door: Ruby Vreedenburgh, Jesse Bosman, Colana van Klink en Fleur Jansen Scheikunde begrippen 1 Chemische reactie Ruby Vreedenburgh Overal om ons heen vinden er chemische reacties
Nadere informatieSamenvatting MCRs naar APIs
MCRs naar APIs Multicomponenten Reacties op Maat Maken voor de Productie van Geneesmiddelen De farmaceutische industrie is continu op zoek naar betere en actievere medicijnen. Een groot deel van de huidige
Nadere informatieDC-SIGN + cellen een rol spelen in de opruiming van dode thymocyten uit de cortex van de humane thymus (Hoofdstuk 2). De co-expressie van het
: Hematopoietische antigeen presenterende cellen in de cortex van de humane thymus: Aanwijzingen voor een rol in selectie en verwijdering van apoptotische thymocyten. Het immune systeem van (gewervelde)
Nadere informatieVragen bij deoefen- en zelftoets-module behorende bij hoofdstuk 9 van Biology, Campbell, 8 e druk Versie 2010-2011
Celstofwisseling I Vragen bij deoefen- en zelftoets-module behorende bij hoofdstuk 9 van Biology, Campbell, 8 e druk Versie 2010-2011 Inleiding 1-12 Deze module gaat over de omzetting van voedsel in energie
Nadere informatieNEDERLANDSE SAMENVATTING
NEDERLANDSE SAMENVATTING Wat verandert er in het zenuwstelsel als een dier iets leert? Hoe worden herinneringen opgeslagen in de hersenen? Hieraan ten grondslag ligt het vermogen van het zenuwstelsel om
Nadere informatieLinking the Customer Purchase Process to E-commerce
Samenvatting Elektronische handel verandert fundamenteel de manier waarop consumenten goederen en diensten kopen. E-commerce is het kopen en verkopen van producten of diensten via elektronische systemen
Nadere informatieCover Page. The handle http://hdl.handle.net/1887/20358 holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/20358 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Witsenburg, Tijn Title: Hybrid similarities : a method to insert relational information
Nadere informatieNONMEVALONAAT PATHWAY VOOR ISOPRENOID BIOSYNTHESE ALS POTENTIEEL DOELWIT VOOR ANTIBACTERIELE THERAPIE
UNIVERSITEIT GENT FACULTEIT FARMACEUTISCHE WETENSCHAPPEN Vakgroep Farmaceutische Analyse Laboratorium voor Farmaceutische Microbiologie Academiejaar 2013-2014 NONMEVALONAAT PATHWAY VOOR ISOPRENOID BIOSYNTHESE
Nadere informatie1 e coördinatiesfeer. 2 e coördinatiesfeer
Samenvatting Coördinatie-Gedreven Inkapseling van vergangsmetaalkomplexen in Moleculaire Capsules en hun Toepassing in Hydroformylering en roton Reductie Katalyse 289 In traditionele homogene katalyse
Nadere informatieOptimalisatie van de eerste klinische studies in bi ondere patie ntengroepen: op weg naar gebruik van semifysiologische
Nederlandse samenvatting Optimalisatie van de eerste klinische studies in bi ondere patie ntengroepen: op weg naar gebruik van semifysiologische farmacokinetische modellen Algemene inleiding Klinisch onderzoek
Nadere informatieantidepressivum, rat, overerfbaar, mechanismen, gedrag
1 Algemene gegevens 1.1 Titel van het project Effecten van het antidepressivum vortioxetine op hersenmechanismen in genetische diermodellen voor depressie 1.2 Looptijd van het project 1.3 Trefwoorden (maximaal
Nadere informatieNederlandse samenvatting
Nederlandse samenvatting Archaea en hyperthermofielen De levende organismen op onze aarde kunnen verdeeld worden in twee groepen, de prokaryoten en de eukaryoten. Eukaryote cellen hebben een celkern, een
Nadere informatieafweerbalans; virusinfecties in luchtwegen; auto-immuunziektes; ontstekingsziekten
Niet-technische samenvatting 2015322 1 Algemene gegevens 1.1 Titel van het project Nieuwe behandelmethoden voor schadelijke afweerreacties 1.2 Looptijd van het project 1.3 Trefwoorden (maximaal 5) 5 jaar
Nadere informatieipsc-derived insights into Motor Neuron Disease and Inflammatory Neuropaties Oliver Härschnitz
Nederlandse samenvatting proefschrift ipsc-derived insights into Motor Neuron Disease and Inflammatory Neuropaties, 15 september 2017, UMC Utrecht Stamcellen zijn in staat tot het veranderen, oftewel differentiëren,
Nadere informatie- 1 - Microbiologie en Biochemie (MIB-10306) Biochemie deel Vrijdag 29 februari 2008, uur
Microbiologie en Biochemie (MIB-10306) Biochemie deel Vrijdag 29 februari 2008, 9.00-12.00 uur - Begin met het invullen van je naam en registratienummer. - Alle antwoorden moeten op het vragenformulier
Nadere informatie