Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Maat: px

Weergave met pagina beginnen:

Download "Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation."

Adriaan Koning
4 jaren geleden
Aantal bezoeken:

Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/73850 holds various files of this Leiden University dissertation.

1 Cover Page The handle holds various files of this Leiden University dissertation. uthor: Keijzer, J. de Title: proteomic portrait of Mycobacterium tuberculosis Issue Date:

2 List of publications 1. de Keijzer, J., Mulder,., de Ru,. H., van Soolingen, D. and van Veelen, P.. (2016) Parallel reaction monitoring of clinical Mycobacterium tuberculosis lineages reveals pre-existent markers of rifampicin tolerance in the emerging Beijing lineage. Journal of Proteomics 6;150: de Keijzer, J., Mulder,., de Haas, P. E., de Ru,. H., Heerkens, E.M., maral, L., van Soolingen, D. and van Veelen, P.. (2016) Thioridazine alters the cell envelope permeability of Mycobacterium tuberculosis. Journal of Proteome Research 15(6): de Keijzer, J., Mulder,., de Beer, J., de Ru,. H., van Veelen, P.., and van Soolingen, D. (2016) Mechanisms of phenotypic rifampicin tolerance in Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148. Journal of Proteome Research: 15(4): de Keijzer, J., de Haas, P. E., de Ru,. H., van Veelen, P.., and van Soolingen, D. (2014) Disclosure of selective advantages in the modern sublineage of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype family by quantitative proteomics. Molecular & cellular proteomics: MCP 13, de Keijzer, J., van der Plas Duivesteijn, S.J., Mulder,., de Zwaan, R., de Ru,.H., van Veelen, P.., van Soolingen, D., Palmblad, N.M. Rapid identification of phylogenetic relationships in the Mycobacterium genus by direct comparison of shared spectral content (submitted) 6. van der Plas Duivesteijn, S.J., Wulff, T., Klychnikov, O., Ohana, D., Dalebout, H., van Veelen, P.., de Keijzer, J., Nessen,.M., van der Burgt, Y.E.M., Deelder,.M., Palmblad, N.M. (2016) Differentiating Samples and Experimental Protocols by Direct Comparison of Tandem Mass Spectra. Rapid Communications in Mass Spectrometry (30): NEDERLNDSTLIGE SMENVTTING / LIST OF PUBLICTIONS 221

3 Curriculum Vitae Jeroen de Keijzer werd geboren op 08 juni 1988 te Rotterdam. In 2005 behaalde hij zijn HVO diploma aan het Christelijk Lyceum Delft. Het jaar daarop ontving hij zijn propedeuse van de opleiding Hoger Laboratorium Onderwijs aan de Hogeschool Leiden. Drie jaar later rondde hij de opleiding succesvol af. Tijdens zijn bachelor liep hij stage bij Centocor B.V. onder begeleiding van Maurice van der Meij. Hier werkte hij aan de overdracht en kwalificatie van chromatografische technieken voor de identificatie en kwantificatie van verontreinigingen in biopharmaceutische producten. Na zijn bachelor begon hij aan de masteropleiding BioMolecular Sciences aan de Vrije Universiteit msterdam. Tijdens de masteropleiding liep hij twee onderzoeksstages. De eerste stage liep hij bij de structuurbiologie groep van de Vrije Universiteit msterdam onder begeleiding van dr. Dirk Bald. Hier werkte hij aan het recombinant tot expressie brengen en crosslinken van protein motors. Zijn afstudeerstage voerde hij uit bij Erasmus Medisch Centrum te Rotterdam onder begeleiding van dr. ndre Boonstra. Tijdens deze stage deed hij onderzoek naar de interactie partners en signaalcascades van interferon lambda. Na het behalen van zijn masterdiploma in 2011 begon hij als promotiestudent aan een samenwerkingsproject tussen de massaspectrometrie groep van dr. Peter van Veelen (LUMC) en het laboratorium voor Mycobacteriologie van prof. dr. Dick van Soolingen (RIVM). Het promotieonderzoek is beschreven in dit proefschrift. Sinds februari 2016 is Jeroen werkzaam als Scientist nalytical Development bij Bioceros, waar hij zijn werk en interesse in eiwit identificatie, kwantificatie en characterisatie continueert. 222 DDENDUM

4 Dankwoord Het zelfstandig uitvoeren van een promotieonderzoek en het schrijven van het bijbehorende proefschrift doe je niet alleen. Op de laatste pagina s van dit proefschrift wil ik dan ook iedereen bedanken die, op welke manier dan ook, heeft bijgedragen aan de totstandkoming van mijn boekje. De afgelopen jaren heb ik veel geleerd over het opzetten, uitvoeren, documenteren en presenteren van wetenschappelijk onderzoek. Hier wil ik met name prof. dr. Dick van Soolingen en dr. Peter van Veelen voor bedanken. Peter, de eerste keer dat ik jouw kamer binnen stapte was in mei 2011 toen ik kwam solliciteren voor een promotieplek bij de massaspectrometrie groep van de IHB, ik voelde gelijk een klik. In de vier(+) jaren die volgden heb jij mij niet alleen veel geleerd, maar hebben wij vooral ook veel gesproken over wetenschap, wielrennen en de minder belangrijke zaken des leven. Tijdens mijn promotieonderzoek ben ik veel obstakels tegen gekomen als wetenschapper, maar ook als mens. Bedankt dat ik altijd op jouw kamer welkom was om hierover met je spreken. Dick, door jouw passie voor onderzoek, aanstekelijke enthousiasme en wetenschappelijke ideeën creëerde je voor mij een erg stimulerende omgeving om onderzoek te doen. Ik ben je erg dankbaar voor je begeleiding en advies, maar zeker ook voor het vertrouwen dat je in mij had. Dick en Peter, bedankt dat jullie mij deze kans hebben gegeven en mij hebben gevormd tot de wetenschapper die ik nu ben. To all my co-authors, you are gratefully acknowledged for your interest in the projects, useful comments, suggestions, discussions and help. George en rnoud, jullie waren niet alleen mijn prettige kantoorkamergenoten die mij hebben wegwijs gemaakt op het lab, maar ook in de wereld van de biochemie, analytische technieken en natuurlijk proteomics. Petra, Jessica, Tridia, Rina, Mimount, Miranda en natuurlijk rnout, bedankt voor de gezelligheid op het RIVM, maar natuurlijk ook voor alle keren dat jullie mij hebben geholpen met kweken, PCRs, VNTRs en nog veel meer. Chopie en Emmely, bedankt voor jullie gezelligheid als mede-oio ers, maar ook bedankt dat ik de kunst van het promoveren bij jullie heb kunnen afkijken. CURRICULUM VITE / DNKWOORD 223

5 Jer-Gung, thank you for all the great talks and trips we had during and after our time at the LUMC. Frits, bedankt voor het faciliteren van dit promotieonderzoek. Mede IHB ers Jeroen, Yvonne, Jan Wouter, Willemien, Robert, Natasja, llen, Veronica, Frederike, Vincent en halve IHB ers Kees & Lianne, bedankt voor de gezelligheid en jullie andere, niet proteomics/ microbiologische, kijk op mijn onderzoek. Vrienden en (schoon)familie, de laatste jaren heb ik regelmatig een verjaardag of afspraak gemist omdat ik wilde schrijven aan mijn boekje. Bedankt voor jullie begrip en geduld, maar bovenal bedankt dat jullie mij lieten zien dat er meer in het leven is dan pipetteren. Mamma, dankzij jouw onvermoeibare steun en hulp ben ik in de mogelijkheid gekomen om aan een promotietraject te beginnen. Pappa, je hebt mij meer dan eens gezegd dat je naast je schoenen zou lopen van trots mocht ik op een dag promoveren. Hoe erg ik het ook vind dat je er niet bij kan zijn, denk ik warm terug aan alle momenten die wij samen hebben gedeeld en die uiteindelijk hebben geleid tot dit moment. ls ouders staan jullie aan de basis van dit proefschrift, ik hoop dat jullie zo trots op mij zijn als ik op jullie ben. Lieve Talitha, het moeilijkste deel van het proefschrift is misschien wel op papier zetten hoe dankbaar ik ben voor alles wat je de afgelopen jaren voor mij hebt gedaan. Hoewel ik altijd enthousiast ben als het over mijn promotieonderzoek gaat, weet jij als geen ander dat er ook moeilijkere momenten zijn geweest. Jouw liefde, onvermoeibare geduld en steun, ook als ik weer eens een weekend aan dit proefschrift spendeerde, zijn de belangrijkste redenen dat het tot een afgerond geheel is gekomen. Ik ben dan ook blij de laatste zin van mijn proefschrift te hebben geschreven, zodat ik vanaf nu mijn vrije tijd met jou en onze kudde kan doorbrengen! 224 DDENDUM

Vergelijkbare documenten

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation. Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/36475 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Windhorst, Dina Aafje (Dafna) Title: Differential susceptibility to parenting