Medische natuurwetenschappen BSc Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 I
De bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen is een brede opleiding waarin de combinatie van de exacte wetenschappen en de medische wetenschappen centraal staat. Na de opleiding kan je doorstromen naar de doorstroommaster Medical Natural Sciences, of naar een aantal andere gerelateerde masteropleidingen. De eerste twee jaar volgen alle studenten een vast programma. In het derde jaar zijn er verschillende keuzemogelijkheden die je kan gebruiken als oriëntatie op je vervolgopleiding. Zo zijn er trajecten die voorbereiden op een mogelijk toekomstig beroep als klinisch fysicus, leraar natuurkunde of leraar scheikunde. De opleiding begint met een inleidend college over Medische Natuurwetenschappen. Daarnaast en daarna zijn er basisvakken in de natuurkunde, scheikunde, wiskunde en informatica en uiteraard de medische wetenschappen, en practica waarin met name onderzoekvaardigheden in de natuurkunde en de scheikunde centraal staan. De smaakmaker van het eerste jaar is een project (Project Zenuwen) waar je goed beeld verkrijgt van de samenhang van de medische en exacte disciplines en van de maatschappelijke relevantie. Een tweede project (Project Kanker) wordt in het tweede jaar aangeboden. Een aantal van de projecten en oriëntaties worden gedeeltelijk of geheel op het VU medisch centrum uitgevoerd. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website. Klik op de onderstaande links om informatie over de vakken te bekijken. Voor meer informatie over de opleiding zelf kun je terecht bij je studieadviseur. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 II
Inhoudsopgave Eerste jaar bachelor Medische natuurwetenschappen 1 MNW vervallen vakken per 1-9-2011 1 Verplichte vakken 1 Verplichte algemene onderdelen 2 Tweede jaar bachelor Medische natuurwetenschappen 2 Verplichte keuze 1 uit 2 2 Verplichte vakken 3 Derde jaar bachelor Medische natuurwetenschappen 3 Educatieve Minor Natuurkunde 4 Educatieve Minor Scheikunde 4 Individuele vakken 4 Bachelorproject 4 Verplichte keuze vakken 5 Vrije keuzevakken 6 Minor Biomedische Beeldvorming 7 Vak: Algemene didactiek en pedagogiek I 8 Vak: Bachelorproject Bioinformatica / Genomics 8 Vak: Bachelorproject Bioinformatics / Genomics 9 Vak: Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen 10 Vak: Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen 10 Vak: Bachelorproject Fysica van leven 11 Vak: Bachelorproject Fysica van leven 12 Vak: Bachelorproject Medische fysica 12 Vak: Bachelorproject Medische fysica 13 Vak: Bachelorproject Medische fysiologie 14 Vak: Bachelorproject Medische fysiologie 15 Vak: Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics 16 Vak: Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics 16 Vak: Basiswiskunde 17 Vak: Basiswiskunde 18 Vak: Bio-analytische chemie 18 Vak: Biochemie 19 Vak: Biomarkers & Diagnostiek 20 Vak: Biostatistiek 21 Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. 22 Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 22 Vak: Calculus 1 22 Vak: Calculus 2 23 Vak: Chemische diagnostiek en imaging 24 Vak: Differentiëren en integreren 3 24 Vak: EM Praktijk I 25 Vak: EM Praktijk II 26 Vak: EM Vakdidactiek Natuurkunde I 26 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 III
Vak: EM Vakdidactiek Natuurkunde II 27 Vak: EM Vakdidactiek Scheikunde I 28 Vak: EM Vakdidactiek Scheikunde II 28 Vak: Fysica en medische fysica 1 29 Vak: Fysica en medische fysica 2 30 Vak: Geschiedenis van de natuurwetenschappen 30 Vak: Gezondheidszorgsystemen 31 Vak: Image Processing 32 Vak: Inleiding bioinformatica 1 33 Vak: Inleiding bioinformatica 2 34 Vak: Inleiding computergebruik 35 Vak: Inleiding medische natuurwetenschappen 35 Vak: Innovatieproject diagnostiek & gezondheid 36 Vak: Klinische en Analytische Chemie 38 Vak: Levende chemie 39 Vak: Lineaire algebra 39 Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen 40 Vak: Mathematische methoden 1 41 Vak: Medical (Patho)Physiology I 42 Vak: Medische (patho)fysiologie 2 43 Vak: Medische beeldvorming 44 Vak: Medische natuurwetenschappen en samenleving 45 Vak: Mentoraat / Tutoraat 45 Vak: Microscopische beeldvorming 46 Vak: Natuurkunde en gezondheid 47 Vak: Natuurkunde practicum 1 48 Vak: Natuurkunde practicum 2 48 Vak: Optica en optisch waarnemen 49 Vak: Oriëntatie op de M-variant 50 Vak: Oriëntatie science educatie 51 Vak: Practicum biomarkers en biotransformatie 53 Vak: Project biomedische beeldvorming 54 Vak: Project kanker 54 Vak: Project systeemmodelleren 55 Vak: Project zenuw-werk 56 Vak: Radiofarmacochemie 57 Vak: Statistiek en data-analyse 58 Vak: Thermodynamica 59 Vak: Toegepaste informatica 60 Vak: Translationele Biomarkers 61 Vak: Van gen tot geneesmiddel 62 Vak: Van quantum tot molecuul 63 Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min 63 Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL 64 Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers 64 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 IV
Vak: Wijsgerige vorming: natuurwetenschappen, filosofie en ethiek 65 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 V
Eerste jaar bachelor Medische natuurwetenschappen Eerste jaar voor studenten gestart in 2011/2012 In het eerste jaar kun je nagaan of je Medische natuurwetenschappen een leuke studie vindt en kan bekeken worden of je geschikt bent om met een redelijke kans van slagen de studie te vervolgen. Kort gezegd: het eerste jaar heeft een oriënterende, selecterende en verwijzende functie. In het eind van het eerste studiejaar maak je voor het eerst kennis met projectonderwijs ('zenuw-werk'), waarin de integratie van de verschillende disciplines binnen de medische natuurwetenschappen duidelijk wordt. Opleidingsdelen: - - - MNW vervallen vakken per 1-9-2011 Verplichte vakken Verplichte algemene onderdelen MNW vervallen vakken per 1-9-2011 Vakken: Naam Periode Credits Code Basiswiskunde Periode 1 2.0 X_400288 Verplichte vakken Vakken: Naam Periode Credits Code Basiswiskunde Periode 1 3.0 X_401069 Bio-analytische chemie Periode 4 3.0 X_430094 Biochemie Periode 4, Zomerperiode 3.0 X_430562 Calculus 1 Periode 2 3.0 X_400300 Fysica en medische fysica 1 Periode 4 3.0 X_430060 Fysica en medische fysica 2 Periode 5 3.0 X_430061 Inleiding medische natuurwetenschappen Klinische en Analytische Chemie Periode 1 3.0 X_430089 Periode 3 3.0 X_430510 Levende chemie Periode 2 3.0 X_430569 Lineaire algebra Periode 4 3.0 X_400302 Medical (Patho)Physiology I Periode 1+2 6.0 X_436501 Medische natuurwetenschappen en samenleving Periode 3 3.0 X_430013 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 1 van 66
Natuurkunde en gezondheid Periode 5 3.0 X_420503 Natuurkunde practicum 1 Periode 1 3.0 X_430105 Project zenuw-werk Periode 6 6.0 X_430067 Toegepaste informatica Periode 5 3.0 X_420534 Van gen tot geneesmiddel Periode 2 3.0 X_435107 Verplichte algemene onderdelen Vakken: Naam Periode Credits Code Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 Periode 1 0.0 X_000002 Periode 1 0.0 X_000003 Inleiding computergebruik Periode 1 0.0 X_000004 Mentoraat / Tutoraat Semester 1 0.0 X_000008 Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min Voorlichting door studentendecanen en CSL Periode 1 0.0 X_000019 Periode 1 0.0 X_000007 Tweede jaar bachelor Medische natuurwetenschappen Tweede jaar voor studenten gestart in 2010/2011 Het tweede jaar van de studie dient ter verbreding en verdieping van de leerstof. Ook in dit studiejaar volg je behalve de disciplinaire vakken (in een medische context) ook een integratief project: 'kanker'. Tevens volg je verplicht een van de twee vakken uit Algemene Vorming. Opleidingsdelen: - - Verplichte keuze 1 uit 2 Verplichte vakken Verplichte keuze 1 uit 2 Verplichte keuze van 1 uit 2 Deze keuze vervalt per 1-9-2012 voor 2S. Vakken: Naam Periode Credits Code Geschiedenis van de natuurwetenschappen Periode 4 3.0 X_420148 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 2 van 66
Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen Periode 4 3.0 X_420153 Verplichte vakken Vakken: Naam Periode Credits Code Biomarkers & Diagnostiek Periode 1 3.0 X_430553 Biostatistiek Periode 5 3.0 X_401070 Calculus 2 Periode 1+2 6.0 X_435002 Inleiding bioinformatica 1 Periode 3 3.0 X_401036 Mathematische methoden 1 Periode 4 3.0 X_401021 Medische (patho)fysiologie 2 Periode 2 6.0 X_436503 Natuurkunde practicum 2 Periode 5 3.0 X_430076 Optica en optisch waarnemen Practicum biomarkers en biotransformatie Periode 4 6.0 X_420214 Periode 2 3.0 X_430512 Project kanker Periode 6 6.0 X_430021 Statistiek en data-analyse Periode 3 3.0 X_401072 Thermodynamica Periode 1 3.0 X_435203 Van quantum tot molecuul Periode 5 6.0 X_420545 Wijsgerige vorming: natuurwetenschappen, filosofie en ethiek Periode 1 3.0 X_435340 Derde jaar bachelor Medische natuurwetenschappen Derde jaar voor studenten gestart in 2009/2010 Het derde jaar vormt de afronding van de basistraining. De helft (30 studiepunten) is gereserveerd voor een minor of vrije keuze in het najaarssemester. De opleiding biedt de minor Biomedische Beeldvorming aan. Studenten zijn echter vrij om een andere minor te kiezen of deze keuzeruimte op een andere manier in te vullen. Hiervoor is echter wel toestemming van de examencommissie nodig. In het voorjaarssemester moet in periode 4 gekozen worden uit een aantal vakken, die deels als voorbereiding dienen voor specialisaties in de masterfase. De periodes 5 en 6 zijn gereserveerd voor het afsluitend bachelorproject van 12 of 18 studiepunten. Als voor 12 studiepunten wordt gekozen is er ruimte voor een extra vrije keuze van 6 sp. Voor studenten die in aanmerking willen komen voor een certificaat van de e Vereniging voor Klinische Fysica (waarin staat dat hun vooropleiding voldoet aan de eisen voor toegang tot de postinitiële opleiding in de Klinische Fysica) gelden aanvullende eisen die te vinden zijn in de OER. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 3 van 66
Opleidingsdelen: - - - - - - - Educatieve Minor Natuurkunde Educatieve Minor Scheikunde Individuele vakken Bachelorproject Verplichte keuze vakken Vrije keuzevakken Minor Biomedische Beeldvorming Educatieve Minor Natuurkunde Vakken: Naam Periode Credits Code Algemene didactiek en pedagogiek I Educatieve Minor Scheikunde Periode 1 3.0 OM_EMADEPI EM Praktijk I Periode 1 6.0 OM_EMPRI EM Praktijk II Periode 2+3 9.0 OM_EMPRII EM Vakdidactiek Natuurkunde I EM Vakdidactiek Natuurkunde II Periode 1 3.0 OM_EMVDNAI Periode 2+3 3.0 OM_EMVDNAII Vakken: Naam Periode Credits Code Algemene didactiek en pedagogiek I Individuele vakken Periode 1 3.0 OM_EMADEPI EM Praktijk I Periode 1 6.0 OM_EMPRI EM Praktijk II Periode 2+3 9.0 OM_EMPRII EM Vakdidactiek Scheikunde I EM Vakdidactiek Scheikunde II Periode 1 3.0 OM_EMVDSKI Periode 2+3 3.0 OM_EMVDSKII Bachelorproject De bacheloropleiding wordt in periode 4 en 5 van het derde jaar afgesloten met een gespecialiseerd project dat een 'proeve van bekwaamheid' bevat. In het najaar ontvang je meer informatie over de inhoud van de mogelijke specialisaties en de onderwerpen van onderzoek Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 4 van 66
in de masteropleiding. De inhoud van het bachelorproject kan dus variëren, maar het programma bevat zeker theoretische verdieping en kennismaking met onderzoek. We hebben een aparte handleiding voor het bachelorproject samengesteld (zie onder 'Project en stage' in het linker menu), zodat student en begeleider precies weten wat er van hen verwacht wordt. NOTE: Het eindcijfer van het Bachelorproject moet samen worden ingeleverd met het 'Beoordelingsformulier Bachelorproject' te vinden in de Handleiding Bachelorproject. Alle bachelorprojecten van MNW zijn uit te breiden naar projecten van 18 of zelfs 24 sp in overleg met de docent. Wat te doen bij achterstand In principe zijn de bachelprojecten bedoeld om de bacheloropleiding mee af te sluiten. Het is dan ook niet raadzaam om deze al te volgen als je nog een aanzienlijke studieachterstand hebt. Als je bepaalde vereiste voorkennis mist, is deelname al helemaal uitgesloten. Bijvoorbeeld: je moet de vakken Fysica en Medische Fysica I en Natuurkunde en Gezondheid gehaald hebben alvorens je mag deelnemen aan een bachelorproject bij Medische Fysica. Dat ligt natuurlijk ook erg voor de hand. Aan de andere kant mag uitstellen ook niet tot verdere vertraging leiden. Neem daarom in voorkomende gevallen tijdig contact op met de studieadviseur (Wim Sterrenburg) om een studieplanning te maken. Het bachelorproject van 12 sp kan uitgebreid worden met 6 sp tot een bachelorproject van 18 sp. Wanneer je dit wilt, dan moet je kiezen voor een bachelorproject van 18 sp uit de modulegroep XB3_MNW_K1. In de handleiding vind je informatie over de gang van zaken rond het bachelorproject. Hierin staat onder meer dat je schriftelijke toestemming van de studieadviseur nodig hebt om aan het project te kunnen beginnen. Vakken: Naam Periode Credits Code Bachelorproject Bioinformatics / Genomics Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen Bachelorproject Fysica van leven Bachelorproject Medische fysica Bachelorproject Medische fysiologie Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics Verplichte keuze vakken Ac. Jaar (september) 12.0 X_430041 Ac. Jaar (september) 12.0 X_430503 Ac. Jaar (september) 12.0 X_430039 Ac. Jaar (september) 12.0 X_430085 Ac. Jaar (september) 12.0 X_430100 Ac. Jaar (september) 12.0 X_430506 * Max 6 ec zullen verplicht worden gesteld voor de verschillende MNS tracks Mastertrack: Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 5 van 66
Fysica van Leven Differentiëren en integreren 3 Medische Fysica Differentiëren en integreren 3 en Voortgezette Biostatistiek Medische Fysiologie Inleiding bioinformatica 2 en Voortgezette Biostatistiek Moleculaire Klinische Diagn. Inleiding bioinformatica 2 en Voortgezette Biostatistiek Vakken: Naam Periode Credits Code Differentiëren en integreren 3 Vrije keuzevakken Periode 4 3.0 X_400577 Gezondheidszorgsystemen Periode 4 3.0 X_420528 Inleiding bioinformatica 2 Periode 4 3.0 X_401042 Oriëntatie op de M-variant Periode 4 6.0 X_400375 Oriëntatie science educatie Semester 2 6.0 O_ORIBETA Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers Periode 5 6.0 AB_470185 Minimaal 6 sp te kiezen in de vrije keuzeruimte. Er kan gekozen worden om het bachelorproject van 12 sp uit te breiden met 6 sp, tot een bachelorproject van 18 sp. Wanneer je dit wilt, moet je niet kiezen voor een bachelorproject van 12 sp uit de modulegroep XB3_MNW_B1. Naast ondergenoemde keuzevakken van 6 sp kan ook worden gekozen uit vakken bij andere opleidingen. Het is wel verstandig om daarvoor eerst toestemming van de examencommissie te vragen. Vakken: Naam Periode Credits Code Bachelorproject Bioinformatica / Genomics Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen Bachelorproject Fysica van leven Bachelorproject Medische fysica Bachelorproject Medische fysiologie Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics Innovatieproject diagnostiek & gezondheid Ac. Jaar (september) 18.0 X_430096 Ac. Jaar (september) 18.0 X_430504 Ac. Jaar (september) 18.0 X_430107 Ac. Jaar (september) 18.0 X_430099 Ac. Jaar (september) 18.0 X_430101 Ac. Jaar (september) 18.0 X_430507 Periode 5 6.0 X_420225 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 6 van 66
Project systeemmodelleren Periode 6 6.0 X_420544 Translationele Biomarkers Periode 5+6 6.0 X_430559 Minor Biomedische Beeldvorming In de laatste decennia hebben beeldvormende technieken een enorme vlucht genomen, zowel in de gezondheidszorg als in de fundamentele levenswetenschappen. Het is nu mogelijk om bijvoorbeeld denkprocessen in onze hersenen te lokaliseren en visualiseren met functionele MRI (figuur linksboven). Ook kunnen we nu een enkel DNA molecuul vastpakken, zichtbaar maken en uitrekken (figuur onder). Onderzoek naar en met beeldvormende technieken heeft de laatste jaren meerdere malen tot Nobelprijzen geleid. Ook op de VU: in de faculteit exacte wetenschappen, het medische centrum, in het lasercentrum, maar ook bij de faculteiten aard- en levenswetenschappen, bewegingswetenschappen en psychologie worden dit type methoden steeds belangrijker. Kortom, beeldvormende technieken kom je tegenwoordig overal tegen in het onderzoek en in de patiëntenzorg en daarom staan ze centraal in deze minor. In deze minor word je geïntroduceerd in een breed scala aan beeldvormende methoden. Er wordt ingegaan op de fysische en chemische principes van de beeldvorming: het gebruik van licht (microscopie, optical coherence tomography, Raman spectroscopie, optisch pincet), röntgenstraling, geluid, radioactief verval (PET) en magnetische velden (MRI en magnetisch pincet). Ook ga je aan de slag met beeldbewerking en beeldanalyse om de gewenste informatie uit de gemaakte beelden te halen. Toepassingen in de medische praktijk en fundamenteel (levens) wetenschappelijk onderzoek komen uitgebreid aan bod in voordrachten van gastsprekers. Ook excursies en demonstraties, hoorcolleges en practica zitten in het minorprogramma. Deze minor geeft een goede indruk van beeldvormende technieken en de toepassingen daarvan op de VU en het VUmc en biedt het bovendien de mogelijkheid een kijkje te nemen over de grenzen van de eigen faculteit. Daarmee vormt deze minor een prima fundament voor masteropleidingen als medical natural sciences, chemistry en physics. Toelatingseisen De minor biomedische beeldvorming is in het bijzonder toegespitst op derdejaars bachelorstudenten medische natuurwetenschappen en natuurkunde, maar is natuurlijk ook toegankelijk voor studenten uit andere opleidingen met een vergelijkbaar natuurkunde en wiskunde niveau met een grote interesse in de principes van beeldvormende technieken. Te denken valt aan bewegingswetenschappen, scheikunde, farmaceutische wetenschappen, bèta-gamma, science business and innovation en andere. Het is aan te bevelen om, als je tot deze laatste categorie behoort, contact op te nemen met minorcoördinator. Vakken: Naam Periode Credits Code Chemische diagnostiek en imaging Periode 2 3.0 X_430554 Image Processing Periode 2 6.0 X_432630 Medische beeldvorming Periode 1 6.0 X_436504 Microscopische beeldvorming Periode 1 3.0 X_420529 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 7 van 66
Project biomedische beeldvorming Algemene didactiek en pedagogiek I Periode 3 6.0 X_420537 Radiofarmacochemie Periode 1 3.0 X_436502 Vakcode OM_EMADEPI () Periode Periode 1 Credits 3.0 Onderwijscentrum VU drs. D.T.T. Kamsma D.T.A. Wols, drs. S. Attema-Noordewier, ir. J.G. Schoonhoven, drs. W.S. Hoekstra Werkgroep De student neemt kennis van algemene onderwijskundige inzichten op het terrein van (activerende) didactiek en communicatie in de klas, past dit toe in de eigen lespraktijk en kan reflecteren op de eigen lespraktijk Gestart wordt met een startcollege en een inleidend college over de docentrollen ontwerper, uitvoerder, teamlid/collega, pedagoog en professional. Verder 4 peergroepsbijeenkomsten van elk anderhalf uur, 5 interactieve colleges over de rol van ontwerper en 5 interactieve colleges over de rol van uitvoerder. In een apart college van anderhalf uur komt microteaching aan bod: reflectie op een video-opnamen van een gesimuleerde les. Ook is er aan het begin van de periode een workshop over het digitaal portfolio, waarin alle uitwerkingen van de opdrachten opgenomen moeten worden. Interactieve hoor- en werkcolleges Gewogen beoordeling door alle betrokken opleiders op basis van de ingeleverde portfolio-opdrachten Een syllabus wordt op het eerste college uitgereikt Bachelorproject Bioinformatica / Genomics Vakcode X_430096 (430096) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. J. Heringa Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 8 van 66
Oriëntatie en voorbereiding op de master Bioinformatics en (specialisatie) Systems Biology. Nadere kennismaking met en verdieping in het vakgebied bioinformatica of systeem biolgie. In het kader van deze cursus wordt een bacheloropdracht uitgevoerd, waarmee de student laat zien dat hij/zij kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc. die in de bachelorfase aan de orde zijn geweest, kan toepassen in een project van enige omvang. De bacheloropdracht dient daarmee als 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van praktische oefeningen en een onderzoeksproject onder leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen, Biologie of Informatica. Het vak Inleiding Bioinformatica wordt aanbevolen als voorkennis, voor een Bachelor Project in Bioinformatica, ook is enige programmeer ervaring en/of affiniteit met biologische problemen handig. Voor een Bachelor project in Systeem Biologie is affiniteit met wiskunde en biologie of enige ervaring met biologisch labwerk gewenst. 3MNW Overige informatie Voor 3 MNW studenten bestaat dit Bachelorproject in twee varianten: de basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430041) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (zie vakcode 430096). Bachelorproject Bioinformatics / Genomics Vakcode X_430041 (430041) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. J. Heringa Oriëntatie en voorbereiding op de master Bioinformatics en (specialisatie) Systems Biology. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 9 van 66
Nadere kennismaking met en verdieping in het vakgebied bioinformatica of systeem biolgie. In het kader van deze cursus wordt een bacheloropdracht uitgevoerd, waarmee de student laat zien dat hij/zij kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc. die in de bachelorfase aan de orde zijn geweest, kan toepassen in een project van enige omvang. De bacheloropdracht dient daarmee als 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van praktische oefeningen en een onderzoeksproject onder leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen, Biologie of Informatica. Het vak Inleiding Bioinformatica wordt aanbevolen als voorkennis, voor een Bachelor Project in Bioinformatica, ook is enige programmeer ervaring en affiniteit met biologische problemen handig. Voor een Bachelor project in Systeem Biologie is affiniteit met wiskunde en biologie of enige ervaring met biologisch labwerk gewenst. 3MNW Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430041) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430096). Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen Vakcode X_430503 (430503) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 der Exacte Wetenschappen dr. M.H. Siderius Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430503) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430504). Bachelorproject Biomoleculaire wetenschappen Vakcode X_430504 (430504) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 10 van 66
der Exacte Wetenschappen dr. M.H. Siderius Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430503) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430504). Bachelorproject Fysica van leven Vakcode X_430039 (430039) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. ir. G.J.L. Wuite Oriëntatie en voorbereiding op de afstudeerrichting Fysica van Leven in de MNW-masteropleiding. Nadere kennismaking met en verdieping in dit vakgebied. In het kader van deze cursus wordt een bacheloropdracht uitgevoerd, waarmee de student laat zien dat hij/zij kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc. die in de bachelorfase aan de orde zijn geweest, kan toepassen in een project van beperkte omvang. De bacheloropdracht dient daarmee als 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van een opdracht aan de hand van een beperkte probleemstelling onder de leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen. 3MNW Overige informatie Bovenstaande beschrijving is voorlopig. De integratie van theoretische en praktische elementen staat nog ter discussie. Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430039) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430107). Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 11 van 66
Bachelorproject Fysica van leven Vakcode X_430107 (430107) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. D. Iannuzzi Oriëntatie en voorbereiding op de afstudeerrichting Fysica van Leven in de MNW-masteropleiding. Nadere kennismaking met en verdieping in dit vakgebied. In het kader van deze cursus wordt een bacheloropdracht uitgevoerd, waarmee de student laat zien dat hij/zij kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc. die in de bachelorfase aan de orde zijn geweest, kan toepassen in een project van beperkte omvang. De bacheloropdracht dient daarmee als 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van een opdracht aan de hand van een beperkte probleemstelling onder de leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen. 3MNW Overige informatie Bovenstaande beschrijving is voorlopig. De integratie van theoretische en praktische elementen staat nog ter discussie. Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430039) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430107). Bachelorproject Medische fysica Vakcode X_430085 (430085) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 12 van 66
der Exacte Wetenschappen dr. ir. T.J.C. Faes Oriëntatie en voorbereiding op de MNW-masterspecialisatie Medische fysica (Medical Physics) in de MNW-masteropleiding. Nadere kennismaking met en verdieping in medisch fysica. In dit project voert de student een opdracht uit, waarmee hij/zij laat zien kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc., kan toepassen in een project van beperkte omvang op het gebied van de medische fysica. De bacheloropdracht is daarmee een 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van een opdracht aan de hand van een beperkte probleemstelling onder leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen voor betreffende opdracht. Aanbevolen voorkennis Basiskennis uit de gevolgde MNW-bachelorstudie. 3MNW Overige informatie - Voor meer informatie over beschikbare bachelor- opdrachten: Zie Blackboard onder Bachelorproject Medische Fysica. - Minimaal 6 weken voor aanvang van opdracht contact opnemen met de coordinator Th.J.C. Faes (tjc.faes@vumc.nl) o.v.v. Aanmelden MNW-Bachelor stage Medische fysica. - Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430085) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430099). Bachelorproject Medische fysica Vakcode X_430099 (430099) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 der Exacte Wetenschappen dr. ir. T.J.C. Faes Oriëntatie en voorbereiding op de MNW-masterspecialisatie Medische fysica (Medical Physics) in de MNW-masteropleiding. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 13 van 66
Nadere kennismaking met en verdieping in medisch fysica. In dit project voert de student een opdracht uit, waarmee hij/zij laat zien kennis en vaardigheden op het gebied van theorie, experimenteel werk, data analyse, schriftelijk en mondeling rapporteren, etc., kan toepassen in een project van beperkte omvang op het gebied van de medische fysica. De bacheloropdracht is daarmee een 'proeve van bekwaamheid'. Bestudering van leerboek en/of andere relevante vakliteratuur d.m.v. begeleide zelfstudie, uitvoering van een opdracht aan de hand van een beperkte probleemstelling onder leiding van een stafmedewerker, schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Er is een handleiding bacheloropdracht beschikbaar. Nader te bepalen voor betreffende opdracht. Aanbevolen voorkennis Basiskennis uit de gevolgde MNW-bachelorstudie. 3MNW Overige informatie - Voor meer informatie over beschikbare bachelor- opdrachten: Zie Blackboard onder Bachelorproject Medische Fysica. - Minimaal 6 weken voor aanvang van opdracht contact opnemen met de coordinator Th.J.C. Faes (tjc.faes@vumc.nl) o.v.v. Aanmelden MNW-Bachelor stage Medische fysica. - - Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430085) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430099). Bachelorproject Medische fysiologie Vakcode X_430100 (430100) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. G.J.M. Stienen Oriëntatie en voorbereiding op de MNW-masterspecialisatie Medische Fysiologie (Medical Physiology) in de MNW-masteropleiding. Nadere kennismaking met en verdieping in de medisch fysiologie. In dit project participeert de student in medisch georiënteerd onderzoek, op cardiovasculair gebied. In dit kader zal met een grote mate van zelfstandigheid een aantal experimenten worden uitgevoerd of een literatuurstudie worden verricht binnen lopend onderzoek naar het vóórkomen, de oorzaken en/of de behandeling van hart- en vaatziekten. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 14 van 66
Bestudering van de relevante vakliteratuur. Vervolgens stelt de student, in overleg met de begeleider (promovendus, postdoc of stafmedewerker) een werkplan op voor de uitvoering van het project. Dit wordt afgesloten met een schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Nader te bepalen, afhankelijk van het onderwerp. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen. 3MNW Overige informatie Minimaal 6 weken voor aanvang contact opnemen met de coördinator. - Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430100) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430101). Bachelorproject Medische fysiologie Vakcode X_430101 (430101) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. G.J.M. Stienen Oriëntatie en voorbereiding op de MNW-masterspecialisatie Medische Fysiologie (Medical Physiology) in de MNW-masteropleiding. Nadere kennismaking met en verdieping in de medisch fysiologie. In dit project participeert de student in medisch georiënteerd onderzoek, op cardiovasculair gebied. In dit kader zal met een grote mate van zelfstandigheid een aantal experimenten worden uitgevoerd of een literatuurstudie worden verricht binnen lopend onderzoek naar het vóórkomen, de oorzaken en/of de behandeling van hart- en vaatziekten. Bestudering van de relevante vakliteratuur. Vervolgens stelt de student, in overleg met de begeleider (promovendus, postdoc of stafmedewerker) een werkplan op voor de uitvoering van het project. Dit wordt afgesloten met een schriftelijke en mondelinge verslaggeving. Nader te bepalen, afhankelijk van het onderwerp. Aanbevolen voorkennis Basiskennis overeenkomend met de tot dan toe gevolgde bacheloropleiding Medische Natuurwetenschappen. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 15 van 66
3MNW Overige informatie Minimaal 6 weken voor aanvang contact opnemen met de coördinator. - Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430100) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430101). Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics Vakcode X_430506 (430506) Periode Ac. Jaar (september) Credits 12.0 der Exacte Wetenschappen dr. H. Lingeman Het gebruik van technieken en meetmethoden die gebruikt worden om klinische diagnosis te kunnen stellen. In een nauwe samenwerking met het VUmc zal aan technieken en meetmethoden worden gewerkt die in de klinische chemie worden gebruikt om ziektebeelden te voorspellen (preventie), om een diagnosis te stellen en om een therapie te bewaken. Dit betekent dat het vinden en bepalen van biomarkers, endogene (bijv. eiwitten, hormonen, lipiden) verbindingen en hiervan afgeleide metabolieten en het bepalen van concentratie-tijd curven in biologische monsters om een optimal therapie te kunnen instellen aan de orde kunnen komen. Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Praktische handleidingen en basisliteratuur. 3MNW, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430506) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430507). Bachelorproject Molecular Clinical Diagnostics Vakcode X_430507 (430507) Periode Ac. Jaar (september) Credits 18.0 der Exacte Wetenschappen Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 16 van 66
dr. H. Lingeman Het gebruik van technieken en meetmethoden die gebruikt worden om klinische diagnosis te kunnen stellen. In een nauwe samenwerking met het VUmc zal aan technieken en meetmethoden worden gewerkt die in de klinische chemie worden gebruikt om ziektebeelden te voorspellen (preventie), om een diagnosis te stellen en om een therapie te bewaken. Dit betekent dat het vinden en bepalen van biomarkers, endogene (bijv. eiwitten, hormonen, lipiden) verbindingen en hiervan afgeleide metabolieten en het bepalen van concentratie-tijd curven in biologische monsters om een optimal therapie te kunnen instellen aan de orde kunnen komen. Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Praktische handleidingen en basisliteratuur. 3MNW, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430506) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430507). Basiswiskunde Vakcode X_400288 () Periode Periode 1 Credits 2.0 der Exacte Wetenschappen drs. J.A. Los drs. J.A. Los Hoorcollege, Werkcollege Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige basisvaardigheden die nodig zijn in de vervolgcolleges Calculus en Statistiek De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Daarna komen een aantal nieuwe onderwerpen aan bod: complexe getallen en volledige inductie. Gemengd hoor- en werkcollege. Met de huiswerkopgaven zal de student ongeveer vier uur per week bezig moeten zijn. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 17 van 66
Afsluitende toets Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch, Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat. Aanbevolen voorkennis vwo- wiskunde b1 1S, 1MNW, 1SBI Basiswiskunde Vakcode X_401069 () Periode Periode 1 Credits 3.0 drs. J.A. Los dr. ir. R.F. Swarttouw, drs. J.A. Los Hoorcollege, Werkcollege Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en Statistiek. De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis): integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met volledige inductie. Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven. Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets. Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch, Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat. 1F, 1MNW, 1S, 1SBI Bio-analytische chemie Vakcode X_430094 (430094) Periode Periode 4 Credits 3.0 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 18 van 66
der Exacte Wetenschappen dr. H. Lingeman dr. H. Lingeman, prof. dr. H. Irth Hoorcollege Het verwerven van kennis en het aanleren van analytische technieken die gebruikt kunnen worden bij de (kwantitatieve) bepaling van geneesmiddelen en endogene componenten in biologische systemen. In een geïntegreerd hoor-/werkcollege komen de technieken aan de orde die gebruikt kunnen worden voor zowel de kwalitatieve als kwantitatieve bepaling van geneesmiddelen, met de hierbij horende metabolieten en/of ontledingsproducten in een biologische matrix. Technieken die bestudeerd worden zijn chromatografie, electroforese, massa spectrometrie evenals biologische, enzymatische en immunologische reactie-detectiesystemen. Geïntegreerd hoor- en werkcollege. Schriftelijk tentamen. Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie over de behandelde stof kan worden gevonden in D.C. Harris, Quantitative Chemical Analysis, Eighth Edition, W.H. Freeman and Company, New York, 2010. 1MNW Biochemie Vakcode X_430562 () Periode Periode 4, Zomerperiode Credits 3.0 der Exacte Wetenschappen J.C. Vos dr. M.H. Siderius, J.C. Vos Hoorcollege Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 19 van 66
Aandacht voor de genetische informatiestroom DNA -> RNA -> eiwit en de manier waarop deze informatiestroom wordt gereguleerd. Tenslotte komen de belangrijkste onderdelen van de recombinant DNA technologie aan de orde (genetische modificatie, DNA volgorde analyse, PCR, etc.). Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen (koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm (ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod. Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen toetsen. Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw, bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie, genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en energiehuishouding aan de orde komen. Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Voornamelijk de hoofdstukken 7-9, 10-14, zoals aangegeven in de studiehandleiding bij dit college. Aanbevolen voorkennis Levende Chemie 1F, 1MNW, mbio Biomarkers & Diagnostiek Vakcode X_430553 (430553) Periode Periode 1 Credits 3.0 der Exacte Wetenschappen prof. dr. N.P.E. Vermeulen prof. dr. N.P.E. Vermeulen, dr. H. Lingeman Hoorcollege Het doel van dit college is om de studenten bekend te maken met de basale achtergrond van biomarkers en diagnostische testen en hun toepassingen in de klinische chemie. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 20 van 66
Bij dit college wordt gebruik gemaakt van een boek waarin allereerst de basale achtergrond van biomarkers en diagnostische testen wordt behandeld, zoals de principes van de moleculaire biologie, DNA en RNA, het menselijk genoom en verandering daarin als gevolg van ziekten. Vervolgens wordt er aandacht besteed aan de verzameling en de behandeling van monsters uit verschillende lichaamsvloeistoffen, organen en weefsels en de klinisch chemische technieken die gebruikt worden om daarin biomarkers te meten en diagnostische testen uit te voeren. Tot slot worden verschillende toepassingen van deze klinisch chemische technieken behandeld bij het opsporen van aangeboren afwijkingen, verschillen in gevoeligheid voor en behandelbaarheid van kanker en andere ziekten. Hoorcolleges met discussies en enkele demonstraties. Schriftelijk tentamen Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Aanvullende informatie over de behandelde stof kan worden gevonden in: W.B. Coleman, G.J. Tsongalis, Molecular Diagnostics for the Clinical Laboratorian, Humana Press, New York 2010. 2MNW Biostatistiek Vakcode X_401070 () Periode Periode 5 Credits 3.0 dr. B.I. Witte dr. B.I. Witte Hoorcollege, Werkcollege Studenten bekend maken met de basisbegrippen in de statistiek om data te analyseren. Nadruk zal gelegd worden op veel voorkomende methoden in de biostatistiek. De verworven kennis toepassen om praktijkproblemen op te lossen met het statistisch computerpakket R. Deze cursus is een voortzetting van de cursus Statistiek en Data Analyse. Tijdens de cursus zullen veel voorkomende statistische methoden uit de biostatistiek besproken worden. Veel aandacht wordt besteed aan toetsingstheorie. Dit zullen we toepassen bij het fitten van lineaire regressie modellen en variantie analyse modellen. Tevens komen kruistabellen aan de orde. Een bijbehorend werkcollege biedt gelegenheid om beter om te leren gaan met de begrippen. Met behulp van het statistische pakket R zullen datasets worden geanalyseerd. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 21 van 66
Hoorcollege en werkcollege. Schriftelijk tentamen en computeropdrachten. Zowel het tentamen als alle computeropdrachten moeten voldoende worden gemaakt. De computeropdrachten tellen voor 1/3 mee bij de bepaling van het eindcijfer. Boek: Mathematical Statistics with applications, 7th edition Wackerly, Mendenhall, Scheaffer ISBN: 978-0-495-38508-0 R-handleiding Aanbevolen voorkennis Basiswiskunde (400288) en Statistiek en Data analyse 2MNW Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. Vakcode X_000002 () Periode Periode 1 Credits 0.0 der Exacte Wetenschappen Practicum Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 Vakcode X_000003 () Periode Periode 1 Credits 0.0 der Exacte Wetenschappen Hoorcollege Calculus 1 Vakcode X_400300 () Periode Periode 2 Credits 3.0 drs. J.A. Los dr. C.M. Quant, drs. J.A. Los Hoorcollege, Werkcollege Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 22 van 66
Kunnen toepassen van basale calculustechnieken in vraagstukken. Vertalen van een eenvoudige praktijkbeschrijving naar een calculusopgave. Zelfstandig bestuderen van wiskundetekst in de Engelse taal. Functies van één reële veranderlijke: limiet, continuteit, afgeleide met toepassingen, l'hospital, primitieve, substitutie en partiële integratie, eenvoudige differentiaalvergelijkingen. Hoorcollege met werkcollege en wekelijkse digitale opgaven. Schriftelijk tentamen en wekelijkse digitale opgaven. De precieze regeling wordt via blackboard bekend gemaakt. Adams, Robert A, Calculus: a complete course, 7th Edition, Pearson, 2010. Let er bij de eventuele aanschaf van een tweedehands exemplaar op dat de kaart die toegang geeft tot de MathXL omgeving bij het boek aanwezig is! Aanbevolen voorkennis Basiswiskunde 1F, 1MNW, 1-SBI Calculus 2 Vakcode X_435002 (435002) Periode Periode 1+2 Credits 6.0 dr. W. Kager dr. W. Kager Hoorcollege, Werkcollege Kunnen berekenen van integralen, afgeleiden en extreme waarden van functies van meerdere variabelen, en de theorie hiervan beheersen. Kennen van de stelling van Taylor en deze kunnen toepassen. Beheersen van reeksen en machtreeksen, en machtreeksen kunnen toepassen om differentiaalvergelijkingen op te lossen. Differentiaal- en integraalrekening in meerdere variabelen, extreme waarden van functies van meerdere variabelen, reeksen en machtreeksen, stelling van Taylor, oplossen van differentiaalvergelijkingen met behulp van machtreeksen. Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 23 van 66
Hoorcollege en werkcollege. Schriftelijk in twee deeltentamens. R. Adams and C. Essex. Calculus: a complete course (7th. ed.) Aanvullende literatuur wordt tijdens het college verstrekt. 2MNW, 2S, 3-SBI, mi-sc, mi-bi Chemische diagnostiek en imaging Vakcode X_430554 (430554) Periode Periode 2 Credits 3.0 der Exacte Wetenschappen dr. F. Ariese dr. F. Ariese Hoorcollege, Werkcollege Het verwerven van begrip van de fysische-chemische achtergronden van moleculaire vibraties en technieken waarmee die kunnen worden bestudeerd. Het verkrijgen van inzicht in moderne toepassingsmogelijkheden van deze technieken in biomedisch onderzoek en klinische diagnose. Het leren lezen en verwerken van (Engelstalige) wetenschappelijke literatuur. Het leren presenteren in de Engelse taal. Moleculaire vibraties en daarop gebaseerde molecuul-specifieke technieken (infrarood en Raman) die gebruikt kunnen worden voor biomedisch analyse en imaging. Er wordt zowel aandacht besteed aan moderne technische ontwikkelingen als aan de informatie die met deze spectroscopische methodes kan worden verkregen. Zowel bij de hoor/werkcolleges als bij de literatuuropdracht staan (bio)medische toepassingen centraal. Geintegreerde hoor/werkcolleges over de achtergronden én toepassingen van de technieken. onderzoek met mondelinge presentatie. Handouts Differentiëren en integreren 3 Vakcode X_400577 (400577) Periode Periode 4 Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 24 van 66
Credits 3.0 dr. F. Pasquotto dr. F. Pasquotto Hoorcollege, Werkcollege Kunnen toepassen van basale calculus technieken in vraagstukken. Vertalen van een eenvoudige praktijkbeschrijving naar een calculus opgave. Zelfstandig bestuderen van wiskundetekst in de Engelse taal. Dubbele en herhaalde integralen, vectorvelden, lijn- en oppervlak-integralen van functies en vectorvelden, de stellingen van Green, Gauss en Stokes. Schriftelijk tentamen en wekelijkse opdrachten. Adams, R.A. en Essex, C., Calculus: a Complete Course, Seventh Edition. Pearson 2010. Aanbevolen voorkennis Differentiëren en integreren 1 en 2. 1W, 1N, 1WN EM Praktijk I Vakcode OM_EMPRI () Periode Periode 1 Credits 6.0 Onderwijscentrum VU drs. D.T.T. Kamsma Grondige kennismaking met het beroep van docent. De student observeert en verzorgt lessen en is betrokken bij andere leerling-gerichte activiteiten. Gedurende deze periode 28 dagdelen stage op school, in totaal worden minimaal 48 klassecontacturen gemaakt waarvan een aantal lessen zelfstandig wordt gegeven. Stage op een school voor voortgezet onderwijs, met name in onderbouw havo/vwo en vmbo-t Vrije Universiteit Amsterdam - der Exacte Wetenschappen - B Medische Natuurwetenschappen - 2011-2012 6-3-2013 - Pagina 25 van 66