Microbiologie. Begintermen

Transcriptie

1 Microbiologie

2 Microbiologie Aanbod: FW (Joris, Joelle), BIW (Chris, Els), BioMED (Jef), KULAK (Jef) Algemeen Studiepunten: 5 Onderwijstaal: Nederlands Niveau: Verdiepend Begeleidingsuren: 58.5 uren Periode: Wordt gedoceerd in het eerste semester Verantwoordelijke POC: Facultaire POC Wetenschappen Begintermen Voorafgaande basiskennis van celbiologie, biochemie en genetica, zoals aangereikt in de OPO s Celbiologie en biochemie (G0N04A) en Genetica (G0N12A), is wenselijk. Plaats in het onderwijsaanbod (~100 tal studenten) t 3 de Bachelor in de geologie (Minor biologie) (Verplicht) 3 de Bachelor in de geografie (Minor biologie) (Verplicht) 2 de Bachelor in de biochemie i en de biotechnologie i (Verplicht) 2 de Bachelor in de biologie (Verplicht)

3 Microbiologie hoorcollege Doelstellingen De voornaamste doelstelling is bij de studenten interesse opweken voor de fascinerende wereld van de microbiologie. De studenten verwerven een algemeen inzicht in de diversiteit van virussen, pro en eukaryote micro organismen waarbij ze de voornaamste onderlinge verschillen in bouw, biochemische en fysiologische eigenschappen kunnen relateren aan de veelzijdigheid van microbiëleactiviteiten en de adaptaties aan specifieke niches. Zij kunnen de belangrijkste verschillen en overeenkomsten tussen eubacteria, archaea en eukarya samenvatten en dit kaderen in een evolutionaire context. Zij kunnen algemene en specifieke microbiële metabole processen voor energiewinning beschrijven en relateren aan de habitat van micro organismen. Gaandeweg worden de studenten zich bewust van het belang van microbiologie voor fundamenteel onderzoek in een evolutionaire en ecologische context, alsook van het potentieel voor toepassingsgericht i technologisch honderzoek met applicaties i in de voeding, landbouw en medische sector. Zij kunnen dit beschrijven aan de hand van type voorbeelden uit de verschillende sectoren. Tijdens het bijbehorend verplichte practicum leren de studenten t basisprincipes i i en praktische vaardigheden d m.b.t. bt manipulatie, isolatie en identificatie van micro organismen..

4 Microbiologie Hoorcollege (3.6 stp) INTERACTIEF Practicum (1.4 stp) VERPLICHT TE VOLGEN. GEEN DEELNAME HET MONDELINGE EXAMEN INDIEN DE PRACTICUM REEKS NIET VOLLEDIG WERD AFGEWERKT. Zelfstudie project (cfr hoorcollege) POSTER Examen 3 VRAGEN MBT HOORCOLLEGE puntenverdeling OVEREENKOMST MET STUDENTEN Eindevaluatie puntenverdeling

5 Microbiologie hoorcollege Inhoud 1) Inleiding: Historiek, Microbiologie als fundamentele en toepassingsgerichte g wetenschap 2) Structuur en opbouw van prokaryote en eukaryote cellen 3) Overzicht evolutie en classificatie micro organismen: Eubacteria, Archaea, Eukarya. Kort overzicht van belangrijke bacteriële organismen, protisten, fungi en wieren, Technieken voor fylogenetisch onderzoek 4) Virussen: Structuur, levenszcyclus DNA en RNA virussen, detectie en kwantificatiemethoden 5) Microbiële groei: Meting microbiële groei, voor en nadelen batch cultuur versus continue cultuur, omgevingsparameters die groei beïnvloeden 6) Controle van microbiële groei: fysische sterilizatietechnieken, antibiotica, resistentiemechanismen, i i alternatieve bh behandelingsmethoden dli hd 7) Metabolische diversiteit: overzicht van de belangrijkste mechanismen voor energiewinning koolstofassimilatie, stikstof en CO2 fixatie 8) Microbiële ecologie: Terrestischeen aquatische hbitti habitatis, biogeochemischenutriëntcycli i h tië t

6 Microbiologie hoorcollege Brock: Biology of Microorganisms 12de editie Michael T. Madigan and John M. Martinko Prentice Hall Pearson International Edition

7 Microbiologie hoorcollege

8 Microbiologie presentatie hoorcollege Micro organismen vertegenwoordigen de grootste tt hoeveelheid idbiomassa op aardeen de grootste tt diversiteit van alle levende organismen essentieel voor afbraak organisch materiaal en recyclage van nutriënten kolonisatie van extreme habitats Microbiologie een fundamentele biologische wetenschap studie van biochemische en fysiologische processen een toegepaste biologische wetenschap geneeskunde landbouw industrie voeding, energie biotechnologie Video fragment Unseen Life SAR11: Pelagibacter ubique

9 Microbiologie presentatie hoorcollege Afmetingen van micro organismen:

10 Microbiologie presentatie hoorcollege Flagellen (zweepdraden) en beweeglijkheid meer dan 40 genen betrokken structurele proteïnen export van structurele proteïnen regulatie synthese synthese flagel groeit aan de tip( haargroei wortel) flagellinetransport via hol flagelkanaal uit cytoplasma naar tip gevolgd door zelf assemblage (geen ATP of enzymen nodig) flagellen groeien continu en breken geregeld af

11 Microbiologie practicum Doelstellingen Tijdens het practicum leren de studenten de noodzakelijke vaardigheden om micro biologisch onderzoek te verrichten. De studenten kunnen zelf enkele kl microbiologische technieken toepassen waarbij ze leren hoe micro organismen worden geïsoleerd, gekweekt en geïdentificeerd en hoe hun gevoeligheid tegenover antibiotica en fungiciden wordt bepaald. Inhoud (6 halve dagen) Isolatie van micro organismen en het maken van rijnculturen. Kweken en tellen van micro organismen. Meten van groei en het bepalen van de invloed van externe factoren op groei van microorganismen. Identificatie, bacteriën, gisten en schimmels a.d.h. van microscopische kleurtechnieken en biochemische testen. Het opstellen van resistentieprofielen. Studiemateriaal Presentaties Practicum handleiding

12 Microbiologie practicum Beschrijving leeractiviteit Permanente evaluatie: opstellen van verslagen Studenten werken in groepjes (3 à 4) met rotatie voor verslaggeving Examen 7 de practicum: identificatie micro organismen Individueel Open boek Practicum handleiding

13 Microbiologie posters Opdracht Poster over een microbiologisch onderwerp Species Ziekte toepassing Info Tekstboek, bib, web, docenten, ziekenhuis, bedrijf Begeleiding Document wetenschappelijke posters Ad hoc, tijdens les of practicum, docent Wetenschapscommunicatie Voorstelling 2 postersessies (even/oneven nummers) Abstract Beoordeling Medestudenten, docententeam, postdocs

14 Microbiologie posters Eindscore Gemiddelde studentenscores worden herschaald naar gemiddelde scores docenten/postdocs

15 Microbiologie posters

16 Microbiologie posters Samenvattingen posters Microbiologie

17 Microbiologie posters

18 Microbiologie examenovereenkomst Examenpunten Januari en September Practicum: 4 van de 20 punten, score op basis van de verslagen en practicumexamen Poster: 2 van de 20 punten, score op basis van student peer assessment en score begeleiders Mondeling examen: 14 van de 20 punten volgens onderstaande regeling Twee vragen op 5 en één vraag op (4): (0 2): de student heeft onvoldoende geantwoord, beheerst de leerstof niet en mist een minimaal inzicht (2): de student heeft correct geantwoord maar legt geen (of slechts minimaal) verbanden met de rest van de leerstof 3 4 (3): de student kan duidelijk het verband aantonen metandere delen in de cursus 4 5 (4): de student geeft blijk een terdege kennis en legt verbanden met andere cursussen of geeft blijk van bijkomende zelfstudie Wanneer de student geen voldoende haalt op het mondeling examen zal de eindscore naar het eerstvolgende lagere geheel getal worden afgerond. Voor studenten die wel een voldoende halen op het mondelinge gedeelte worden vanaf 5 tienden de punten naar boven afgerond, bij minder dan 5 tienden naar onder

19 Microbiologie examenpunten 2009/ NA