Olie/water grensvlakken gekarakteriseerd: een Moleculaire Dynamica studie

Vergelijkbare documenten
Structuur, vorm en dynamica van biologische membranen

94 Samenvatting te vervormen, wordt de huid bijzonder stijf bij grotere vervormingen. Uit onderzoek is gebleken dat deze eigenschap deels toe te schri

Love and Fear of Water: Water Dynamics around Charges and Apolar Solutes S.T. van der Post

Supersymmetric Lattice Models. Field Theory Correspondence, Integrabillity T.B. Fokkema


Hydrofobe staart. Leerlingopdracht

b Dikke shampoo komt moeilijk uit het flesje en verspreidt zich niet goed in je haar.

Samenvatting Scheikunde Hoofdstuk 1 en 2

1. Doe1 van het onderzoek

University of Groningen. Interfacial action of phospholipase A2 Meulenhoff, Peter

Nederlandse samenvatting

Biofysische chemie op computers: simulaties van celmembraan-modellen

Practicum algemeen. 1 Diagrammen maken 2 Lineair verband en evenredig verband 3 Het schrijven van een verslag

Samenvatting Scheikunde Hoofdstuk 2


Three-Dimensional Visualization of Contact Networks in Granular Material C.E. Carpentier

Dynamics of Water Interacting with Biomolecules C.C.M. Groot

Onderzoek naar aardbevingen en de relatie met activiteiten in de ondergrond

Samenvatting Scheikunde Hoofdstuk 1 t/m 4

5, waar gaat dit hoofdstuk over? 1.2 stoffen bij elkaar: wat kan er gebeuren? Samenvatting door een scholier 1438 woorden 31 maart 2010

Self-Assembly via Anisotropic Interactions. A.C. Newton

Moleculaire Gastronomie: Knettersuiker Het gedrag en gebruik van knettersuiker

Samenvatting. (summary in Dutch)

Sociale en culturele factoren in evacuatie simulaties. Dr. Natalie van der Wal

Samenvatting Scheikunde Hoofdstuk 1 + 2

Samenvatting. Figuur 2

9. Nederlandse Samenvatting

Nederlandse samenvatting


Een stof heeft altijd stofeigenschappen. Door hier gebruik van te maken, kun je stoffen makkelijk scheiden.

Scheidingsmethoden methode principe voorbeeld. destilleren verschil in kookpunt wijn whiskey. filtreren verschil in deeltjesgrootte koffie

De wijde wereld in wandelen

Vragen bij de activiteiten A 1 a Als het zout oplost, verdwijnt de vaste stof en ontstaat een heldere oplossing.

Samenvatting. de differentiatie van cellen;

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation

Een schoonheidsspecialist houdt zich bezig met het verfraaien en het verzorgen van het uiterlijk.

Nederlandse samenvatting voor geïnteresseerden buiten het vakgebied

Chemie van het keukenkastje

Samenvatting Chemie Overal 3 vwo. Hoofdstuk 2: Water. 2.1 Watervoorziening

Samenvatting. Samenvatting

Path-Metadynamics. A Computational Study of Conformational Transitions in Proteins G. Díaz Leines

subnanoseconde-tijdschaal.

Figuur 1. Representatie van de dubbele helix en de structuren van de verschillende basen.

Unificatie. Zwakke Kracht. electro-zwakke kracht. Electriciteit. Maxwell theorie. Magnetisme. Optica. Sterke Kracht. Speciale Relativiteitstheorie

Nederlandse samenvatting

Meting zonnepaneel. Voorbeeld berekening diodefactor: ( ) Als voorbeeld wordt deze formule uitgewerkt bij een spanning van 7 V en 0,76 A:

1 De bouw van stoffen

Samenvatting Chemie Overal 3 havo

CHEMIE OVERAL. Nieuw in 6e editie 2011 Chemie Overal 3h en 3v

Basiskennis en Basisvaardigheden IV (404)

Figuur 1. Schematisch overzicht van de structuur van het twee-stadia recourse model.

Verslag workshop 2 november 2018

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Intermezzo, De expressie van een eiwit.

Basiskennis en Basisvaardigheden II (245)

Gelijkwaardig verklaarde eindtermen natuurwetenschappen Voor de tweede graad ASO

Samenvatting NaSk Hoofdstuk 6: Stoffen en Moleculen

Scheikunde inhouden (PO-havo/vwo): Schaal, verhouding en hoeveelheid

ZETMEELFOLIE. 1. Onderzoeksvraag Hoe kunnen we met aardappelzetmeel folie maken?

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Samenvatting Scheikunde Hoofdstuk 1 + 2

Antwoorden deel 1. Scheikunde Chemie overal

BOUWSTENEN VAN HET LEVEN

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Nederlandse samenvatting voor geïnteresseerden buiten dit vakgebied

Practicum Emulsies. Leerdoelen

PTA scheikunde HAVO Belgisch park cohort

Wat gebeurt er met mijn oog?! Practicum veiligheid en experimenteel ontwerp

Waterweerstand. 1 Inleiding. VWO Bovenbouwpracticum Natuurkunde Practicumhandleiding

Analyseren van de stressreactie van de tuberculose bacterie om onderzoek naar nieuwe antibiotica te versnellen

Tentamen Statistische Thermodynamica MS&T 27/6/08

MYCOBACTERIËLE FACTOREN BETROKKEN BIJ GRANULOOMVORMING

De proef of de som? Computersimulaties als reëel alternatief voor fysieke testen. BPO, Alfard Jansen - 31 oktober 2006 RM symposium de toekomst nu

Examenprogramma scheikunde havo

PTA scheikunde Belgisch park cohort

Water? Hoezo water? Water! Hoezo water? Donderdag 24 mei 2018 WILDLANDS Adventure Zoo Emmen

Algemene samenvatting

Mayonaise oftewel de kunst van het heen-en-weer-denken

Botsingen. N.G. Schultheiss

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.

Cover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation

Verestering volgens Fischer gezien door Ben Erné, fysisch chemicus

QUANTUMFYSICA FOTOSYNTHESE. Naam: Klas: Datum:

Appendices. Nederlandse samenvatting

Basisscheikunde voor het hbo ISBN e druk Uitgeverij Syntax media

math inside Model orde reductie

Samenvatting Scheikunde H6 Water (Chemie)

Proef Scheikunde Joodconcentratie & reactiesnelheid

Proef Natuurkunde Stoot en impuls verandering

De logica van bacteriele groei

Studentnummer: Schrijf je naam en studentnummer op elk vel. Omcirkel het juiste antwoord.

Onderzoeksthema: DNA extractie uit levende cellen (kiwi) (6 jaar) C. Schramme

SAMENVATTING Technische mengsels van vetoplosbare polychloorbifenylen (PCBs) zijn gebruikt als vloeistof in transformatoren, condensatoren en als

Examenprogramma scheikunde vwo

Figure 7.10: Schematische tekening van transport in de cel a) Motoreiwitten transporteren lading, in de vorm van kleine stukjes membraan (zowel

XXX INTERNATIONALE NATUURKUNDE OLYMPIADE PADUA, ITALIË PRACTICUM-TOETS

Afsluitende les. leerlingenhandleiding. Tandenstokerase +

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN FACULTEIT WERKTUIGBOUWKUNDE DIVISIE COMPUTATIONAL AND EXPERIMENTAL MECHANICS

Nederlandse Samenvatting

Toelatingstoets havoniveau natuurkunde max. 42 p, vold 24 p

Transcriptie:

Samenvatting Olie/water grensvlakken gekarakteriseerd: een Moleculaire Dynamica studie Bovenstaande is de vrije vertaling van de titel op de omslag van dit proefschrift. Aan de hand van deze samenvatting zal ik proberen duidelijk te maken waar deze titel voor staat. Ik zal mij hier beperken tot een wat meer plastische uitleg, om ook voor de wat minder scheikundig onderlegde lezer begrijpelijk te houden waar ik mij vier jaar lang mee bezig heb gehouden. Velen ergeren zich dagelijks aan de reclames van was- en schoonmaakmiddelen en de onzin die er in verteld wordt. Toch is er een link tussen die waspoeders in deze reclames en dit proefschrift: de link is Unilever, producent van wasmiddelen, bijbehorende reclamecampagnes en geldschieter van het onderzoek dat geleid heeft tot dit proefschrift. De interesse van Unilever voor fundamenteel onderzoek naar wasmiddelen komt voort uit de behoefte aan gedetailleerde gegevens over en inzicht in de werking van wasmiddelen. Er is een constante vraag van zowel consument als producent naar nieuwe of verbeterde ingrediënten. Door nieuwe onderzoeks- en analysemethodes is het mogelijk meer inzicht te verkrijgen in de (fysische) eigenschappen van zowel oud als nieuw te gebruiken stoffen. Schoonmaakmiddelen bestaan voor een gedeelte uit enzymen en zouten en voor een groot gedeelte uit surfactants (ook wel oppervlakte-actieve stoffen genoemd) die zorgen dat het vuil uit de kleren via het water weer verdwijnt. Dit vuil bestaat vooral uit vetten of substanties met vettige componenten (zoals olie). Hoe het wasproces in zijn algemeenheid verloopt is goed bekend en dit is weergegeven in Figuur 7.1. Het wasproces is vooral gebaseerd op de tweeslachtigheid van de surfactant: één deel (de hydrofiele kopgroep) lost alleen goed op in water, het andere deel (de hydrofobe staart) lost alleen goed op in olie/vet. Hierdoor is het mogelijk dat de surfactants tegelijkertijd met hun staart in de olie en met hun kopgroep in het water steken. Dit specifieke gedrag van surfactants op het grensvlak van olie en water heeft effect op bepaalde eigenschappen van dit grensvlak. Tussen olie en water bestaat bijvoorbeeld een bepaalde spanning (de zogenaamde oppervlaktespanning) die er voor zorgt dat ze niet mengen. Surfactants verlagen deze oppervlaktespanning. Wanneer er voldoende surfactants in de olie steken, ontstaat er een hydrofiele (kopgroep)laag over de hydrofobe olielaag. Dit is te vergelijken met een speldenkussen dat wordt volgeprikt met spelden waar een speldekop op zit. Door deze omsluitende hydrofiele laag is het mogelijk om een bolletje olie/vet in het water op te lossen. Om een goed inzicht te krijgen in de invloed van surfactants op het olie/water grensvlak, is het uiteraard ook essentieel om een goede beschrijving van dit grensvlak zelf te hebben. Dàt is nu waar dit proefschrift over gaat, de beschrijving van het olie/water grensvlak, zowel mèt als zonder 133

134 SAMENVATTING surfactants. De methode die we gebruikt hebben om tot zo n beschrijving te komen is Moleculaire Dynamica. surfactant was poeder in water oplosbare kopgroep RuG in olie/vet oplosbare staart water water vet vet stof stof Figure 7.1: Een schematische weergave van de werking van waspoeder: de staart van de surfactant steekt in de olie- of vetlaag en de kopgroep in het water. Hierdoor ontstaat een laag over het vuil en lijkt het voor het water alsof het vuil in water oplosbaar is. Moleculaire Dynamica Scheikunde wordt vaak met witte jassen, reageerbuizen en borrelende potjes geassocieerd. Dat computers hierbij tegenwoordig een belangrijke rol spelen is minder bekend. Vooral de opmars van computersimulaties heeft de laatste jaren bijgedragen aan het begrip van het gedrag van allerlei (biologische) systemen. De Moleculaire Dynamica simulatietechniek, MD in het kort, is hier een voorbeeld van. MD wordt dus uitgevoerd met computers en niet achter een zuurkast of in reageerbuisjes, zoals dat het geval is bij de natte chemie. Met MD worden de bewegingen (de dynamica) van een bepaald systeem gevolgd in de tijd. De techniek is gebaseerd op de Wet van Newton: F = m a, kracht is massa maal versnelling. Het is goed mogelijk de bewegingen van twee voorwerpen ten opzichte van elkaar in de tijd te

SAMENVATTING 135 berekenen met de klassieke mechanica. Neem als systeem bijvoorbeeld twee biljartballen op een biljarttafel. Wanneer de ene een stoot krijgt, is precies uit te rekenen wat er met de ander gebeurt. Voor drie ballen wordt dat al een stuk lastiger. Voor een paar duizend ballen (op een enorm groot laken) wordt het een onmogelijke opgave en hebben we een computer nodig die de bewegingen uitrekent en bijhoudt. De systemen die we met MD onderzoeken kunnen variëren van enkele moleculen tot complexe eiwit- of DNA-systemen. Dus door gebruik te maken van natuurkundige wetten, kunnen we met de computer de dynamica en daarmee de eigenschappen van bepaalde (chemische) systemen onderzoeken. De schaal waarop met MD gewerkt wordt is erg klein zoals uit Figuur 7.1 kan worden opgemaakt. Het wordt dan ook wel microscopische schaal genoemd. Je kunt je het voorstellen als iets dat sterk wordt uitvergroot, bijvoorbeeld door er met een enorm sterke microscoop naar te kijken. Water ziet er dan niet meer uit als een vloeistof, maar als aparte moleculen die echter nog wèl de eigenschappen van de vloeistof hebben. Om het met een voorbeeld te verduidelijken: een organicus die een proef uitvoert zal al gauw een bekerglas met enkele honderden mililiters water gebruiken, terwijl een MD-simulator enkele honderden water moleculen gebruikt. Honderd mililiter water bevat zo n 33 10 23 moleculen (dat is 33 met nog 23 nullen)! Dit geeft al aan dat het met de huidige computercapaciteit niet mogelijk is enkele honderden mililiters water te simuleren. Hetzelfde geldt ook voor het verschil in tijdschaal: de reeds eerder genoemde organicus wacht soms enkele uren om een reaktie te laten verlopen, een MD-simulator kijkt naar een tijdsduur van nanoseconden (1 nanoseconde= 10 9 seconde). We veronderstellen dat het toch mogelijk is om met statistische mechanica relaties te leggen tussen het microscopische gedrag en de macroscopische eigenschappen, ondanks het verschil in schaal. Dit betekent dus dat we de gegevens die we met behulp van MD-simulaties kunnen berekenen, kunnen vergelijken met experimentele metingen zoals dichtheid, druk, diffusie, etc. Doel van dit onderzoek Unilever Research Laboratorium Vlaardingen (URL) was de eigenlijke geldschieter van dit promotieonderzoek en het gestelde doel was tweeledig: ten eerste was het de bedoeling om de Moleculaire Dynamica simulatietechniek toe te passen op biologisch afbreekbare surfactants op het olie/water grensvlak, om zo inzicht te krijgen in de functie en eigenschappen van deze surfactants. Ten tweede moest het gedrag tussen de surfactants op een erg gedetailleerd (moleculair/atomair) niveau onderzocht worden om iets meer te kunnen zeggen over het hoe en waarom op het olie/water grensvlak. Deze twee doelstellingen gecombineerd hebben uiteindelijk geleid tot de beschrijving en karakterisering van het olie/water grensvlak. De indeling van dit proefschrift Aan de hand van een korte beschrijving van elk hoofdstuk zal ik een overzicht geven van de inhoud van dit boekwerk(je). Waarschijnlijk is dit deel van deze samenvatting het minst begrijpelijk voor de leek.

136 SAMENVATTING Hoofdstuk 2: Het dekaan/water grensvlak Dit hoofdstuk is de basis van het proefschrift. Hierin wordt uitgelegd welke invoergegevens (parameters) gebruikt zijn in de simulaties. De simulaties werden uitgevoerd met een computerprogramma, GROMOS genaamd. In de loop van mijn onderzoek hebben we dat programma, en de bijbehorende parameters, aangepast omdat bleek dat bij een simulatie van olie met een keten van 10 koolstofatomen (dekaan) en water, de olie oploste in water. Dit is in werkelijkheid niet mogelijk. Na allerlei testen waarin de berekeningen werden vergeleken met experimentele gegevens, ontdekten we dat vooral de breedte van het grensvlak als ook de oppervlaktespanning zeer gevoelig waren voor de simulatieparameters en werd besloten met verbeterde parameters verder te simuleren. Hoofdstuk 3: Surfactanten op het decaan/water grensvlak Op het dekaan/water grensvlak, zoals beschreven in hoofdstuk 2, werden surfactants als een aanéénsluitende laag (monolaag) geplaatst. Deze surfactants worden in vele (biochemische) experimenten gebruikt. Ze zijn bovendien biologisch afbreekbaar, mede omdat hun kopgroep uit een suikergroep (glucose) bestaat. Er worden twee monolaagsimulaties beschreven van twee typen surfactants, elk met een andere glucosekopgroep. Het doel was om het verschillende gedrag, dat bekend was uit experimentele gegevens, van beide surfactants te onderzoeken. Het bleek dat vooral de hoek tussen de staart en de kopgroep bepalend was voor onder meer de manier waarop de surfactants een monolaag kunnen vormen en met welke dichtheid dit gebeurt. Dit was een resultaat dat niet eerder in theoretische modellen voor het gedrag van surfactants aan grensvlakken was beschreven. Hoofdstuk 4: Het diglyceride/water grensvlak Dit hoofdstuk beschrijft veel langere simulaties dan de vorige hoofdstukken. De simulaties werden uitgevoerd op de zogenaamde GROmacs machine, een krachtige parallelle computer, die in ons lab werd ontwikkeld. Een simulatie met een lengte van één nanoseconde vergde eerst enkele maanden rekentijd, maar met de parallelle machine slechts enkele dagen. Deze extra rekenkracht stelde ons in staat om grotere systemen en ook langere tijdsintervallen te simuleren. Door de eerdere resultaten waren we er zeker van dat onze simulatiemethode en de gebruikte parameters betrouwbare resultaten opleverden. Hierdoor konden we van een diglyceride/water systeem, waar experimenteel bijna niets over bekend was, het grensvlak karakteriseren en het gedrag voorspellen. De onderzochte diglycerides zijn een belangrijk bestanddeel van oliën en vetten. De langere simulaties lieten vooral zien op welke tijdschaal een diglyceridesysteem vanuit een niet-stabiele toestand in een evenwichtstoestand kon geraken. Dit bleek binnen enkele nanoseconden te gebeuren. Hoofdstuk 5: Verschillende water grensvlakken vergeleken In dit hoofdstuk zijn allerlei simulaties van grensvlakken, die uitgevoerd werden in onze groep, met elkaar vergeleken om tot een algemene beschrijving van olie/water grensvlakken te komen. De simulaties varieerden van simpele systemen als dekaan/water tot complexere systemen, zoals membranen (die bijvoorbeeld de celwand vormen). Het bleek dat het verschil in kopgroep

SAMENVATTING 137 bepalend was voor de breedte en daarmee ook de oneffenheid van het grensvlak. Hoe hydrofieler en groter de kopgroep, hoe ruwer het grensvlak. Verder waren we in staat om een tijdschaal op te stellen voor het grensvlak, door de beweeglijkheid van de verschillende oliemoleculen te vergelijken. Deze tijdschaal geeft de snellere als mede de langzamere bewegingen aan op het grensvlak, die bepalend zijn voor het instellen van het evenwicht tussen olie en water. Hoofdstuk 6: De effecten van hydrolyseproducten op het diglyceride/water grensvlak Zoals eerder vermeld kunnen waspoeders ook enzymen bevatten. Dit zijn eiwitten (lipasen) die vetten op een bepaalde plaats kapot kunnen knippen. Dit knippen wordt hydrolyse genoemd. In hoofdstuk 4 werden diglycerides gesimuleerd. Wanneer een lipase zo n diglyceride kapot knipt (hydrolyseert), ontstaan monoglycerides (mono is één, di is twee staarten) en vetzuren. Deze hydrolyseproducten hebben invloed op de eigenschappen van het grensvlak. Het is bijvoorbeeld bekend dat dit soort producten effect hebben op de oppervlaktespanning. Deze wordt verlaagd, waardoor het grensvlak oneffener wordt. Dus de olie krijgt onder invloed van de surfactants de neiging met het water te mengen (zie Figuur 7.1). Verder is het belangrijk om te onderzoeken wat het gedrag is van de producten ten opzichte van elkaar. De resultaten werden vergeleken met het pure diglyceride/watergrensvlak uit hoofdstuk 4. De simulaties toonden aan dat de hydrolyseproducten inderdaad de oppervlaktespanning verlaagden en de ordening van de glycerides deed toenemen, wat resulteerde in een ruwer en breder grensvlak. De producten vormden geen clusters of groepen onderling, maar waren erg verspreid. Hoofdstuk 7: Conclusies Dit laatste hoofdstuk bevat de algemene conclusies van mijn vierjarige onderzoek, een evaluatie van MD als methode en een soort prognose voor toekomstig onderzoek van vergelijkbare systemen. Door de snelheid waarmee de computers zich ontwikkelen, is met name een prognose moeilijk op te stellen. Vooral door de extra rekenkracht die ontstaat, zijn we in staat om langere simulaties uit te voeren met grotere systemen. Maar de invoergegevens die we gebruiken voor deze nieuwe generatie simulaties zijn getest voor kleinere systemen en kortere simulaties. De vraag werpt zich dan ook op of de methode en de invoergegevens nog steeds accuraat zijn wanneer bijvoorbeeld langer gesimuleerd wordt. Ik wil me in deze samenvatting verder echter niet met deze specialistische vraag bezighouden, dat zou het doel van deze samenvatting voorbij schieten. Afsluitend wil ik opmerken dat computersimulaties een grote bijdrage kunnen leveren aan het begrijpen en verklaren van fysische processen en het gedrag van systemen. Maar bovenal ligt de toekomst van computersimulaties naar mijn mening in het combineren van verschillende simulatiemethoden. Simulaties moeten alleen niet gezien worden als complete vervanging van natte experimenten, maar meer als een aanvulling hierop. De ontwikkeling van de zogenaamde Computational Chemistry zal mede afhankelijk zijn van een goede interdisciplinaire samenwerking en communicatie tussen experimentalisten en simulatoren. De toekomst zal het hopelijk leren.