Synthese van Glycopeptiden als

Maat: px

Weergave met pagina beginnen:

Download "Synthese van Glycopeptiden als"

Joris van Veen
6 jaren geleden
Aantal bezoeken:

1 Synthese van Glycopeptiden als Mimetica

2 Inhoudsopgave Titel Pagina INHOUDSOPGAVE...^ SAMENVATTING...3 SUMMARY...5 GEBRUIKTE AFKORTINGEN...? HOOFDSTUK INLEIDING EN THEORIE Algemene Inleiding Collageen: de basis voor dit onderzoek

3 Samenvatting Collageen

4 Door deze bouwstenen

5 Summary Collagen is a fibril-like protein which has unique mechanical properties. Investigation of the foldingmechanism (which leads to its typical triple-helix) and stractural properties is important and can lead

6 By using these building blocks

7 Gebruikte Afkortingen Aminozuren Amp = 4/?-aminoproline Asp = asparaginezuur Flp = 4^-fluoroproline Glu = glutaminezuur Gly = glycine Hyp

8 Hoofdstuk

9 Binnen

10 Zowel

11 1.2. Glycopeptiden:

12 In figuur 1.3 staat links de reeds gepubliceerde structuur en rechts de structuur van het te synthetiseren analoog. Het verschil in structuur is gering en vandaar dat wordt gedacht dat deze Af-binding een goed alternatief is voor de moeilijk toegankelijke O-binding. H0 OH O-binding A/-binding Figuur

13 harsbolletjes glasfilter... Afval Figuur

14 Omdat veel monomeren

15 1.4. Literatuurlijst 1. J.F.J. Engbersen en L. De Groot, Inleiding in de bio-organische chemie, 6 e verbeterde druk, Wageningen Pers, Wageningen, R.T. Morrison and R.N. Boyd, Organic Chemistry, 6 editie, Prentice Hall Intemational, New York, 1992.

16 27. H.P. Bachinger and D.E. Mechling, The Collagen-like Peptide (GER)i 5 GPCCG Forms ph-dependent Covalently Linked Triple Helical Trimers,

17 Hoofdstuk

18 2.2. Synthese

19 2.3. Synthese Glycopeptiden Zoals in de inleiding van dit hoofdstuk al is gezegd, moeten de amino koolhydraten worden gekoppeld aan aminozuren. Voor het genereren van een amide binding moeten de aminozuren die voor deze koppeling in aanmerking komen een carbonzuur in de zijketen hebben. In de natuur komen twee van zulke aminozuren voor: asparaginezuur en glutaminezuur. Deze twee dienen dusdanig gemodificeerd te worden dat het enige carbonzuur dat kan reageren zich in de zijketen bevindt en niet het a- carbonzuur is. In onderstaand schema (figuur 2.2) wordt de aanpassing van deze twee aminozuren beschreven evenals de koppeling met de voor peptiden geschikt gemaakte koolhydraten. "AcO 10 AcO

20 Door deze procedure te herhalen voor de vier verschillende voor peptiden geschikt gemaakte koolhydraten met de twee verschillende aminozuren werden in dit geval acht verschillende monomeren verkregen (10 1 a-d

21 2.5. Experimenteel gedeelte Algemene opmerkingen Tenzij anders vermeld zijn de gebruikte chemicaliën verkregen uit commerciële bron en gebruikt zonder verdere zuivering.

22 1,2,3,4,6-penta-O-acetyl-D-galactose

23 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-l-p-azide-D-glucose 4a (13 en 46 mmol). 3,01 en 13,74 g witte naaldkristallen; opbrengst 62 en 80 %, Rf (EtOAc:hexaan -1:1) = 0,45. ^- (CDC1 3 ):

24 Synthese van de verschillende glycopeptide monomeren Algemene procedure voor de l-butylester bescherming van carbonzuren Het aminozuur (10 mmol; 4,46 g voor Asp en 4,59 g voor Glu) werd opgelost in 15 ml pyridine en gekoeld tot -10

25 Algemene procedure voor

26 Fmoc-Asp(P-D-mannose)-O(Bu 9*c (2,0 tnmol). 0,34 g wit schuim werd verkregen na kolomchromatografie (loopvloeistof EtOAcrhexaan -1:1), opbrengst 23%, R f (5% MeOH/DCM) = 0,43. 'H-NMR (CDC1 3 ): 8 = 1,41-1,47 (C(CH 3 ) 3, s, 9H), 1,98-2,28 (OC=O-CH 3, m, 12H), 2,75-2,93 (C P H 2>

27 Fmoc-GluO-D-galactose)-OH U?b (0,2 mmol). 0,11

28 Hoofdstuk 3 Synthese van het Fragment Gly-Pro 3.1. Inleiding Het doel van dit onderzoek was de synthese van nimetica van Gly-Pro-Thr( 3Gal). De synthese van de bouwsteen voor

29 3.2. Synthese van het Gly-Pro fragment Als uitgangsstof werd het aminozuur L-Proline 11 genomen, hierin is zowel het amine als het carbonzuur onbeschermd. Allereerst werd

30 3.4. Experimenteel Algemene opmerkingen Zie voor de algemene opmerkingen horende bij dit hoofdstuk de algemene opmerkingen zoals die weergegeven zijn

31 H-Pro-O*Bu 14 (60 mmol). 10,33 g witte vaste stof, opbrengst 100%, Rf (5% MeOH/DCM en een spoortje Et 3 N) = 0,19. ^- (CDC1 3 ): 8 = 1,44-1,48 (C(C# 3 ) 3, s, 9H), 1,67-2,15 (C p ff 2 en C?H 2, m en m, 2H en 2H), 2,36 (N#, s, 1H), 2,83-2,91

32 Hoofdstuk

33 Tijdens het uitvoeren van deze restreacties zijn ook nog enkele niet voorziene problemen opgelost.

34 4.3. Resultaat Het uiteindelijk ontwikkelde protocol kan in een eenvoudig schema worden weergegeven aangezien de beoogde glycopeptiden een repeterende tripeptide eenheid bevatten. In onderstaande figuur wordt dit protocol getoond. Fmoc- jrink]- 20% piperidine/nmp (2*8') Elke stap wordt gevolgd door wassen met NMP en DCM (beide voor

35 Na 45 minuten werden deze reagentia verwijderd en kon de koppeling gecontroleerd worden. Is deze succesvol verlopen

36 4.4. Voorbeeld

37 Figuur Minules

38 De afwezigheid

39 4.6. Experimenteel gedeelte Algemene opmerkingen Voor

40 Hoofdstuk 5 Conclusies & Suggesties voor verder onderzoek De synthese

41 Appendix A: Inductief effect vs. water netwerk Hydroxyproline speelt een belangrijke rol in de stabilisering van de triple helix. (Pro-Hyp-Gly)i smelt bij 58 C terwijl (Pro-Pro-Gly)io smelt

42 Figuur A.2 - Stereo beeld van het waterstofbrug netwerk. Twee door symmetrie gerelateerde triple helices en hun waterstofbrug interacties (gestippelde lijnen) zijn weergegeven.

43 Appendix

Vergelijkbare documenten

a) Teken molecuul I op het antwoordblad en omcirkel alle stereocentra.(5)

a) Teken molecuul I op het antwoordblad en omcirkel alle stereocentra.(5) Hertentamen Bio-organische Chemie (8RB19) Maandag, 30 juni, 2014, 14:00 17:00 (3 uur) Bij het begin van elke opgave staat het aantal punten dat te verdienen is en de geadviseerde tijdsbesteding. Er zijn