PASTAS: OPEN SOURCE TIJDREEKSANALYSE

Maat: px

Weergave met pagina beginnen:

Download "PASTAS: OPEN SOURCE TIJDREEKSANALYSE"

Lander Jeroen van der Horst
6 jaren geleden
Aantal bezoeken:

1 PASTAS: OPEN SOURCE TIJDREEKSANALYSE NHV Middag - Open Source Software in de hydrologie R.A. Collenteur, M. Bakker, R. Caljé, F. Schaars NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 1

2 TIJDREEKSMODEL Bijvoorbeeld: Het verklaren van de grondwaterstand met neerslag en verdamping Tijdreeksmodel NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 2

3 TIJDREEKSMODEL: NEERSLAG EN VERDAMPING NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 3

4 TIJDREEKSMODEL: GRONDWATERWINNINGEN NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 4

5 WAT IS PASTAS? Een open source python package voor het uitvoeren van tijdreeksanalyse van hydrologische tijdreeksen *PASTAS = Python Applied Statistical Timeseries Analysis Software NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 5

6 AANLEIDING TOT ONTWIKKELING PASTAS Wetenschappelijk Faciliteren nieuwe inhoudelijke ontwikkelingen Reproduceerbaar Praktisch Scripts Nieuwe toepassingen NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 6

monitoringsnetwerk van Brabant Water: ~ 2000

7 TIJDREEKSANALYSE OP MONITORINGSNETWERK Diepte peilfilter [m] Analyse op het totale hydrologische monitoringsnetwerk van Brabant Water: ~ 2000 peilfilters NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 7

8 OPTIMALISATIES / STATISTIEKEN Optimalisatie keuzen: starttijd, eindtijd, frequentie, warmup periode, solver, foutenmodel, gewichten, initiele waarden.. Statistieken: EVP, RMSE, RMSI, GxG, Pearson-R, SSE, AIC, BIC NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 8

PASTAS OP GITHUB Code gehost op Github: https://github.

9 PASTAS OP GITHUB Code gehost op Github: Master Branch: Stabiele versie Dev Branch: Ontwikkel versie NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 9

10 8 KENMERKEN VAN GOEDE SOFTWARE (VOLGENS ONTWIKKELAARS*) 1. Het programma werkt 2. De code is makkelijk te lezen 3. De programmatuur is te testen 4. De software is eenvoudig te onderhouden 5. De code is plezierig om naar te kijken 6. De software is eenvoudig aanpasbaar 7. Het programma is simpel 8. De programmatuur is efficiënt * NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE

11 CODE KWALITEIT Gebruik maken van codeer stijl conventies (bv. PEP8 in Python) Automatische tests voor elke code update met Travis CI Gratis voor open source projecten TO DO: Schrijven van tests NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 11

12 SUCCESVOLLE INGREDIËNTEN OS SOFTWARE? 1. Makkelijke installatie 2. Software design voor intuïtief gebruik 3. Gebruiksvriendelijk 4. Goede voorbeelden 5. Goede documentatie 6. Plek voor vragen/bugs 7. Versiebeheer NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 12

13 MAKKELIJKE INSTALLATIE >>> Pip install pastas NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 13

14 EEN GOED BEGIN. IS HET HALVE WERK Software design (voor intuïtief gebruik) owat moet het kunnen? o Welke dingen moet het in de toekomst kunnen? o Hoe moet het worden gebruikt? 1 e Pastas-overleg, 5 april NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 14

15 VISUALISATIES Verschillende standard plots aanwezig Gemakkelijk zelf te visualiseren met Python NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 15

16 DOCUMENTATIE (Docs: pastas.readthedocs.io) Documentatie gratis gehost op ReadTheDocs Automatisch geüpdatet na elke update op de Github repository Te vinden: Voorbeelden Uitleg van installatie API-Docs NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 16

17 DOCUMENTEREN VAN (PYTHON) CODE Documentatie van de software wordt automatisch gemaakt vanuit de Docstrings in de Python code met behulp van Sphinx-Doc ( NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 17

18 VERSIEBEHEER Versies worden uitgebracht na grote veranderingen Bevordert nadenken over back compatibility NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 18

19 INTERACTIE MET DE GEBRUIKER Github Issues voor het reporten van Bugs en Verbeteringen Vragen en Tips via StackOverflow (maar dat werkt nog niet echt) NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 19

20 GEBRUIKERS ZOEKEN, VINDEN EN VASTHOUDEN Msc. Geohydrologie TU Delft Pastas workshop Werk samen Met andere OS Software Bv. HKVFEWSPY NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 20

21 TOEKOMSTPLANNEN Inhoudelijk Niet-lineairiteit Toetsen op Statistische aannames Technisch Database voor tijdreeks(modellen) Gebruikersinteractie: Duidelijke plek voor vragen en antwoorden (werkt StackOverflow?) Organiseren van jaarlijkse Pastas cursussen en bijeenkomsten NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 21

22 TAKE HOME MESSAGE 1. Denk goed na over software design voor je begint 2. Houd de code leesbaar, begrijpelijk en netjes 3. Zorg voor goede voorbeelden 4. Zoek actief contact met de gebruiker NHV OPEN SOURCE SOFTWARE IN DE HYDROLOGIE 22

Vergelijkbare documenten

Over autocorrelatie van tijdreeksmodellen met niet-equidistante tijdstappen

Over autocorrelatie van tijdreeksmodellen met niet-equidistante tijdstappen 0 Opdrachtgever: Brabant Water 2018 Artesia B.V. Projectnummer: 18.05.16 Datum: 2018-11-10 Auteur(s): R.A. Collenteur, MSc. Borging: