Dr. Peter Vercauteren Hoofd KI/ET CRV Genomics
Deze presentatie Genomic selection bij melkvee vleesvee Implementatie in de fokprogramma s Waar we tegen aan lopen Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 2
MELKVEE
Wat is merkerselectie? chromosoom 30 chromosomen van vader 30 chromosomen van moeder genoom DNA...CAGTCAGTCGTACCAGTCT 3.000.000.000 x Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 4
Wat is merkerselectie?...cagtcagtcgtaccagtct...cagtcagtagtaccagtct Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 5 50.000 merkers
Wat is merkerselectie? Van merkers naar fokwaarden Referentiepopulatie 20.000 stieren met dochters & DNA we weten hoe goed ze zijn we weten welk DNA ze hebben welk DNA is goed? Meer referentiestieren = meer betrouwbaarheid Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 6
Fokwaarde o.b.v. dochters Zwartbont, Kg eiwit 80 60 40 20 0-80 -60-40 -20 0 20 40 60 80-20 -40-60 -80 Afstammingsindex Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 7
Fokwaarde o.b.v. dochters Zwartbont, Kg eiwit 80 60 40 20 0-80 -60-40 -20 0 20 40 60 80-20 -40-60 -80 Genoomfokwaarde Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 8
Extra betrouwbaarheid door merkers Kg melk Kg vet Kg eiwit Frame Robuustheid Uier Benen Totaal Levensduur Celgetal Vruchtbaarheid Klauwgezondheid 11 16 24 27 22 26 22 34 31 33 31 43 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 9
Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 10
Genomic selection. Werkt t? R = 60% is veel meer dan 30% R = 60% is nog lang geen 100% dicht bij index op basis van dochters Waar loop je meer risico mee? R= 85% dan 180 NVI zit tussen 160 en 200 R=60% dan 220 NVI zit tussen 160 en 280 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 11
Fokprogramma West Europa CRV produceert/verkoopt 5500 embryo s 25% aankoop embryo s 1500 InSire embryo s 50% Delta embryo s 4000 InSire embryo s 1500 ZB stierkalveren 100 ZB InSire 600 RB stierkalveren 40 RB InSire idem voor vrouwelijke dieren donoren voor embryo s (spoel/ivp) 50 embryo s/donor ( selectie 1/15) selectie 100% op basis genomics staalname direct na geboorte selectie 1/15 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 12
Stiervaders ZB Stier V MV melk %v %e inet uier benen tot lvd cel vru nvi Danillo Goldwyn O Man 680 0.10 0.04 99 112 110 115 407 106 100 232 Leko Laudan Jocko 1253-0.27-0.11 83 104 107 106 532 108 98 180 Morningview Levi Buckeye O Man 1196-0.02 0.01 140 104 105 107 375 109 105 252 Ramado Ramos Aaron 1093-0.07 0.00 123 105 101 106 347 110 101 196 Va-Early-Dawn Sudan Cri Jammer Sailor 1269 0.06-0.10 109 105 107 110 337 103 99 179 Abtshoeve Lucky Legend Shottle 1162 0.01-0.04 117 107 105 110 504 110 98 213 Caps Sunset Diamond Goldwyn 850 0.02-0.05 81 114 107 114 588 109 100 241 Cookiecutter Mom Hunter Man-O-Man Shottle 1636-0.13-0.08 144 111 104 111 398 105 98 225 Delta Casino Cricket Mascol 1305-0.34-0.11 81 108 106 109 711 112 100 233 Delta Edison Peinzer Boy Paramount 506-0.36 0.02 42 112 110 113 776 107 101 237 Delta Gravity Gibor Ramos -82-0.14 0.08 11 110 107 108 781 107 106 227 Delta Ligretto Peinzer Boy Paramount 100 0.15 0.15 73 106 109 108 716 107 101 228 Elagaaster Packman Bogart Jordan 605 0.16 0.15 135 105 106 101 106 103 107 273 Vero Goliath Goli Paramount 2041-0.40-0.11 158 111 104 110 684 113 98 287 Willem's Hoeve R Ajax Man-O-Man Mascol 1528-0.16 0.06 187 106 107 110 390 102 99 253 Klassic Big Time Mac Shottle Mr Chassity Gold Chip-ET Goldwyn Shottle Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 13
Fokprogramma TPI 500 stierkalveren 30 InSire (1:15) 20 uit USA + 10 uit Europa USA stieren bij Sexing Technologies alle stieren worden getest in Tsjechië Beperkt toegang tot genomic testen in USA Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 14
Fokprogramma Genomic selection werkt, met R = 60% GS om beste donoren en stieren te vinden >75% fokprogramma via InSire embryo s Breed fokdoel, met aandacht voor inteelt Op de stierenkaart staan deels stieren zonder dochters ( hogenvi, top) Merkertesten uitgevoerd in Luik CRV berekent merkereffect (eigen onderzoek) CRV is eigenaar gegevens Vanaf 2013 vrij Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 15
DNA-testen voor erfelijke gebreken MELKVEE BLAD, CVM, BY, MF Red factor Zijn zeldzaam geworden door registratie en stieradviesprogramma s Onderzoek bij VHL op vraag fokorganisaties Alle gegevens in stamboekregistratiesysteem Geregeld in fokkerijbesluit en stamboekreglement Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 16
VLEESVEE
7 erfelijke gebreken CMD1 = veau planché, SMA CMD2 = electrische kalveren SQT = kromme staart syndroom (dwerggroei) GGG = genetisch gemodificeerde groei ( dwergroei of nanisme proportionné) overdracht (GP) hamartoom (HAM) Arthrogrypose (SA) Voor deze 7 is een test beschikbaar in Luik 5 via directe test, 2 via indirect test Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 18
Wat doen ki-centra Er worden geen dragers meer ingezet = afspraak met stamboek Positieve stieren worden niet meer actief vermarkt 30 à 40% stieren waren dragers en zijn weg Veel goede pedigrees zijn verloren Geplande koppelingen en gebruik ET om goede + pedigrees toch niet te verliezen Niet simpel om KI-stieren te vinden als 70% drager is Aantal dragers daalt sterk Publicatie door stamboek van ki-stieren die drager zijn Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 19
Wat doen fokkers? Wegens te duur worden alleen op vraag dieren (deels) getest Staal gaat rechtstreeks naar lab Veehouder krijgt resultaat Komt niet in stamboeksystemen Dragers komen bewust en onbewust in de fokkerij terecht als dekstier Vraag vanuit stamboek voor registratie Genomics Peter Vercauteren 26 oktober 2011 20