Gene expression profiling of breast cancer to identify subtypes and to predict local recurrence after breast conserving therapy Kreike, B.

Vergelijkbare documenten
Biodiversity responses to climate and land-use change: A historical perspective Aguirre Gutierrez, J.

Bedrijfsovername en milieurecht : een onderzoek naar juridische aspecten van bedrijfsovername en milieu Mellenbergh, R.

"Our subcultural shit-music": Dutch jazz, representation, and cultural politics Rusch, L.

Citation for published version (APA): Oderkerk, A. E. (1999). De preliminaire fase van het rechtsvergelijkend onderzoek Nijmegen: Ars Aequi Libri

Rondon de mondingen van Rijn & Maas: landschap en bewoning tussen de 3e en 9e eeuw in Zuid-Holland, in het bijzonder de Oude Rijnstreek

Symptom monitoring and quality of life of patients with cancer in the palliative phase Hoekstra, J.

Published in: Aansluitmonitor wiskunde VO-HO: Zicht op de cursusjaren en

Gezinskenmerken: De constructie van de Vragenlijst Gezinskenmerken (VGK)

Citation for published version (APA): Oderkerk, A. E. (1999). De preliminaire fase van het rechtsvergelijkend onderzoek Nijmegen: Ars Aequi Libri

Trouwen over de grens. Achtergronden van partnerkeuze van Turken en Marokkanen in Nederland Hooghiemstra, B.T.J.

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Op en in het web: Hoe de toegankelijkheid van rechterlijke uitspraken kan worden verbeterd van Opijnen, M.

Consequences of success in pediatrics: young adults with disability benefits as a result of chronic conditions since childhood Verhoof, Eefje

Eerste hulp bij tweede taal: experimentele studies naar woordenschatdidactiek voor jonge tweede-taalverwervers Bacchini, S.

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Trouwen over de grens. Achtergronden van partnerkeuze van Turken en Marokkanen in Nederland Hooghiemstra, B.T.J.

Observations and analysis of early-type stars at infrared wavelengths Zaal, P.A.

Schaal in het primair onderwijs : een studie naar de relatie tussen schaal en organisatie-effectiviteit van de Venne, L.H.J.

De belofte van vitamines: voedingsonderzoek tussen universiteit, industrie en overheid Huijnen, P.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Coparenting and child anxiety Metz, M. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Improving the preoperative assessment clinic Edward, G.M. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Gezinskenmerken: De constructie van de Vragenlijst Gezinskenmerken (VGK) Klijn, W.J.L.

Citation for published version (APA): Gaemers, J. H. (2006). De rode wethouder: de jaren Amsterdam: Balans.

De jaren zestig herinnerd: over gedeelde idealen uit een linkse periode

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Aspects of protein metabolism in children in acute and chronic illness Geukers, Vincent

The diagnosis and prognosis of venous thromboembolism : variations on a theme Gibson, N.S.

Citation for published version (APA): Oderkerk, A. E. (1999). De preliminaire fase van het rechtsvergelijkend onderzoek Nijmegen: Ars Aequi Libri

Ficino en het voorstellingsvermogen : phantasia en imaginatio in kunst en theorie van de Renaissance van den Doel, M.J.E.

Melatonin treatment and light therapy for chronic sleep onset insomnia in children van Maanen, A.

Planhiërarchische oplossingen : een bron voor maatschappelijk verzet

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Giant congenital melanocytic naevi : definition, malignant transformation and treatment modalities Zaal, L.H.

Citation for published version (APA): Oderkerk, A. E. (1999). De preliminaire fase van het rechtsvergelijkend onderzoek Nijmegen: Ars Aequi Libri

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Nederland en het verhaal van Oranje Huijsen, J. Link to publication

Bezwaar en beroep in de praktijk van NWO : een empirische verkenning naar de oordeelsprocessen binnen NWO van der Valk, L.J.M.

Ethno-territorial conflict and coexistence in the Caucasus, Central Asia and Fereydan

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Vascular factors in dementia: prevention and pathology Richard, E. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Tracheoesophageal Speech. A Multidimensional Assessment of Voice Quality

Regulation of pyruvate catabolism in Escherichia coli: the role of redox environment

Framing Turkey: Identities, public opinion and Turkey s potential accession into the EU

Citation for published version (APA): Bullens, L. (2013). Having second thoughts: Consequences of decision reversibility

Anxiety, fainting and gagging in dentistry: Separate or overlapping constructs? van Houtem, C.M.H.H.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Het sociaal plan van der Hulst, J. Link to publication

Some issues in applied statistics in clinical restorative dental research Tobi, H.

Behouden beleid: Naar decentrale arbeidsvoorwaarden in het voortgezet onderws van Schoonhoven, R.

Network of networks: Uncovering the secrets of entrepreneurs' networks

Professionalisering van de personeelsfunctie: Een empirisch onderzoek b twintig organisaties Biemans, P.J.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Inquiry-based leading and learning Uiterwijk-Luijk, E. Link to publication

Gevaarlijke kinderen - kinderen in gevaar: De justitiële kinderbescherming en de veranderende sociale positie van jongeren, Komen, M.M.

Herdenken in Duitsland. De centrale monumenten van de Bondsrepubliek

Onder moeders paraplu? Determinanten en effecten van merkportfoliostrategieën Cramer, K.V.B.

Aparte coordinatie. Samenwerking tussen arbeidsbureaus en uitkeringsinstanties van Gerven, J.H.A.M.

Piratenbibliotheken en hun rol in de kenniseconomie: 'ignoti et quasi occulti' Bodó, B.

Werelden van verschil : hoe actoren in organisaties vraagstukken in veranderprocessen hanteren en creëren Werkman, R.

Dental anxiety and behaviour management problems: The role of parents

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Aspects of tropical ulcerating diseases Zeegelaar, J.E. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository) : Peeters-Podgaevskaja, A.V. Link to publication

Dr. Tobie Goedewaagen ( ): een leven lang nationaal-socialist van Berkel, A.B.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Collagen VI mutations in Bethlem myopathy. Jöbsis, G.J. Link to publication

The impact of paediatric inflammatory bowel disease. Epidemiology, disease activity and quality of life Loonen, H.J.

Worshipping the great moderniser : the cult of king Chulalongkorn, patron saint of the Thai middle class Stengs, I.L.

Bedrijfsovername en milieurecht : een onderzoek naar juridische aspecten van bedrijfsovername en milieu Mellenbergh, R.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Tissue microarray in prognostic studies on vulva cancer Fons, G. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Meer voorzorg bij DNA-onderzoek M'charek, A.A.; Toom, V.H. Published in: Het Tijdschrift voor de Politie

Citation for published version (APA): De Sousa E Melo, F. (2013). Colon cancer heterogeneity: Stem cells, signals and subtypes

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Citation for published version (APA): Stam, R., & Piersma, N. (2017). Kencijfers laadinfrastructuur Gelderland. Amsterdam: HVA Publicaties.

Liefde, solidariteit en recht. Een interdisciplinair onderzoek naar het wederkerigheidsbeginsel. Pessers, D.W.J.M.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) The potency of human testicular stem cells Chikhovskaya, J.V. Link to publication

Een dynamische driehoek. Gezinsvoogd, ouder en kind een jaar lang gevolgd Schuytvlot, A.H.

Professionalisering van de personeelsfunctie: Een empirisch onderzoek bij twintig organisaties

Amsterdam University of Applied Sciences. Leren redeneren en experimenteren met concept cartoons Kruit, P.M. Link to publication

Een koopwoning nabij: onderzoek naar de verkoop van huurwoningen in Nederland in Bonnerman, F.; Hoppesteyn, M.; de Klerk, A.

Gevaarlke kinderen - kinderen in gevaar: De justitiële kinderbescherming en de veranderende sociale positie van jongeren, Komen, M.M.

Citation for published version (APA): Boot, A. W. A. (2004). Management en Organisatie: wat nu? Tijdschrift voor het Economisch Onderwijs, 2,

Citation for published version (APA): van Zanten, J. H. (2001). Martingales and diffusions, limit theory and statistical inference

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Eerste hulp bij tweede taal: experimentele studies naar woordenschatdidactiek voor jonge tweede-taalverwervers Bacchini, S.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Genetic variation in Helicobacter pylori Pan, Z. Link to publication

Operational research on implementation of tuberculosis guidelines in Mozambique

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Controlled light exposure microscopy Hoebe, R.A. Link to publication

"In dienste vant suyckerenbacken." De Amsterdamse suikernijverheid en haar ondernemers, Poelwijk, A.H.

Professionalisering van de personeelsfunctie: Een empirisch onderzoek b twintig organisaties Biemans, P.J.

The effects of meniscal allograft transplantation on articular cartilage Rijk, P.C.

Dienaren van het gezag. De Amsterdamse politie tijdens de bezetting Meershoek, A.J.J.

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Tuberculosis case finding in South Africa Claassens, M.M. Link to publication

The human figure as method : study, sculpture and sculptors in the Academie Royale de Peinture et de Sculpture ( )

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Health targets: navigating in health policy. van Herten, L.M. Link to publication

Tradities in de knel: Zorgverwachtingen en zorgpraktijk bij Turkse ouderen en hun kinderen in Nederland

Mr. C. Asser's handleiding tot de beoefening van het Nederlandsch Burgerlijk Recht: Algemeen deel Scholten, Paul

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Use and Appreciation of Mycenaean Pottery outside Greece van Wijngaarden, G.J.M. Link to publication

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Transcriptie:

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Gene expression profiling of breast cancer to identify subtypes and to predict local recurrence after breast conserving therapy Kreike, B. Link to publication Citation for published version (APA): Kreike, B. (2011). Gene expression profiling of breast cancer to identify subtypes and to predict local recurrence after breast conserving therapy General rights It is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), other than for strictly personal, individual use, unless the work is under an open content license (like Creative Commons). Disclaimer/Complaints regulations If you believe that digital publication of certain material infringes any of your rights or (privacy) interests, please let the Library know, stating your reasons. In case of a legitimate complaint, the Library will make the material inaccessible and/or remove it from the website. Please Ask the Library: http://uba.uva.nl/en/contact, or a letter to: Library of the University of Amsterdam, Secretariat, Singel 425, 1012 WP Amsterdam, The Netherlands. You will be contacted as soon as possible. UvA-DARE is a service provided by the library of the University of Amsterdam (http://dare.uva.nl) Download date: 15 Feb 2017

115

116

Dankwoord Aan alles komt eind, zo ook aan dit proefschrift, maar natuurlijk niet zonder een heleboel mensen te bedanken die mij de afgelopen jaren hebben geholpen met het tot stand komen van dit boekje. Allereerst zijn dat Marc en Harry. Ik solliciteerde voor een klinische opleidingsplek bij Harry en hij bood mij een agiko-constructie aan; om vervolgens te beginnen met het onderzoek onder de begeleiding van Marc. Met andere woorden, zonder Harry en Marc had ik dit onderzoek nooit gedaan en had ik niet geleerd wat jullie mij uiteindelijk allemaal hebben laten doen. Marc, ik ben weleens jaloers op jouw vermogen van overzicht, waarbij je van veel zaken verstand hebt en die je vervolgens allemaal goed weet te koppelen aan elkaar, waardoor het lijkt dat knetter ingewikkelde zaken allemaal eigenlijk heel eenvoudig lijken te zijn. Jij hebt voor mij heel veel deuren opengezet, die ik zonder jouw hulp nooit geopend had. Ik ben je hier heel dankbaar voor. Harry, in het begin van mijn onderzoek kwam ik zeer sporadisch op de afdeling radiotherapie en toch had ik het idee dat je precies wist wat ik deed. Dit resulteerde dan ook vaak in de vraag wanneer ik toch eens met mijn eerste publicatie zou verschijnen. Ik heb dat altijd opgevat als een positieve stimulans in de voortgang van mijn onderzoek, want die progressie was inderdaad niet altijd op topsnelheid. Later heb je mij natuurlijk ook geholpen in de vorming van een goed radiotherapeut, maar om te beginnen hielp je mij bij de vorming van het worden van een goede wetenschapper. Ik begon redelijk blanco vanuit de schoolbanken op een zeer professioneel lab (H6) te werken en werd gelukkig heel goed op weggeholpen door alle mensen van H6 en vooral door Petra Kristel. Jij gaf mij een stoomcursus laboratoriumtechnieken, wat uiteindelijk de basis was van mijn verdere zelfstandig labwerk. Ik heb natuurlijk ook veel geleerd van de andere groepsleden en kamergenoten (hoewel die samenstelling nog al wisselde gedurende mijn onderzoeksperiode): Cathy, Els, Tibor, Erik, Juliane, Hugo en natuurlijk Hans Halfwerk. Dankzij Hans heb ik een grote bult werk kunnen genereren. Jij was nooit te beroerd om iets extra s uit te zoeken of om nog een paar extra array s te hybridiseren, ik ben jou dan ook zeer dankbaar voor jouw inzet en hulp. Buiten mijn groepsleden en kamergenoten, zijn er nog een boel andere mensen van H6 die ik dank verschuldigd ben voor hun adviezen en praktische hulp. Om te beginnen met Thea; heb je een probleem dan vraag je het aan Thea en je krijgt meteen hulp. Arno Floore, jij was gelijktijdig met ons de microarray-techniek aan het optimaliseren en op jouw kennis heb ik een heel eind mogen meeliften. In een later stadium van mijn onderzoek gold hetzelfde voor Britta. Ik heb altijd erg prettig met je samengewerkt en dat heeft ook tot hele leuke samenwerkingen en publicaties geleid. Adrian en Fiona, jullie waren altijd bereid mij adviezen en uitleg te geven, ik heb dan ook veel van jullie geleerd. Hans te Poele, met jou heb ik altijd lekker kunnen kletsen en ik heb ook veel praktische zaken van je geleerd. Verder wil ik alle andere H6-ers met wie ik altijd prettig heb samengewerkt bedanken. Onze groep maakte natuurlijk niet alleen deel uit van H6, maar ook van 117

de afdeling pathologie en ook daar werkten een boel mensen die mij enorm geholpen hebben met mij onderzoek. Annuska, jij hebt mij enorm geholpen in het begaanbaar maken van het microarray-pad; van het opwerken van de samples tot het analyseren van de data. Ook Anke en Leonie hebben mij hierbij enorm geholpen met het delen van jullie ervaringen. Dankzij de hulp van Douwe heb ik de hele weefselbank van het NKI-AvL kunnen doorspitten opzoek naar geschikte samples. Ik heb ook veel geleerd van Laura en Hans Peterse, helaas is Hans veel te vroeg overleden, ik denk dat ik nog heel veel meer van hem had kunnen leren. Ik ben ook nog dank verschuldigd aan de mensen van de central microarray facility. In het begin heb ik veel geleerd van Ron, Mike en Arno en later kwam daar de hulp van Daoud, Cor, Arenda, Wim en Marja bij. Jan Schornagel en Wil van Waardenberg wil ik hartelijk bedanken voor de hulp die jullie mij hebben geboden bij het naspeuren van statussen, op zoek naar patiënten met metastasen die we wilden correleren aan genexpressie profielen. Helaas heeft dit werk tot op heden niet geleid tot een publicatie, omdat we afhankelijk waren van een derde partij die het heeft laten afweten. Toch denk ik dat we een heel mooi profiel hebben ontdekt dat lijkt gecorreleerd aan botmetastasering en ik hoop dat deze resultaten uiteindelijk door Dilara en Marc zullen worden gevalideerd en gepubliceerd. Guus Hart en Lodewyk Wessels zijn twee mannen met enorm veel verstand van zaken waar ik ook graag nog meer van zou willen weten. Ik heb van jullie beide heel veel geleerd, waardoor ik uiteindelijk een groot deel van mijn data zelfstandig heb kunnen analyseren. Samen met Guus heb ik het spline-artikel geschreven wat mij zonder Guus absoluut niet gelukt was, hartelijk dank Guus. Natuurlijk wil ik ook nog al mijn (nog niet genoemde) co-auteurs bedanken voor hun hulp in het tot stand komen van de desbetreffende artikelen: Tony van de Velde, Marieke van Kouwenhove, Nicola Armstrong, Emiel Rutgers, Jacques Borger, Peter Bult, John Foekens en Sanne Veltkamp. Bij de laatste loodjes van dit proefschrift heb ik veel hulp gehad van Marion Zeeman en Patricia Haye- Fewer. Dankzij jullie hulp is er een boel werk uit mijn handen genomen, heel veel dank. Dimitry, jij bent niet alleen een coauteur, maar vooral ook vriend en collega. Samen met jou heb ik altijd erg prettig over werk gerelateerde zaken gesproken, gebrainstormd en gereisd. Daarnaast natuurlijk ook heel veel over niet-werk gerelateerde zaken gekletst. Ik vind het altijd weer fascinerend om te zien hoe snel jij je een nieuw onderwerp eigen kunt maken, zoals bijvoorbeeld je eigen onderzoek, waaraan je na mij begon en waarin je al heel snel op een niveau zat waaraan ik weer veel heb kunnen ontlenen. Last, but certainly not least, het thuisfront. Karlijn, jij hebt mij altijd gesteund als ik aan mijn onderzoek wilde werken in onze gemeenschappelijke tijd en dat heeft je nogal eens de nodige moeite gekost om aan derden uitteleggen. Verder ben je natuurlijk een pracht vrouw en hebben we twee schatten van kinderen. 118