16S-23S rdna NGS op klinische samples van orthopedische patiënten Glen Mithoe, arts-microbioloog

Maat: px

Weergave met pagina beginnen:

Download "16S-23S rdna NGS op klinische samples van orthopedische patiënten Glen Mithoe, arts-microbioloog"

Ruben de Smedt
6 jaren geleden
Aantal bezoeken:

1 16S-23S rdna NGS op klinische samples van orthopedische patiënten Glen Mithoe, arts-microbioloog

2 16S-23S rdna NGS op klinische samples van orthopedische patiënten Pilot studie 16S-23S rdna NGS op monsters die afgenomen zijn bij een (verdenking) prothese infectie. 4 patiënten met bewezen prothese infectie. 3 patiënten met (zeer) lage verdenking prothese infectie (negatieve kweken) Kweek op BA, CHOC en TSB medium. Kweek staat 14 dagen in Niet blind afenten Geen sonicatie Geen homogenisatie weefsels/biopten

3 W. (M) : Totale heupprothese rechts i.v.m. coxarthrose : TH hybride links i.v.m. zeer forse degeneratieve afwijkingen van de linker heup. Vroege infectie THP L 29-12: spoelen heup Li. 19-1: 2e keer spoelen bij wondgenezingsstoornis. Epitoop Kweek Groei van: Direct materiaal /Ophoping Groeidichth16-23S rdna analyse ID Score % reads 16S analyse eid 19/1/2017 subcutis Streptococcus dysgalactiae Direct Gering Streptococcus dysgalactiae 4318/4319 1,000 98% 16S rdna gewricht Negatief Streptococcus dysgalactiae 4321/4322 1,000 93% 16S rdna 37,34 1 Propionibacterium Fistel gang acnes+ 2 GG Subcutis 40,08 3 GG Fascie weefsel Vocht 4 Diep GG kapsel Propionibacterium acnes Direct Gering Streptococcus dysgalactiae 4320/4322 1,000 97% 16S rdna kapsel Streptococcus dysgalactiae Direct Gering Streptococcus dysgalactiae 4320/4322 1,000 98% 16S rdna Propionibacterium acnes Direct Gering Propionibacterium acnes 2678/2699 0,992 1% kapsel Streptococcus dysgalactiae Direct Gering Streptococcus dysgalactiae 4325/4326 1, % 16S rdna kapsel capitis Ophoping Zeer Gering Streptococcus dysgalactiae 3445/3446 1,000 72% 16S rdna 39,80 5 GG Weefsel femur 37,56 6 GG Acetabulum 28,62 39,98

4 Patiënte F-E (v) : Medicale collumfractuur rechts wv kophals prothese : Spoelen heup met achterlaten gentamatten. I.v.m. penicilline allergie gestart met vanco en rifa. Biopt/ Epitoop Punctaat kweek 30/12/17 Groei van: Direct materiaal /Ophoping Groeidichtheid 16-23S rdna analyse ID Score % reads S.aureus Biopt inta. Art. heamatoon aureus Ophoping Gering Propionibacterium acnes 4399/4399 1,000 65% >40 Neisseria sicca 4679/4706 0,994 6% Biopt inta. Art. heamatoon aureus Direct Gering aureus 2732/2732 1,000 12% >40 Propionibacterium acnes 4392/4392 1,000 10% Streptococcus anginosus 3345/3347 0,999 3% Anaerococcus sp. 812/830 0,978 1% Biopt inta. Art. heamatoon aureus Direct Gering Finegoldia magna 1462/1469 0,995 25% >40 Pseudomonas poae 2448/2474 0,989 4% Punctaat subcutaan aureus Direct Gering Negatief Ct36,13 Punctaat subcutaan aureus Direct Gering aureus 2804/ % Ct33,82 Punctaat diep aureus Direct Gering aureus 2551/2552 1,000 24% Ct38,44 Enterobacter cloacae 4451/4457 0,999 9% Propionibacterium acnes 4404/4404 1,000 7%

5 Patient H (m) : Revisie totale heupprothese rechts i.v.m. aseptische loslating steel THP rechts. Kweken: GG : Pijnklachten en wondlekkage na THP rechts : gespoeld : Opnieuw spoelen. Kweek 16/12/17 Kweek 25/12/16 Epitoop Groei van: Direct materiaal Groeidichthei 16-23S rdna Kweek /Ophopingd analyse ID Score % reads femur I GG Subcutaanvocht Streptococcus dysgalactiae+++ epidermidis + bursa epidermidis Ophoping Zeer gering Negatief acetabulum II GG Sub fasciaal vocht kapsel GG Kapsel I Streptococcus dysgalactiae++ epidermidis + kapsel epidermidis Direct Gering Streptococcus dysgalactiae +++ subfeciaal epidermidis Ophoping Zeer gering epidermidis Ophoping Zeer gering femur II GG Kapsel II Streptococcus dysgalactiae ++ kapsel Spier 5 fastus lateraal Streptococcus dysgalactiae acetabulum I GG I +++ subfeciaal Spier 6 biopt fastus lateraal II Streptococcus dysgalactiae ++ Kapsel III Streptococcus dysgalactiae ++ epidermidis Direct Gering Streptococcus dysgalactiae 4073/4073 1,000 99% Streptococcus dysgalactiae 4098/4101 0, % Streptococcus dysgalactiae 3828/3829 0, % Streptococcus dysgalactiae 4283/4283 1,000 46% epidermidis 4269/4272 0,999 11%

6 Patiente (v) H-L, : Septische arthritis natieve heup rechts. verwijderen kop en kweken en achterlaten spacer : Spacer wissel re heup verwijderen spacer en creëren girdlestone vanwege aanhoudende wondlekkage en oplopende ontstekingsparameters Biopsie kapsel 6 acetabulum Biopt/ Epitoo Punctaatp Kweek Groei van: Groeidic16-23S rdna analyse ID Score % reads Afname Direct materiaal /Ophoping htheid datum S. anginosus groep++ Vocht wond Negatief n.a. n.a. epidermidis 4292/4292 1,000 49% vocht oppervlakkig Biopsie kapsel 2 S. anginosus groep+ Corynebacterium spp. 4500/4571 0,984 30% Biopt intraarticulair I Gewrichtspunctaat S. anginosus groep++ Vocht wond Direct Gering n.d. Biopt intraarticulair 1 epidermidis III Biopsie 3 kapsel 2 S. anginosus groep++ Biopt Femur Negatief n.a. n.a. Negatief Biopt intraarticulair IV Biopsie 4 kapsel 2 gewricht S. anginosus groep++ Biopt Femur epidermidis Biopsie 5 kapsel 3 S. anginosus groep++ Corynebacterium kroppenstedtii Direct Gering Roseomonas mucosa 4785/4788 0,999 42% Moraxella osloensis 2648/2656 0,997 50% Biopt Femur Negatief n.a. n.a. Corynebacterium jeikeium 4507/4578 0,984 24% Biopt actetab ulum lugdunensis epidermidis Corynebacterium tuberculostearicum Streptococcus anginosus 4410/4411 1,000 13% Propionibacterium sp. 4380/4386 0,999 7% Direct Gering Streptococcus anginosus 4383/4384 1,000 83% Propionibacterium acnes 2126/2151 0,988 2% Propionibacterium sp 2286/2524 0,906 12% Corynebacterium pseudogenitalium 1136/1149 0,989 2% Proteus mirabilis+ Klebsiella pneumoniae + Proteus mirabilis+ Klebsiella pneumoniae + Proteus mirabilis++ Klebsiella pneumoniae++ Candida albicans+ Proteus mirabilis Klebsiella pneumoniae Candida albicans

7 J-G (v) : TH stanmore rechts i.v.m. coxarthrose. Biopt/ Epitoop Punctaat Kweek Groei van: Direct materiaal /Ophoping Groeidichtheid 16-23S rdna analyse ID Score % reads Biopt subcutaan Negatief n.a. n.a. Negatief Biopt gewricht Negatief n.a. n.a. Negatief Biopt trochanter Negatief n.a. n.a. Negatief Biopt subcutis Negatief n.a. n.a. Negatief

$J (m). 18-5-1975 4-1-2016 DHS links i.v.m. gedisloceerde collumfractuur 24-2-2017: X-heup: verdere verslechtering AVN: verwijderen DHS Li en implantatie gentaspacer.$

8 J (m) DHS links i.v.m. gedisloceerde collumfractuur : X-heup: verdere verslechtering AVN: verwijderen DHS Li en implantatie gentaspacer. Biopt/ Punctaat Epitoop Kweek Groei van: Direct materiaal /Ophoping Groeidichtheid 16-23S rdna analyse ID Score % reads Biopt acetabulum Negatief n.a. n.a. Propionibacterium acnes 2682/2683 1,000 28% Pseudomonas protegens 1279/1294 0,988 0,4% Biopt acetabulum Propionibacterium acnes Direct Gering Propionibacterium acnes 2680/2680 1,000 18,8% Pseudomonas poae 2458/2484 0,990 14,1% Biopt kapsel femur Negatief n.a. n.a. Negatief Punctaat subfasciaal Negatief n.a. n.a. Acinetobacter sp 2383/2488 0,958 9,1% Biopt subcutis Negatief n.a. n.a. pasteuri 2516/2517 1,000 24,0% Anaerococcus sp 1351/1410 0,958 4,4% Pseudomonas poae 2447/2473 0,989 1,7% Biopt kapsel heamatoom Negatief n.a. n.a. Propionibacterium acnes 2022/2051 0,986 2,40%

9 van der V, in Turkije een kop-halsprothese gekregen. Sindsdien nooit meer goed gelopen : Verwijderen kophalsprothese links met cementresten, uitgebreide nettoyage, achterlaten spacer : Re-implantatie totale heupprothese links, posterolaterale benadering : Spoelen i.v.m. verdenking infectie THP 14dg na reïmplantatie : Spoelen. Biopt/ Epitoop Punctaat Kweek 16-23S rdna analyse ID Score % reads 2/3/2017 kweek 21/3/17 kweek 4/4/17 kweek 20/4/17 Biopt kapsel Negatief Negatief subcutis GG sub fasciaal epidermidis+ 1 Biopt kapsel Negatief Enterococcus faecium 1146/1148 0,998 13% Biopt kapsel Negatief Negatief fascie GG Streptococcus sanguinis 2423/2428 0,998 9% Punctaat vocht GG Propionibacterium acnes 2031/2031 1,000 1% Biopt kapsel Negatief Negatief kapsel Propionibacterium Biopt acetabulum Negatief acnes 2673/2674 1,000 46% Streptococcus mitis 2504/2514 0,996 24% Moraxella sp. 624/692 0,902 1% kapsel Biopt acetabulum Negatief warneri 2517/2520 0,999 9% Punctaat gewricht Negatief Moraxella sp. 2231/2371 0,941 13% Acinetobacter sp 2310/2407 0,960 3% femur GG acetabulum GG femur 2 GG pseudo kapsel Biopsie kapsel 1 subcutaan Gewrichtspunct aat heup GG epidermidis + epidermidis + epidermidis + 2 subcutis 3 subcutis 2 epidermidis + 4 bursa 5 fascie epidermidis + Punctaat 1

10 16S-23S rdna NGS op klinische samples van orthopedische patiënten Minor/ major discrepanties 3/7 major error NGS 2/7 resultaten NGS mogelijk leidend tot aanpassing AB beleid in vroeg stadium. Sample error? Rol homogeniseren? Pathogenen/ contaminatie Prospectieve studie noodzakelijk.

Vergelijkbare documenten

Referentiecijfers 2001 t/m 2011: Postoperatieve wondinfecties na hartchirurgie. PREZIES versie: december 2014 Documentversie: 7.0

Referentiecijfers 2001 t/m 2011: Postoperatieve wondinfecties na hartchirurgie. PREZIES versie: december 2014 Documentversie: 7.0 Inhoudsopgave. 1. Keypoints.... 3 2. Inleiding.... 4 3. Resultaten....