Dr. Peter Vercauteren Hoofd KI/ET CRV. Genomics

Transcriptie

1 Dr. Peter Vercauteren Hoofd KI/ET CRV Genomics

2 Deze presentatie Genomic selection bij melkvee vleesvee Implementatie in de fokprogramma s Waar we tegen aan lopen Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

3 MELKVEE

4 Wat is merkerselectie? chromosoom 30 chromosomen van vader 30 chromosomen van moeder genoom DNA...CAGTCAGTCGTACCAGTCT x Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

5 Wat is merkerselectie?...cagtcagtcgtaccagtct...cagtcagtagtaccagtct Genomics Peter Vercauteren 26 oktober merkers

6 Wat is merkerselectie? Van merkers naar fokwaarden Referentiepopulatie stieren met dochters & DNA we weten hoe goed ze zijn we weten welk DNA ze hebben welk DNA is goed? Meer referentiestieren = meer betrouwbaarheid Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

7 Fokwaarde o.b.v. dochters Zwartbont, Kg eiwit Afstammingsindex Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

8 Fokwaarde o.b.v. dochters Zwartbont, Kg eiwit Genoomfokwaarde Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

9 Extra betrouwbaarheid door merkers Kg melk Kg vet Kg eiwit Frame Robuustheid Uier Benen Totaal Levensduur Celgetal Vruchtbaarheid Klauwgezondheid Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

10 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

11 Genomic selection. Werkt t? R = 60% is veel meer dan 30% R = 60% is nog lang geen 100% dicht bij index op basis van dochters Waar loop je meer risico mee? R= 85% dan 180 NVI zit tussen 160 en 200 R=60% dan 220 NVI zit tussen 160 en 280 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

12 Fokprogramma West Europa CRV produceert/verkoopt 5500 embryo s 25% aankoop embryo s 1500 InSire embryo s 50% Delta embryo s 4000 InSire embryo s 1500 ZB stierkalveren 100 ZB InSire 600 RB stierkalveren 40 RB InSire idem voor vrouwelijke dieren donoren voor embryo s (spoel/ivp) 50 embryo s/donor ( selectie 1/15) selectie 100% op basis genomics staalname direct na geboorte selectie 1/15 Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

13 Stiervaders ZB Stier V MV melk %v %e inet uier benen tot lvd cel vru nvi Danillo Goldwyn O Man Leko Laudan Jocko Morningview Levi Buckeye O Man Ramado Ramos Aaron Va-Early-Dawn Sudan Cri Jammer Sailor Abtshoeve Lucky Legend Shottle Caps Sunset Diamond Goldwyn Cookiecutter Mom Hunter Man-O-Man Shottle Delta Casino Cricket Mascol Delta Edison Peinzer Boy Paramount Delta Gravity Gibor Ramos Delta Ligretto Peinzer Boy Paramount Elagaaster Packman Bogart Jordan Vero Goliath Goli Paramount Willem's Hoeve R Ajax Man-O-Man Mascol Klassic Big Time Mac Shottle Mr Chassity Gold Chip-ET Goldwyn Shottle Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

14 Fokprogramma TPI 500 stierkalveren 30 InSire (1:15) 20 uit USA + 10 uit Europa USA stieren bij Sexing Technologies alle stieren worden getest in Tsjechië Beperkt toegang tot genomic testen in USA Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

15 Fokprogramma Genomic selection werkt, met R = 60% GS om beste donoren en stieren te vinden >75% fokprogramma via InSire embryo s Breed fokdoel, met aandacht voor inteelt Op de stierenkaart staan deels stieren zonder dochters ( hogenvi, top) Merkertesten uitgevoerd in Luik CRV berekent merkereffect (eigen onderzoek) CRV is eigenaar gegevens Vanaf 2013 vrij Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

16 DNA-testen voor erfelijke gebreken MELKVEE BLAD, CVM, BY, MF Red factor Zijn zeldzaam geworden door registratie en stieradviesprogramma s Onderzoek bij VHL op vraag fokorganisaties Alle gegevens in stamboekregistratiesysteem Geregeld in fokkerijbesluit en stamboekreglement Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

17 VLEESVEE

18 7 erfelijke gebreken CMD1 = veau planché, SMA CMD2 = electrische kalveren SQT = kromme staart syndroom (dwerggroei) GGG = genetisch gemodificeerde groei ( dwergroei of nanisme proportionné) overdracht (GP) hamartoom (HAM) Arthrogrypose (SA) Voor deze 7 is een test beschikbaar in Luik 5 via directe test, 2 via indirect test Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

19 Wat doen ki-centra Er worden geen dragers meer ingezet = afspraak met stamboek Positieve stieren worden niet meer actief vermarkt 30 à 40% stieren waren dragers en zijn weg Veel goede pedigrees zijn verloren Geplande koppelingen en gebruik ET om goede + pedigrees toch niet te verliezen Niet simpel om KI-stieren te vinden als 70% drager is Aantal dragers daalt sterk Publicatie door stamboek van ki-stieren die drager zijn Genomics Peter Vercauteren 26 oktober

20 Wat doen fokkers? Wegens te duur worden alleen op vraag dieren (deels) getest Staal gaat rechtstreeks naar lab Veehouder krijgt resultaat Komt niet in stamboeksystemen Dragers komen bewust en onbewust in de fokkerij terecht als dekstier Vraag vanuit stamboek voor registratie Genomics Peter Vercauteren 26 oktober