Deze drie stappen vormen een cyclus die keer herhaald wordt (Fig. 7.1.).
|
|
- Helena Timmermans
- 8 jaren geleden
- Aantal bezoeken:
Transcriptie
1 Hoofdstuk 7 Polymerase ketting reactie De polymerase ketting reactie (PCR) is een snelle in vitro methode voor de selectieve amplificatie van een specifiek geselecteerd deel van een DNA-sequentie. Dit kan een gen, een deel van een gen, een niet-coderende sequentie, zijn. PCR wordt zeer veel toegepast in de moderne moleculaire biologie: aanmaak van probes in blottingstechnieken (D4H6, pag. 212), genklonering en manipulatie, DNA-mutagenese (zie D4H7, pag. 262) en -sequencing (D4H5, pag. 187); DNA- en gentypering; SNP analyse; expressiestudies De techniek houdt drie stappen in: 1) Denaturatie bij 94 C: de oplossing wordt verhit om dsdna te denatureren en ss template DNA te krijgen. 2) Aanhechting van de primers (annealing), complementair aan de ss DNA templates tussen 45 en 60 C, afhankelijk van de prime sequentie. 3) Polymerisatie, voornamelijk bij 72 C (afhankelijk van het gebruikte polymerase), waarbij de nieuwe DNA streng wordt aangemaakt. Deze drie stappen vormen een cyclus die keer herhaald wordt (Fig. 7.1.). Een PCR-reactie mengsel bevat steeds de volgende bestanddelen: ytemplate DNA: dit bevat het specifieke deel van het DNA dat geamplificeerd moet worden. Het template DNA kan volledig genomisch DNA, cdna, een reeds eerder geamplificeerd PCR product of een plasmide zijn yprimers: zijn complementair aan de doel DNA-sequentie en hechten aan het uiteinde van elke DNA streng. De gebruikte concentratie is meestal 1µM; ydntps: de vier deoxynucleotiden datp, dttp, dgtp, dctp. Die worden ingebouwd tijdens de PCR-reactie en vormen zo nieuwe strengen op basis van het DNA-template. De beste resultaten worden verkregen als de concentratie aan dntps tussen 200 en 400 µm ligt. Let op! dntps zijn zeer gevoelig aan regelmatig invriezen en opnieuw ontdooien. Na een aantal cycli is de werking ervan verlaagd ymgcl 2 : Mg 2+ ionen vormen een stabiel complex met de dntps, wat essentieel is voor de dntp-incorporatie. Ze stimuleren de polymerase-activiteit en verhogen de smelttemperatuur (Tm) van het dsdna en de primer/template-interactie. Een te lage concentratie aan MgCl 2 geeft een onvoldoende rendement, terwijl een overmaat resulteert in een accumulatie van niet-specifieke producten. De concentratie is ideaal tussen 15 en 25 mm. ybuffer: de ph moet stabiel blijven tijdens de reactie. Vandaar dat een geschikte buffer noodzakelijk is. De buffers zijn specifiek voor het gekozen DNA-polymerase 233
2 ydna polymerase (bv. Taq, Pfu, ): Zorgt voor de synthese van de nieuwe DNA-streng. Het is een thermostabiel polymerase. Het meest gebruikte polymerase is het Taq polymerase, afkomstig van de bacterie Thermus aquaticus, die leeft in warmwaterbronnen in Yellowstone National Park. De optimale polymerisatiesnelheid is nucleotiden per seconde bij C. Het resultaat is een exponentiële toename in het fragment van jouw interesse. Fig Stap 1: Denaturatie: 1 min. bij 94 C Stap 2: Aanhechting: 45 sec. bij 54 C Stap 3: Polymerisatie: 1 min. bij 72 C Voorbeeld van de verschillende stappen van een PCR reactie. 234 Hoofdstuk 7
3 Template DNA Voor de aanmaak van het template DNA (genomisch, cdna, plasmide DNA) verwijzen we naar D4H3, pag. 59. De hoeveelheid totaal DNA in de PCR-reactie heeft een groot effect op het resultaat van deze reactie. Indien er te veel DNA gebruikt wordt, zal dit DNA aggregeren onderaan het reactiebuisje en dit kan leiden tot slechte aanhechting van de primers en een slechte DNA synthese omdat het Taq-polymerase niet vrij kan diffunderen. Indien er echter te weinig DNA genomen wordt, is er een grote kans dat dit verloren gaat door o.a. absorptie aan de wand, DNA afbraak etc. Verder moet de concentratie DNA gebalanceerd worden met het aantal cycli van de reactie. Gebruik van hoge concentraties DNA gecombineerd met een hoog aantal cycli leidt tot de verhoogde aanmaak van niet-specifieke PCR -producten. Tips Bij de initiële opzet van een experiment is het raadzaam om een verdunningsreeks van het template DNA uit te testen om de beste startconcentratie template DNA te bepalen. De ideale concentratie is 10 5 tot 10 6 doelmolecule DNA. bv. gemiddeld gezien bevat 1 µg genomisch humaan DNA ongeveer 3 x 10 5 doelmolecule DNA. Dit komt meestal neer op een concentratie genomisch DNA van 0.05 tot 1 µg/ µl. Ontwerp de primers Primers zijn synthetische nucleotidesequenties van ongeveer bp lang en zijn zodanig ontworpen dan ze aanhechten aan de zijde van beide strengen van de doelsequentie. Het ontwerpen van de primers gebeurt met gespecialiseerde computerprogramma s (o.a. Primer 3, Webprimer, Genefisher, ). De keuze van goede primers wordt gemaakt op basis van enkele eigenschappen: yoptimale smelttemperatuur (T m ) ligt tussen 50 en 60 C. ygc inhoud ligt tussen 40 en 60%. yde aanhechtingstemperatuur (T a ) van de primers ligt meestal 5 C onder de T m. Een vuistregel om deze temperatuur te bepalen: T a = (2 C (AT) + 4 C (GC)) 5 C yt a moet laag genoeg zijn om hybridevorming mogelijk te maken en hoog genoeg om mismatch hybriden te voorkomen. yprimers mogen niet zelf-complementeren, vermijdt dus zoveel mogelijk interne complementaire zones! 235
4 Smelttemperatuur van nucleïnezuren De smelttemperatuur van bv. DNA-probes of primers is een zeer belangrijk gegeven bij DNA-werk. Bij verwarmen van een dubbelstrengige DNA keten, worden de waterstofbruggen tussen de complementaire basen verbroken; het nucleïnezuur smelt en dit gaat gepaard met een toename in extinctie bij 260 nm, d.i. het hyperchroomeffect. In een enkelstrengige keten absorberen de basen ongeveer hetzelfde als die in de vrije nucleotiden. De toename in extinctie is evenredig met het AT-gehalte. Hoe hoger het percentage AT is, des de groter de toename van de extinctie. De temperatuur waarbij, onder invloed van temperatuursverhoging, twee complementaire ketens voor de helft gescheiden zijn, noemt men de smelttemperatuur, T m. De smelttemperatuur kan experimenteel bepaald worden uit de smeltcurve. Zoals uit fig blijkt, neemt de smelttemperatuur toe met stijgende ionensterkte. Uit fig.7.2. kan worden opgemerkt dat T m toeneemt met het gehalte GC. Detergennia zoals ureum en formamide beïnvloeden eveneens de T m, o.m. omdat ze een invloed hebben op de hydrofobe interacties tussen de basenparen onderling. E260nm Fig E.coli Pseudomonas (0,01) (0,01) Tm (G+C)% E.coli (0,1) 50% E260nm T ( C) Smeltcurve van DNA van E. coli in 0,01 M en 0,1 M fosfaatbuffer van ph 7,8 en van Pseudomonas aeruginosa in 0,01 M fosfaatbuffer. Smeltcurve analyse kan o.m. gebruikt worden voor de opsporing van gekende en nietgekende mutaties. Bij real-time PCR wordt het smeltpunt bepaald uit de verandering van het fluorecentiesignaal afhankelijk van de temperatuur (zie pag. 239). 236 Hoofdstuk 7
5 Aanmaak van de mastermix Een mastermix is een mengsel dat alle componenten bevat om meerdere PCR-reacties te laten plaatsvinden. De component hoeveelheden kunnen sterk verschillen omdat ze niet gelden voor elke reactie. Bepaal de optimale PCR-condities (temperaturen, duur, aantal cycli, concentraties van de verschillende componenten, ) met test-dna. Wanneer de meest optimale combinatie van alle factoren gevonden is, worden de condities toegepast op het DNA-staal. Voorbeeld: Tips! Bereken de mastermix altijd voor TEN MINSTE 1 extra reactia. Pipetteer altijd eerst het grootste volume in het epje. Pipetteer de volgende component IN het aanwezige volume en niet tegen de wand! Bij het pipetteren van de componenten, KIJK of de volumes effectief in het epje gevoegd worden. Verdeel de mastermix in dunwandige, kleine PCR-epjes en voeg dan pas het DNA toe aan elk epje. Voeg nooit template DNA aan de mastermix toe! Zorg ook steeds voor een negatieve controle (= reactie zonder template). Voer indien mogelijk een positieve controle uit. Product 25 µl-reactie 6 x mastermix Steriel water 10x PCR-buffer 25 mm MgCl 2 2 mm dntp 15 µm forward primer 15 µm reverse primer Taq polymerase Template DNA 18,4 µl 2,5 µl 2 µl 0,3 µl 1 µl 110,4 µl 15 µl 12 µl 1,8 µl / yde mastermix wordt verdeeld over dunwandige microcentrifugeerbuisjes van 200 µl of in een 96-wellplaat, waarvan de wells een volume van 200 µl inhouden. yvoeg overal template-dna toe (meestal 1 µl). yindien nodig kunnen de stalen gedurende 1 minuut op een lage snelheid gecentrifugeerd worden om zeker alle oplossing in de tip van het recipiënt te krijgen. ysluit de microcentrifugeerbuisjes of wells goed af met daarvoor voorziene dopjes of strips. Door de hitte in het PCR-toestel zouden die kunnen openspringen en dit mag niet gebeuren! yindien het PCR-toestel niet beschikt over een verwarmend deksel, moet de oplossing bedekt worden met wat minerale olie. 237
DNA practicum De modellenwereld van DNA
DNA practicum De modellenwereld van DNA Inleiding Alle eigenschappen van een plant, zoals de grootte, de vorm van het blad, en de enzymen die nodig zijn voor de fotosynthese, liggen opgeslagen in het DNA.
Nadere informatieHANDLEIDING VOOR DOCENTEN Versie september 2011
HANDLEIDING VOOR DOCENTEN Versie september 2011 DNAbAND is aanvankelijk ontwikkeld voor 1 e jaars modules moleculaire biologie binnen de unit Life Sciences and Technology, een samenwerking tussen Hogeschool
Nadere informatieLiteratuuropdracht kostenberekening en kostenvergelijking synthetisch DNA versus PCR producten
Literatuuropdracht kostenberekening en kostenvergelijking synthetisch DNA versus PCR producten Mark van der Lee, Stanley van Herk en Otto Bachaus. Met een naschrift van Eric Kamst (begeleidend docent).
Nadere informatieDesoxyribose heeft 5 C-atomen. De fosfaatgroep zit aan het 5e C-atoom en de stikstofbase aan het 1e C-atoom.
Desoxyribose heeft 5 C-atomen. De fosfaatgroep zit aan het 5e C-atoom en de stikstofbase aan het 1e C-atoom. Afbeelding 2. DNA-nucleotide.1 Bij het aan elkaar koppelen van nucleotiden gaat het 3e C-atoom
Nadere informatiePeriode 9 deel 2 DNA TECHNIEKEN
Periode 9 deel 2 DNA TECHNIEKEN Lesstof toets 9.2 Biologie voor het MLO zesde druk Hfdst 15.5 DNA technieken Het oude boek (vijfde druk) heeft dit hoofdstuk niet Technieken Biotechnologie Onder biotechnologie
Nadere informatiea. Geef de 1-lettercode van de aminozuren in het peptide in de corresponderende volgorde. (4P)
HERTENTAMEN Eindtoets BIOCHEMIE (8RA00) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 16-08-2013 09:00 12:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik geen rode pen! 1 Peptiden en eiwitten
Nadere informatieInstructies voor gebruik voor de CRC RAScan Combination Kit
1 Fabrikant Instructies voor gebruik voor de CRC RAScan Combination Kit Een SURVEYOR Scan KRAS en NRAS Kit Exons 2, 3 & 4 CE IVD met DHPLC-systemen Lees deze instructies voor gebruik zorgvuldig voordat
Nadere informatieDNA & eiwitsynthese (Junior College Utrecht) Vragen bij COO-programma
DNA & eiwitsynthese (Junior College Utrecht) Vragen bij COO-programma De vragen die voorkomen in het COO-programma DNA & eiwitsynthese zijn op dit formulier weergegeven. Het is de bedoeling dat je, als
Nadere informatiePracticum Biotechnologie 4/5VWO
Practicum Biotechnologie 4/5VWO Inhoudsopgave Pag. 3 Planning Pag. 4-5 Inleiding in de biotechnologie Pag. 6 Voorbeeld uit de Biotechnologie Pag. 7-8 Opzet Practicum (les 1) Pag. 9 Oefenen met Pipetteren
Nadere informatieGentechnologie & moleculaire analysetechnieken Godelieve Gheysen 1999-2000 eerste zit
Gentechnologie en moleculaire analysetechnieken Godelieve Gheysen 1 Gentechnologie & moleculaire analysetechnieken Godelieve Gheysen 1999-2000 eerste zit Gentechnologie en moleculaire analysetechnieken
Nadere informatieDNA-amplificatie en de analyse van gendefecten
Ned Tijdschr Klin Chem 1995; 20: 276-281 Overzichten DNA-amplificatie en de analyse van gendefecten J. A. LENSTRA We geven een kort overzicht van de technieken waarmee DNA kan worden onderzocht. De uitvinding
Nadere informatieDNA & eiwitsynthese Vragen bij COO-programma bij hoofdstuk 11 en 12 Life
DNA & eiwitsynthese Vragen bij COO-programma bij hoofdstuk 11 en 12 Life De vragen die voorkomen in het COO-programma DNA & eiwitsynthese zijn op dit formulier weergegeven. Het is de bedoeling dat je,
Nadere informatieANTWOORDEN HOOFDSTUK 6 VAN GEN TOT EIWIT
ANTWOORDEN HOOFDSTUK 6 VAN GEN TOT EIWIT ANTWOORDEN 6.5 /TM 6.8 Codering 1.een juiste aanvulling van het schema : nucleotiden in mrna juist nucleotiden in DNA juist 3 kant en 5 kant bij mrna en DNA juist
Nadere informatieCML en stoppen moleculaire diagnostiek
CML en stoppen moleculaire diagnostiek Moderator Dr. P. Kuiper-Kramer 1st author / speaker Dr. Bert A. van der Reijden Bert.vanderReijden@radboudumc.nl Dept of Laboratory Medicine, Laboratory of Hematology
Nadere informatieDNA & eiwitsynthese Oefen- en zelftoetsmodule behorende bij hoofdstuk 16 en 17 van Campbell, 7 e druk December 2008
DNA & eiwitsynthese Oefen- en zelftoetsmodule behorende bij hoofdstuk 16 en 17 van Campbell, 7 e druk December 2008 DNA 1. Hieronder zie je de schematische weergave van een dubbelstrengs DNA-keten. Een
Nadere informatieGGO: SCREENING. Versie 06 Datum van toepassing 2014-04-15
Federaal Agentschap voor de Veiligheid van de Voedselketen FLVVM LAB 24 I-MET-038a GGO: SCREENING Versie 06 Datum van toepassing 2014-04-15 Opgesteld door : Kristien Orye, sectieverantwoordelijke GGO,
Nadere informatieHet menselijk genoom. Inleiding Medisch Technische Wetenschappen. Bioinformatica Deel 2. Gevouwen chromosoom. X chromosoom DNA.
Het menselijk genoom Het menselijk genoom (DN) bestaat uit: Mega Basenparen (MB),,, C,. Inleiding Medisch echnische Wetenschappen Bioinformatica Deel Michael Egmont-Petersen Het menselijk DN is ingedeeld
Nadere informatieMoleculaire biologische technieken
Moleculaire biologische technieken Hand-out Juli 2010 In deze hand-out de meeste teksten. Van de (eigen) animaties zijn enkele belangrijke frames weergegeven. Als je de links wilt weten moet je de module
Nadere informatieOnderstaand is een stukje peptide getoond dat deel uit maakt van een groter eiwit en de naam draagt van een lokaal beroemde biochemicus:
1 Onderstaand is een stukje peptide getoond dat deel uit maakt van een groter eiwit en de naam draagt van een lokaal beroemde biochemicus: a. Geef de 1-lettercode van de 6 uitgeschreven aminozuren in de
Nadere informatieBel het nummer 24671 bij de ingang van het MRB gebouw en een GSU-medewerker zal u binnenlaten.
ONTVANGST STALEN VOOR SEQUENERING 1 BESTELBON OPMAKEN Maak een interne bestelbon ten gunste van 'Vakgroep Pediatrie en Genetica' (leveranciersnummer: GE02) voor een 'interne wetenschappelijke dienst' (artikelnummer:
Nadere informatieOptimalisatie van HRMCA toepassingen: genotypering met behulp van ongelabelde probes in BRCA1/2 SNP s en mutatiescanning van het NF1 gen
Stage Eindwerk Studiegebied: Bachelor Gezondheidszorg Biomedische Laboratoriumtechnologie Afstudeerrichting Farmaceutische en Biologische Laboratoriumtechnologie Academiejaar 2007-2008 Student Filip Slabbinck
Nadere informatiePracticum: het maken van een DNA-profiel
Practicum: het maken van een DNA-profiel (Met dank aan Jo Bloemen voor zijn basisversie van dit practicum en aan Brigitte Vanacken voor de technische uitwerking) Achtergrondinformatie Met welk genoom wordt
Nadere informatieGEBRUIK VAN FINCH V2.20 1 PROCEDURE. 1.1 Software. 1.2 Aanvraagprocedure
GEBRUIK VAN FINCH V2.20 1 PROCEDURE 1.1 Software Voor de organisatie van de aanvragen en de sequenerings data wordt gebruik gemaakt van Finch Geospiza). Deze software is van overal via het internet bereikbaar
Nadere informatieNederlandse norm. NEN 6254+C1 (nl)
Dit document mag slechts op een stand-alone PC worden geinstalleerd. Gebruik op een netwerk is alleen. toestaan als een aanvullende licentieovereenkomst voor netwerkgebruik met NEN is afgesloten. This
Nadere informatieNederlandse norm. NEN 6254+C1 (nl)
Dit document mag slechts op een stand-alone PC worden geinstalleerd. Gebruik op een netwerk is alleen. toestaan als een aanvullende licentieovereenkomst voor netwerkgebruik met NEN is afgesloten. This
Nadere informatieTENTAMEN BIOCHEMIE (8S135) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld :00 17:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal (aangegeven tijd is indicatie)
TENTAMEN BIOCHEMIE (8S135) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 25-01-2010 14:00 17:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal (aangegeven tijd is indicatie) 1 (~30 minuten; 20 punten) Onderstaand is een stukje
Nadere informatieFiguur 1. Representatie van de dubbele helix en de structuren van de verschillende basen.
Het DNA molecuul is verantwoordelijk voor het opslaan van de genetische informatie die gebruikt wordt voor de ontwikkeling en het functioneren van levende organismen. Aangezien het de instructies voor
Nadere informatie(~30 minuten; 20 punten)
TENTAMEN BIOCHEMIE (8S135) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 04-11-2011 09:00 12:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik geen rode pen! Additioneel 1 STar vraag (alleen
Nadere informatieComputer Ondersteund Onderwijs (COO).
Computer Ondersteund Onderwijs (COO). Over DNA en eiwit is er een computer praktikum. Bij dit COO leer je via een interactieve manier omgaan met de stof. Opstarten COO. Ga naar de site van het departement
Nadere informatie1 (~20 minuten; 20 punten)
TENTAMEN Moleculaire Cel Biologie (8A840) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld & Dr. M. Merkx 27-01-2012 14:00 17:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal + 1 bonusvraag! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik
Nadere informatieDocentenhandleiding 6x5 Daderprofiel DNA kit
Docentenhandleiding 6x5 Daderprofiel DNA kit #VOS-038A versie 2.0 Inhoud kit: 6 x 5 DNA profielen 6 x Dader profiel 6 x 200µl loading dye (kleurloze vloeistof) 4 g agarose 400µl gel dye (1000x) 100ml elektroforese
Nadere informatieToevoeging bij hoofdstuk 10 07/05/2012 A. Het maken van een genomische bank
Toevoeging bij hoofdstuk 10 07/05/2012 A. Het maken van een genomische bank Wanneer men een gen wil bestuderen dat nog niet beschreven is, zal men dit gen eerst moeten kloneren. Hiertoe maakt men gebruik
Nadere informatieMolecular Pathology for Pathologists. Pr P. Pauwels
Molecular Pathology for Pathologists Pr P. Pauwels NGS moleculair pathologie rapport ontcijferen Nomenclatuur waarin gerapporteerd wordt: EGFR c.2573t>g, p.(leu858arg) Coderende sequentie Eiwit/proteïne
Nadere informatieMedische genetica samenvatting
Medische genetica samenvatting 3 typen genetische ziekten: 1. Chromosoom afwijkingen: a. Medische genetica 2. Monogene aandoeningen: a. Medische genetica 3. Multifactoriële aandoeningen: a. Humane genetica
Nadere informatie#VOS-043 versie 2.0. Docentenhandleiding
#VOS-043 versie 2.0 Docentenhandleiding 1 Inhoudsopgave 1. Beschrijving experiment:... 3 1.1 Samenstelling kit:... 3 1.2 Benodigdheden:... 3 2. Achtergrond... 5 2.1 Fenylthiocarbamide... 5 2.2 Het gen
Nadere informatieProeMentamen Biochemie MST. DNA 90 punten is een Ien, 0 punten is een 1
ProeMentamen Biochemie MST. DNA 90 punten is een Ien, 0 punten is een 1 1. Welk(e) van de volgende baseparen komt(en) van nature voor in een DNA dubbele helix. Omcirkel deze. R R. Teken de chemische structuur
Nadere informatieGENETISCHE DIAGNOSTIEK VAN 15 VOLLEDIGE DOOFHEIDSGENEN VIA SECOND GENERATION SEQUENCING
FACULTEIT FARMACEUTISCHE WETENSCHAPPEN Vakgroep Farmaceutische biotechnologie Academiejaar 2009-2010 GENETISCHE DIAGNOSTIEK VAN 15 VOLLEDIGE DOOFHEIDSGENEN VIA SECOND GENERATION SEQUENCING Apr. Valerie
Nadere informatiebiologie pilot vwo 2015-I
Gehackte bacterie spoort bedorven vlees op Een team van studenten bio-engineering en biomedische technologie van de Rijksuniversiteit Groningen won in 2012 een internationale biotechnologiewedstrijd. De
Nadere informatie<A> Thymine is een pyrimidinebase en vormt 3 waterstofbruggen met adenine. <B> Adenine is een purinebase en vormt 2 waterstofbruggen met thymine.
Biologie Vraag 1 Welke uitspraak is correct? Thymine is een pyrimidinebase en vormt 3 waterstofbruggen met adenine. Adenine is een purinebase en vormt 2 waterstofbruggen met thymine. Cytosine
Nadere informatie<A> Adenine is een purinebase en vormt 2 waterstofbruggen met thymine. <B> Guanine is een pyrimidinebase en vormt 2 waterstofbruggen met cytosine.
Biologie Vraag 1 Welke uitspraak is correct? Adenine is een purinebase en vormt 2 waterstofbruggen met thymine. Guanine is een pyrimidinebase en vormt 2 waterstofbruggen met cytosine. Thymine
Nadere informatie1. Welk(e) van de volgende baseparen komt(en) van nature voor in een DNA dubbele helix. Omcirkel deze. C-G
Tentamen Biochemie MST. Deel 2 29 oktober 201 1:0-1:0u (17:00u met handicap) Antwoorden invullen op dit vel. 90 punten is een Den, 0 punten is een 1 Naam: Studentnr: 1. Welk(e) van de volgende baseparen
Nadere informatieSimulatie van een DNA-vaderschapstest
Simulatie van een DNA-vaderschapstest Concreet voorbeeld (Art. Lode Ramaekers Het belang van Limburg do. 24/01/02) Manu (fictieve naam) wil zekerheid, klaarheid over het biologische vaderschap van het
Nadere informatieBiotechnologie deel I
Biotechnologie deel I Hand-out bij de eerste oefen- en zelftoetsmodule van Biotechnologie & maatschappij behorende bij hoofdstuk 2,3, 4 en 5 van Introduction to Biotechnology, Thieman & Palladino, 3 e
Nadere informatieOntwikkelingen binnen de moleculaire pathologie. Bastiaan Tops Klinisch moleculair bioloog i.o. UMC St Radboud
Ontwikkelingen binnen de moleculaire pathologie Bastiaan Tops Klinisch moleculair bioloog i.o. UMC St Radboud Binnen het UMC St Radboud: - Stroomlijnen van de diagnostiek (automatiseren) - Zoveel mogelijk
Nadere informatieWEten is Winnen 2 CSI : Wat is een DNA vingerafdruk?
Elk jaar neemt het Sint-Michielscollege Brasschaat deel aan Scientists@work. Onze leerkracht, mevrouw Apers, doet dit elk jaar met één van haar klassen. In september hoorden we dat wij zouden deelnemen
Nadere informatieOpdrachtgever: Hoogheemraadschap van Delfland
Opdrachtgever: Hoogheemraadschap van Delfland Projectnr: HHD015-001 Datum: 5 juli 2017 Opdrachtgever: Hoogheemraadschap van Delfland Projectnr: HHD015-001 Rapportnr: HHD015-FFDNA-Def01 Status: Definitief
Nadere informatieIntermezzo, De expressie van een eiwit.
Samenvatting Bacteriën leven in een omgeving die voortdurend en snel verandert. Om adequaat te kunnen reageren op deze veranderingen beschikken bacteriën over tal van sensor systemen die de omgeving in
Nadere informatieTentamenopgave chemie B Geachte kandidaat,
Tentamenopgave chemie B 08 5 Geachte kandidaat, Hierbij gaat een octrooiaanvrage NL060000301 zoals ingediend op 27 januari 08, en het document dat de basis vormt van de inroeping van prioriteit voor bijgaande
Nadere informatieMoleculaire diagnostiek
Moleculaire diagnostiek van infectieziekten Arjan de Jong 8 december 2015 Moleculaire diagnostiek Diagnostiek op basis van moleculair biologische (DNA/RNA) technieken Moleculaire diagnostiek van infecties
Nadere informatieAanvullend advies betreffende de effecten van bekalken en/of rooien van 76 hoogstammige wilgen langs het kanaal Roeselare-Leie te Ingelmunster
Aanvullend advies betreffende de effecten van bekalken en/of rooien van 76 hoogstammige wilgen langs het kanaal Roeselare-Leie te Ingelmunster Nummer: INBO.A.2011.16 Datum advisering: 28 september 2011
Nadere informatie1. Welk van de onderstaande DNA sequenties zijn mogelijke herkenning-sites voor restrictie-enzymen? c 5' GAATTC 3' c 5' GGGGCCCC 3' c 5' CTGCAG 3' 5'
proefexamen 1. Welk van de onderstaande DNA sequenties zijn mogelijke herkenning-sites voor restrictie-enzymen? c 5' GAATTC 3' c 5' GGGGCCCC 3' c 5' CTGCAG 3' 5' CTAAATC 3' 5' GGAACC 3' Restriction Endonucleases
Nadere informatiePracticum 1: bepalen enzymactiviteit
Practicum 1: bepalen enzymactiviteit Vragen bij de oefen- en zelftoets-module behorende bij practicum 1 Versie 2012-2013 In deze module ga je een experiment uitvoeren. In dit experiment moet je de verschillende
Nadere informatieWelke combinatie van twee celorganellen en hun respectievelijke functies is correct?
Biologie Vraag 1 Welke combinatie van twee celorganellen en hun respectievelijke functies is correct? ribosoom en synthese van eiwitten kern en fotosynthese mitochondrion en fotosynthese ribosoom
Nadere informatieDocentenhandleiding 2x15 Daderprofiel DNA kit
Docentenhandleiding 2x15 Daderprofiel DNA kit #VOS-038 versie 2.1 Inhoud kit: 2 x 15 DNA profielen 2 x Dader profiel 2 x 1 ml loading dye (kleurloze vloeistof) 3 g agarose 400 µl blauwe gel dye (1000x)
Nadere informatieBasisscheikunde voor het hbo ISBN e druk Uitgeverij Syntax media Hoofdstuk 1 Stoffen bladzijde 1
Hoofdstuk 1 Stoffen bladzijde 1 Opgave 1 Hoe groot zijn de smelt- en kookpunten van onderstaande stoffen (zoek op)? smeltpunt kookpunt (sublimatiepunt) a 195 K (-78 O C); 240 K (-33 O C) b 159 K (-114
Nadere informatieQIAsymphony DSP Circulating DNA-kit
QIAsymphony DSP Circulating DNA-kit Februari 2017 Werkingseigenschappen 937556 Sample to Insight Inhoudsopgave Werkingseigenschappen... 4 Basiswerking... 4 Nauwkeurigheid van de run... 6 Gelijkwaardige
Nadere informatieVOS-043A versie 1.2. Handleiding
VOS-043A versie 1.2 Handleiding 1 Inhoudsopgave 1. Beschrijving experiment:... 3 1.1 Samenstelling kit:... 3 1.2 Benodigdheden:... 3 2. Achtergrond... 5 2.1 Fenylthiocarbamide... 5 2.2 Het gen TAS2R38...
Nadere informatieIntroductie. KI met vers of ingevroren sperma?
Introductie In de moderne varkenshouderij wordt op meer dan 95% van de zeugenbedrijven kunstmatige inseminatie (KI) toegepast. Dit werkt preventief tegen ziekteoverdracht en insleep (via direct contact
Nadere informatieOPEN VRAGEN. Genetica en Evolutie (5502GEEV9Y) Biologie en Biomedische Wetenschappen. Deeltoets 2
Genetica en Evolutie (5502GEEV9Y) Biologie en Biomedische Wetenschappen Deeltoets 2 OPEN VRAGEN Datum: donderdag 18 december 2014 Tijdstip: 13:00 uur tot 16:00 uur Naam Studentnummer 1 OPEN VRAGEN 35a
Nadere informatieVoorbeeld. Preview Normcommissie "Milieuanalyses" Ontwerp norm NEN 6254
Nederlandse Ontwerp norm NEN 6254 Water - Detectie en kwantificering van Legionella pneumophila - Methode met kwantitatieve polymerase chain reaction (QPCR) Water - Detection and quantification of Legionella
Nadere informatieEindexamen vwo scheikunde II
Selectieve opname koolstofdioxide 1 maximumscore 2 Een juist antwoord kan als volgt zijn weergegeven: rechts van de pijl H + 1 juiste coëfficiënten 1 Indien in een overigens juiste vergelijking H 2 is
Nadere informatieHonden en Katten als Stille Getuigen. Daniëlle Hoogmoed, MSc.
Honden en Katten als Stille Getuigen Daniëlle Hoogmoed, MSc. State of Washington versus Kenneth Leuluaialii and George Tuilefano, 1996 Een echtpaar en hun hond dood aangetroffen in de woning. De politie
Nadere informatieCover Page. The handle holds various files of this Leiden University dissertation.
Cover Page The handle http://hdl.handle.net/1887/37052 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Vliet, Rudy van Title: DNA expressions : a formal notation for DNA Issue Date:
Nadere informatieTissue factor pathway inhibitor (TFPI) is een protease remmer die is opgebouwd
Samenvatting Appendix 234 238 Samenvatting Tissue factor pathway inhibitor (TFPI) is een protease remmer die is opgebouwd uit een negatief geladen N-terminus gevolgd door drie Kunitz domeinen (K1, K2 en
Nadere informatiebiologie vwo 2017-I Gespierder door gendoping
Gespierder door gendoping Het overdragen van genetisch materiaal naar menselijke cellen voor de behandeling van ziektes bevindt zich nog in een experimenteel stadium. Deze techniek zou ook gebruikt kunnen
Nadere informatieHumane levenscyclus 1
Humane levenscyclus 1 Genexpressie 2 8 september 2011 Doel: Genexpressie (via welke stappen de informatie die in het DNA is opgeslagen gebruikt kan worden om eiwitten te vormen. Differentiële genexpressie
Nadere informatieSamenvatting Hoofdstuk 1 hoofdstuk 2
Samenvatting In de Westerse wereld is prenatale diagnostiek een integraal onderdeel geworden van verloskundige zorg. Om chromosoom afwijkingen bij de foetus te kunnen vaststellen is een invasieve procedure,
Nadere informatieVoorbereiding toelatingsexamen arts/tandarts
Voorbereiding toelatingsexamen arts/tandarts Oplossingen van 2018 Arts Geel 29 september 2018 Brenda Casteleyn, PhD Vraag 1 Welke waarden moeten worden toegekend aan x en y in de onderstaande reactievergelijking
Nadere informatie1 Peptiden en eiwitten (~20 minuten; 20 punten)
1 Peptiden en eiwitten (~20 minuten; 20 punten) a. Beschouw bovenstaand synthetisch peptide. Het bevat het aminozuur ornithine, een intermediair in de biosynthese van arginine, welke normaal gesproken
Nadere informatie1 (~20 minuten; 15 punten)
HERTENTAMEN Moleculaire Cel Biologie (8A840) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld & Dr. M. Merkx 20-04-2012 14:00 17:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal + 1 bonusvraag! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik
Nadere informatieNederlandse Samenvatting
Nederlandse Samenvatting Samenvatting De mogelijkheid om genen op een specifieke wijze te reguleren creëert diverse manieren om genfunctie te kunnen bestuderen of moduleren. Artificiële transcriptiefactoren
Nadere informatieTheraScreen : K-RAS Mutation Kit Voor de detectie van 7 mutaties in het K-RAS-gen
TheraScreen : K-RAS Mutation Kit Voor de detectie van 7 mutaties in het K-RAS-gen Voor gebruik op het Roche LightCycler 480 Real-Time PCR System (Instrument II) (catalogusnr.: 05015278001) en het Applied
Nadere informatieGENOMISCH KOOKBOEK LEERLINGENHANDLEIDING
GENOMISCH KOOKBOEK LEERLINGENHANDLEIDING LEERLINGENHANDLEIDING GENOMISCH KOOKBOEK 1 HOOFDSTUK 1 DNA EN DE ROL VAN RNA BIJ TRANSCRIPTIE 1.1 Hieronder zie je een vak met daarin de begrippen DNA en RNA. Maak
Nadere informatieUITWERKING CCVS-TENTAMEN 21 juli 2017
UITWERKING CCVS-TENTAMEN 21 juli 2017 Frank Povel NB. Deze uitwerking is door mij gemaakt en is niet de uitwerking die de CCVS hanteert. Er kunnen dan ook op geen enkele wijze rechten aan deze uitwerking
Nadere informatieDe invloed van intestinale helminthen op de gastro-intestinale microflora
De invloed van intestinale helminthen op de gastro-intestinale microflora Tessa Gryp Verhandeling ingediend tot het verkrijgen van de graad van Master in de Biomedische Wetenschappen Promotor: Prof. Dr.
Nadere informatieINSTRUCTIES VOOR STAALAFNAME Centrum voor Menselijke Erfelijkheid Erk. nr 8/24990/92/000 Tel fax
I. Toelichting bij het indienen van aanvragen voor genetisch onderzoek 1. Aanvragen Het voorziet in verschillende aanvraagformulieren voor de verschillende diagnostische testen. Om eventuele fouten en
Nadere informatiea. Geef de 1-lettercode van de aminozuren in het peptide in de corresponderende volgorde. (4P) LLORETDEMAR (iedere fout -1P)
TENTAMEN BIOCHEMIE (8RA00) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 28-06-2013 09:00 12:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik geen rode pen! 1 Peptiden en eiwitten (~15 minuten;
Nadere informatieSPECIALE EIGENSCHAPPEN TEKNOHEAT 650 A geeft een zilverachtige laag die een hitte tot +650 C kan verdragen.
www.teknos.com GEGEVENS BLAD 1175 TEKNOHEAT 650 A 14.08.2006 Silicone Aluminium Verf VERF TYPE TEKNOHEAT 650 A is een silicone aluminium verf. GEBRUIK Wordt gebruikt op hete oppervlakken zowel binnen als
Nadere informatievwo eiwitsynthese 2010
vwo eiwitsynthese 2010 Aan- en uitzetten van genen Escherichia coli leeft in de dikke darm van onder andere de mens. Deze bacterie heeft vijf structurele genen die coderen voor enzymen die betrokken zijn
Nadere informatiea. Geef de 1-lettercode van de aminozuren in het peptide in de corresponderende volgorde. (4P) WEETIKNIET
HERTENTAMEN Eindtoets BIOCHEMIE (8RA00) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 16-08-2013 09:00 12:00 (totaal 100 punten) 6 opgaven in totaal! (aangegeven tijd is indicatie) Gebruik geen rode pen! 1 Peptiden en eiwitten
Nadere informatieGESCHIEDENIS v/d VIROLOGIE. Adolf Eduard MAYER (1843-1942)
www.virologie.be GESCHIEDENIS v/d VIROLOGIE Adolf Eduard MAYER (1843-1942) GESCHIEDENIS v/d VIROLOGIE Ziek blad vermalen Sap op gezond blad: wordt ook ziek Overdraagbare ziekte! Adolf Eduard MAYER (1843-1942)
Nadere informatieChymotrypsine. Deze heeft een S1 pocket waarin grote, aromatisch zijstaarten passen. Waarschijnlijk past de zijstaart van X daar ook in.
1 Peptiden en eiwitten (~30 minuten; 20 punten) a. Geef de 1-lettercode van de volgende supersnelle, maar recent ook haperende, aminozuursequentie. De sequentie bevat een non-proteïnogeen aminozuur welke
Nadere informatieSynthetische biologie in de praktijk. igem TU Eindhoven 2016
Synthetische biologie in de praktijk Doelgroep: Vakgebied: Tijdsduur: HAVO/VWO bovenbouw Biologie ± 40 minuten Inleiding Synthetische biologie is het (her)programmeren van een biologisch systeem (cellen
Nadere informatieBloei van de blauwalg
Bloei van de blauwalg Blooms like it hot was een kop in het wetenschappelijke tijdschrift Science in april 2008. De onderzoekers Hans Paerl en Jef Huisman wijzen daarmee op een toename van de algenbloei
Nadere informatieMoleculaire Celbiologie BAC3 (Biochemie) 2007-2008
Moleculaire Celbiologie BAC3 (Biochemie) 2007-2008 E. De Herdt In deze cursus wordt de basis gelegd om biologische verschijnselen te kunnen verklaren op moleculair vlak. Een goede kennis van de verschillende
Nadere informatie2,4. Samenvatting door R woorden 5 maart keer beoordeeld. Biologie voor jou. Stofwisseling Biologie. Atomen en Moleculen
Samenvatting door R. 1478 woorden 5 maart 2014 2,4 30 keer beoordeeld Vak Methode Biologie Biologie voor jou Stofwisseling Biologie Atomen en Moleculen -Stof à moleculen à atomen (in kleine hoeveelheden
Nadere informatieINSTRUCTIES VOOR STAALAFNAME Centrum voor Menselijke Erfelijkheid Erk. nr 8/24990/92/000 Tel fax
I. Toelichting bij het indienen van aanvragen voor genetisch onderzoek 1. Aanvragen Het voorziet in verschillende aanvraagformulieren voor de verschillende diagnostische testen. Om eventuele fouten en
Nadere informatieNaam: Studentnummer: Opleiding:..
EINDTETS Biochemie (8RA00) en TENTAMEN Biochemie (8S135) Prof. Dr. Ir. L. Brunsveld 25-06-2014 09:00 12:00 (totaal 100 punten, plus max. 5 extra voor bonus) 6 opgaven in totaal + 1 bonusvraag! (aangegeven
Nadere informatieDNA/RNA extracties uit FFPE weefsel Dr. Sc. Elke Boone, H.-Hartziekenhuis Roeselare-Menen
H.-Hartziekenhuis Roeselare - Menen vzw Wilgenstraat 2-8800 Roeselare DNA/RNA extracties uit FFPE weefsel Dr. Sc. Elke Boone, H.-Hartziekenhuis Roeselare-Menen Belang van intacte DNA/RNA moleculen voor
Nadere informatieTentamen Genetica 22-10-2004 Studentnr:
CONTROLEER OF DIT TENTAMEN 11 PAGINA S BEVAT. Veel succes! Je mag de achterkant van het papier ook zo nodig gebruiken, maar beantwoord vragen 1-6 niet op blaadjes van vraag 7 en de daarop volgende. 1.
Nadere informatieRapportering voor het jaar 2016 Referentiecentrum voor NOROVIRUS.
Coördinator referentiecentrum Naam: N. Botteldoorn Tel 02 642 51 83 Fax: 02 642 52 40 Rapportering voor het jaar 2016 Referentiecentrum voor NOROVIRUS. Instelling: WIV Straat: J. Wijtsmanstraat Stad: Brussel
Nadere informatieSamenvatting. Figuur 1. Algemene structuur van een nucleotide (links) en de structuren van de verschillende basen (rechts).
DA is het molecuul dat in levende organismen alle genetische informatie bevat. et komt doorgaans voor als een dimeer van twee complementaire nucleotide-polymeren, waarbij de individuele nucleotiden in
Nadere informatieWe wensen je veel succes met studeren en het halen van jouw tentamens!
Voorwoord Beste geneeskundestudent, Voor je ligt de samenvatting van Blok 1.1.1 Deel 2 voor de studie geneeskunde. SlimStuderen.nl heeft de belangrijkste informatie uit alle verplichte literatuur voor
Nadere informatieScheidingsmethoden methode principe voorbeeld. destilleren verschil in kookpunt wijn whiskey. filtreren verschil in deeltjesgrootte koffie
1.2 Twee of meer atoomsoorten samen vormen een molecuul : bouwsteen die bestaat uit twee of meer atomen Atoom : bouwsteen van een molecuul Stoffen Zuivere stoffen Elementen: stoffen waarvan de bouwstenen
Nadere informatieS-DiaMGTV TM Real-Time PCR detectie van Mycoplasma genitalium en Trichomonas vaginalis
DIAGENODE Human Rhinovirus Real-Time PCR kit INSTRUCTIONS FOR USE Kit Referentie: DDGS-60-L100 Versie 01 Laatste herzieningsdatum: 01.07.2015 S-DiaMGTV TM Real-Time PCR detectie van Mycoplasma genitalium
Nadere informatieDNA en misdaadonderzoek in de klas: EDVOTEK kits speciaal voor het onderwijs
DNA en misdaadonderzoek in de klas: EDVOTEK kits speciaal voor het onderwijs Eurofysica vertegenwoordigt EDVOTEK, een Amerikaans bedrijf dat sinds 1987 educatief materiaal ontwikkelt voor biotechnologie,
Nadere informatieAutogeen snijden. Het proces en de gassen
Laskennis opgefrist (nr. 36) Autogeen snijden. Het proces en de gassen Het autogeensnijden is in de metaalindustrie nog altijd het meest toegepaste thermische snijproces. Deze populariteit ontleent het
Nadere informatieMeten en Maken 1. Toets Harris 26-04-2010
Meten en Maken 1 Toets Harris 26-04-2010 Deze toets bestaat uit vier opgaven die even zwaar tellen. De vier opgaven bestaan allemaal uit deelvragen. Maak elke opgave op een apart antwoordblad. Dit maakt
Nadere informatie