Labboekje. Medische Microbiologie. Virologie (LKV) Zoeken op basis van serologie.

Transcriptie

1 Labboekje Medische Microbiologie Virologie () Zoeken op basis van serologie. 1

2 Inhoudsopgave Adenovirus...4 BK virus...5 Bof serologie...6 Parotitis epidemica...6 Chlamydia trachomatis, zie ook Chlamydia psittaci en Chlamydia pneumoniae...7 SOA onderzoek...7 Geslachtsziekte onderzoek...7 Chlamydia psittaci PCR...8 Papegaaienziekte PCR... 8 Chlamydia pneumoniae PCR... 9 Coxiella burnetti serologie Q-koorts...10 CMV...11 Cytomegalovirus...11 Dengue Knokkelkoorts...12 DHF Dengue hemorragische koorts...12 EBV...13 Epstein-Barr Virus Enterovirus...14 Enterovirus Hepatitis A HAV serologie Hepatitis A virus...15 Hepatitis B HBV...16 Hepatitis B Virus kwantitatief...16 Hepatitis B Virus genoring...16 Hepatitis B Virus resistentie Hepatitis C HCV...17 Hepatitis C Virus kwalitatief...17 Hepatitis C Virus kwantitatief...17 Hepatitis C Virus genoring...17 Hepatitis C Virus resistentie...17 Hepatitis D HDV serologie...18 Hepatitis D virus Hepatitis E HEV serologie Hepatitis E virus...19 HSV...20 Herpes Simplex Virus...20 Koortslip...20 HHV Humaan Herpes Virus HHV Humaan Herpes Virus HHV Humaan Herpes Virus Humaan Parechovirus PCR Kwalitatief...24 HIV Humaan Immunodeficiëntie Virus 1 kwantitatief...25 Humaan Immunodeficiëntie Virus 1 resistentie/genoring...25 HIV-2 PCR...26 Humaan Immunodeficiëntie Virus 2 kwantitatief

3 Humaan Immunodeficiëntie Virus 2 resistentie...26 HTLV I/II serologie...27 Hu T-lymphotropic virus JC virus...28 Mazelen serologie...29 Mycoplasma serologie...30 Mycoplasma pneumonia Mycoplasma hominis...30 Parvovirus...31 Rubella serologie...32 Rode hond...32 Respiratoire virussen...33 Adenovirus...33 Enterovirus Influenza A virus...33 Influenza B Virus RSV (Respiratoir Syncytiaal Virus) hmpv (Hu Metapneumovirus)...33 Rhinovirus...33 Humaan Parechovirus...33 Parainfluenzavirus 1 t/m Coronavirus Rotavirus VZV PCR kwantitatief...35 Variciella Zoster Virus HHV Waterpokken Gordelroos

4 Minimale Adenovirus PCR: EDTA-bloed, EDTA-plasma Kweek: Feces Kweek: Feces in bouillon PCR: EDT5 PCR:0.5 ml Kweek: feces in bouillon PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Kweek: Tweemaal per week Duur van onderzoek PCR:1 dag Kweek: 1 dag PCR: PCR kwantitatief Kweek: Antigeentest 4

5 BK virus EDTA-plasma EDT5 Minimale 0.5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Duur van onderzoek 1 dag PCR kwalitatief 5

6 Bof serologie Parotitis epidemica stolbloed STG5 Minimale 5 ml Eenmaal per week Duur van onderzoek 1 dag EIA 6

7 Minimale Duur van onderzoek Inleverlocatie materiaal Chlamydia trachomatis, zie ook Chlamydia psittaci en Chlamydia pneumoniae SOA onderzoek Geslachtsziekte onderzoek Serologie: Stolbloed PCR: Diverse materialen, Urine, sputum PCT: M.b.v. een microtest (Abbott CTNG transportmedium) uit kit Steriele container voor urine/sputum Serologie: STG5 PCR: Materiaal afnemen uit de endocervix, urehtra, conjuctiva. Serologie: 5 ml stolbloed PCR: 1 uitstrijk in microtest transportmedium, 5 ml urine first-void-urine insturen Serologie: eenmaal per week PCR: 2 maal per week op dinsdag en donderdag Serologie: 1 dag PCR: 2 dagen PCR: Op indivatie LGV ring mogelijk indien uitslag positief is. Positieve Chlamydia uit anus wordt altijd voor LGV naar GG&GD gestuurd Zweedse variant ook aantoonbaar Microtest aanvragen en ophalen bij LKB, L1-205, tel LKB Serologie: L1-205 PCR: L1-205 Serologie: EIA PCR: PCR Positieve uitslag is bewijzend voor de aanwezigheid van Chlamydia trachomatis DNA Chlamydia PCR wordt vaak samen uitgevoerd met de gonokokken PCR 7

8 Chlamydia psittaci PCR Minimale Papegaaienziekte PCR Keel-, nasopharynxwat (droge wat) en liquor, sputum, BAL Flexibele wat voor keel/neus Steriele containers voor liquor, BAL en sputum 1 uitstrijk 1 container per materiaal 2 maal per week op dinsdag en donderdag (onder voorbehoud) Duur van onderzoek 2 dagen LKB PCR Negatief 8

9 Minimale Chlamydia pneumoniae PCR Keel-, nasopharynxwat (droge wat) en liquor, sputum, BAL Flexibele wat voor keel/neus Steriele containers voor liquor, BAL en sputum 1 uitstrijk 1 container per materiaal 2 maal per week op dinsdag en donderdag (onder voorbehoud) Duur van onderzoek 2 dagen LKB PCR Negatief 9

10 Coxiella burnetti serologie Minimale Duur van onderzoek Q-koorts stolbloed STG5 5 ml Materiaal wordt opgestuurd naar een extern laboratorium (RIVM) 10

11 CMV Minimale Cytomegalovirus PCR: EDTA-bloed, EDTA-plasma, Bloedspot, Urine, Biopt (colon of oesophagus) Serologie: stolbloed Kweek: Urine, BAL PCR: Urine in steriele container, Bloedspot op speciaal kartonnetje, Biopt in potje virus verzendmedium Kweek: Urine en BAL in steriele container PCR: EDT5 Serologie: STG5 PCR: 0.5 ml bloed, 5 ml urine, 1 biopt, 1 bloedspot kartonnetje Serologie: 5ml Kweek: 5 ml PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden Kweek: Eenmaal per week PCR: 1 dag Duur van onderzoek Serologie: 1 dag Kweek: 2 dagen Virus verzendmedium aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR: PCR kwantitatief Serologie: EIA Kweek: Viruskweek op diverse cellijnen 11

12 Dengue Knokkelkoorts DHF Dengue hemorragische koorts stolbloed STG5 Minimale 5 ml 5 x per week Duur van onderzoek 1 dag Immunochromatografische sneltest 12

13 EBV Minimale Epstein-Barr Virus PCR: EDTA-bloed, EDTA-plasma Serologie: Stolbloed PCR: EDT5 Serologie: STG5 PCR: 0.5 ml Serologie: 5 ml PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: Eenmaal per week Duur van onderzoek PCR: 1 dag Serologie: 1 dag PCR: PCR kwantitatief Serologie: EIA 13

14 Enterovirus Minimale Enterovirus EDTA-bloed EDTA-plasma Feces Liquor Feces in fecescontainer of in bouillon Liquor in steriele container EDT5 0.5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Voor Enterovirus kweek:link naar feceskweek, urinekweek en keel/neuswatkweek 1 dag Duur van onderzoek Bouillon aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR kwalitatief 14

15 Hepatitis A HAV serologie Hepatitis A virus stolbloed STG5 Minimale 5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Duur van onderzoek 1 dag EIA 15

16 Hepatitis B HBV Hepatitis B Virus kwantitatief Hepatitis B Virus genoring Minimale Duur van onderzoek Hepatitis B Virus resistentie PCR: EDTA-plasma Serologie: Stolbloed PCR: EDT7 Serologie: STG5 PCR: 2.5 ml Serologie: 5 ml Kwantitatief: Tweemaal per week Genoring: Eenmaal per week Resisitentie: Eenmaal per week Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden Kwantitatief: 1 dag Genoring: 1 week Resisitentie: 1 week Serologie: 1 dag Prikaccidenten melden bij de BGD PCR: PCR Serologie: EIA Indien HBV kwantitatief positief, wordt in overleg met viroloog resistentie en genoring bepaald 16

17 Hepatitis C HCV Hepatitis C Virus kwalitatief Hepatitis C Virus kwantitatief Hepatitis C Virus genoring Minimale Duur van onderzoek Hepatitis C Virus resistentie PCR: EDTA-plasma Serologie: stolbloed PCR: EDT7 Serologie: STG5 PCR: 2.5 ml Serologie: 5 ml Kwalitatief: Eenmaal per week Kwantitatief: Eenmaal per week Genoring: Eenmaal per week Resisitentie: Eenmaal per week Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden Kwalitatief en kwantitatief 1 dag Genoring en resistentie: 1 week Serologie: 1 dag Prikaccidenten melden bij BGD PCR: PCR Serologie: EIA Indien screening HCV positief, wordt een kwantitatieve PCR ingezet. Indien kwantitatieve PCT positief, wordt in overleg met viroloog resistentie en genoring bepaald 17

18 Hepatitis D HDV serologie Minimale Duur van onderzoek Hepatitis D virus stolbloed STG5 5 ml Materiaal wordt opgestuurd naar een extern laboratorium (Sanquin) 18

19 Hepatitis E HEV serologie Minimale Duur van onderzoek Hepatitis E virus stolbloed STG5 5 ml Materiaal wordt opgestuurd naar een extern laboratorium (Sanquin) 19

20 HSV Minimale Herpes Simplex Virus Koortslip PCR: EDTA-bloed, EDTA-plasma, Blaasjesvocht Liquor Serologie: stolbloed Kweek: Blaasjesvocht Resistentie: Blaasjesvocht PCR: Blaasjesvocht in virus verzendmedium en liquor in steriele container Kweek: Direct preparaat van blaasjesvocht Resistentie: Blaasjesvocht in virusverzendmedium PCR: EDT5 Serologie: STG5 HSV-kweek alleen op aanvraag HSV-resistentie alleen op aanvraag PCR: 0.5 ml Serologie: 5 ml Kweek: 1 preparaat Resistentie: 1 potje PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: Eenmaal per week Kweek: Op aanvraag Resistentie: Op aanvraag PCR: 1 dag Duur van onderzoek Serologie: 1 dag Kweek: 1 dag Resistentie: 2 weken Virus verzendmedium aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR: PCR kwantitatief Serologie: Immunofluorescentie Kweek: Immunofluorescentie Resistentie: Viruskweek op diverse cellijnen 20

21 HHV 6 Minimale Humaan Herpes Virus 6 EDTA-plasma Serum Liquor Liquor in steriel container EDT5 STG5 2 ml bloed 0.5 ml liquor Kwalitatief: dagelijks tijdens kantoortijden Kwantitatief: wordt opgestuurd naar het UMCU Duur van onderzoek Kwalitatief: 1 dag PCR Kwantitatieve bepaling wordt alleen opgestuurd in overleg met de viroloog en als kwalitatieve bepaling positief. 21

22 HHV 7 Minimale Humaan Herpes Virus 7 EDTA-plasma Serum Liquor 2 ml bloed 0.5 ml liquor Kwalitatief: dagelijks tijdens kantoortijden Kwantitatief: wordt opgestuurd naar het UMCU Duur van onderzoek Kwalitatief: 1 dag PCR Indien HHV7 kwalitatief positief, wordt alleen in overleg met viroloog kwantitatieve bepaling opgestuurd 22

23 HHV 8 Minimale Duur van onderzoek Humaan Herpes Virus 8 EDTA-plasma Liquor Liquor in steriele container EDT5 0.5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden 1 dag PCR kwantitatief 23

24 Minimale Humaan Parechovirus PCR Kwalitatief EDTA-bloed EDTA-plasma Feces Liquor Feces in fecescontainer of in bouillon Liquor in steriele container EDT5 0.5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Voor Enterovirus kweek: link naar feceskweek, urinekweek en keel/neuswatkweek 1 dag Duur van onderzoek Bouillon aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR kwalitatief 24

25 HIV-1 Minimale Duur van onderzoek Humaan Immunodeficiëntie Virus 1 kwantitatief Humaan Immunodeficiëntie Virus 1 resistentie/genoring PCR: EDTA-plasma Serologie: Stolbloed PCR: EDT7 Serologie: 3x EDT7 en 1x STG5 3 x 7 ml EDTA en 1 x 5 ml stolbloed PCR: 3 ml Serologie: 5 ml Kwantitatief: Driemaal per week Resistentie/genoring: Tweemaal per week Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden kwantitatief:1 dag Resistentie/ genoring: 2 weken Serologie: 1 dag Prikaccidenten melden bij de BGD PCR: PCR Serologie: EIA Bij nieuwe (HIV-positieve) patiënten wordt automatisch een genoring en resistentie uitgevoerd. Bij bekende patiënten wordt alleen in overleg met de viroloog een genoring en resistentie uitgevoerd Na uur en in het weekend wordt de HIV-sneltest uitgevoerd op het LAKC (hyperlink!!) 25

26 HIV-2 PCR Minimale Duur van onderzoek Humaan Immunodeficiëntie Virus 2 kwantitatief Humaan Immunodeficiëntie Virus 2 resistentie PCR: EDTA-plasma Serologie: Stolbloed PCR: EDT7 Serologie: STG5 PCR: 2 ml Serologie: 5 ml Kwantitatief: Wordt opgestuurd naar Rotterdam Resistentie: Wordt opgestuurd naar Rotterdam Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: 1 dag Prikaccidenten melden bij de BGD PCR: PCR Serologie: EIA Wordt alleen opgestuurd in overleg met viroloog Na uur en in het weekend wordt de HIV-sneltest uitgevoerd op het LAKC (hyperlink!!) 26

27 HTLV I/II serologie Minimale Hu T-lymphotropic virus stolbloed STG5 5 ml Eenmaal per week Duur van onderzoek 1 dag EIA 27

28 Minimale JC virus Liquor Liquor in steriele container 0.5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Duur van onderzoek 1 dag PCR kwantitatief 28

29 Mazelen serologie stolbloed STG5 Minimale 5 ml Eenmaal per week Mazelenkweek: link naar keel/neuswatkweek en liquorkweek Duur van onderzoek 1 dag EIA 29

30 Minimale Duur van onderzoek Inleverlocatie materiaal PCR: Twee maal per week op dinsdag en donderdag (onder voorbehoud) Serologie: Eenmaal per week Kweek: Dagelijks tijdens kantoortijden PCR: 2 dagen Serologie: 2 dagen Kweek: 2-7 dagen Kweek: Wordt standaard gekweekt, alleen in overleg met artsmicrobioloog PCR: LKB: Serologie: Kweek: LKB PCR: L1-205 Kweek: L1-205 Mycoplasma serologie Mycoplasma pneumonia Mycoplasma hominis PCR: Keel-, nasopharynxwat (droge wat) en liquor, sputum en BAL Serologie: stolbloed Kweek: Genitale uitstrijken en materialen van neonaten PCR: Flexibele wat voor keel/neus Steriele containers voor liquor, BAL en sputum Kweek: Wattendrager in transportmedium en preparaat (steriele wattendrager afrollen op een objectglas, niet op matrand en meezenden in plastic hoesje). Serologie: STG5 PCR: 1 Uitstrijk, 1 Container Serologie: 5 ml Kweek: 1 Uitstrijk PCR: PCR Serologie:CBR Kweek: Kweek 30

31 Minimale Parvovirus PCR: EDTA-plasma Serologie: Stolbloed PCR: EDT5 Serologie: STG5 PCR: 0.5 ml Serologie: 5 ml PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: Eenmaal per week Duur van onderzoek PCR: 1 dag Serologie: 1 dag PCR: PCR kwantitatief Serologie: Immunofluorescentie 31

32 Rubella serologie Rode hond stolbloed STG5 Minimale 5 ml Dagelijks tijdens kantoortijden Duur van onderzoek 1 dag EIA 32

33 Respiratoire virussen Adenovirus Enterovirus Influenza A virus Influenza B Virus RSV (Respiratoir Syncytiaal Virus) hmpv (Hu Metapneumovirus) Minimale Duur van onderzoek Rhinovirus Humaan Parechovirus Parainfluenzavirus 1 t/m 4 Coronavirus Rotavirus PCR: Neus/keelwat, BAL, Neus/keelspoelsel Kweek Rota/Adeno: Feces Kweek RSV: Keel/neusspoelsel, copanwat PCR: Neus/keelwat in speciaal afnamesysteem, BAL in steriele container, Neus/keelspoelsel in steriele container Kweek Rota/Adeno: Feces in bouillon Kweek RSV: Neus/keelspoelsel in steriele container PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Kweek Rota/Adeno: Tweemaal per week Kweek RSV: Dagelijks tot uur (in het seizoen) PCR: 1 dag Kweek Rota/Adeno: 1 dag Kweek RSV: 1 uur Speciaal afnamesysteem aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR: PCR kwalitatief Kweek Rota/Adeno: Antigeentest Kweek RSV: Sneltest 33

34 34

35 VZV PCR kwantitatief Variciella Zoster Virus HHV3 Waterpokken Minimale Gordelroos PCR: EDTA-Bloed, EDTA-plasma, Blaasjesvocht Liquor Serologie: Stolbloed Kweek: Blaasjesvocht PCR: Blaasjesvocht in virus verzendmedium en liquor in steriele container Kweek: Direct preparaat van blaasjesvocht PCR: EDT5 Serologie: STG5 VZV-kweek alleen op aanvraag PCR: 0.5 ml Serologie: 5 ml Kweek: 1 preparaat PCR: Dagelijks tijdens kantoortijden Serologie: Dagelijks tijdens kantoortijden Kweek: Op aanvraag PCR: 1 dag Duur van onderzoek Serologie: 1 dag Kweek: 1 dag Virus verzendmedium aanvragen en ophalen bij K1-121, tel: PCR: PCR kwantitatief Serologie: EIA Kweek: Immunofluorescentie 35