Rekenen aan de efficiëntie van het hersennetwerk

Transcriptie

1 Rekenen aan de efficiëntie van het hersennetwerk Robert Kooij Januari 0 Wie ben ik? Affiliaties Principal Scientist bij TNO Professor Technische Universiteit Delft Interesses Kwaliteit van netwerken en diensten Robuustheid van complexe netwerken

2 Overzicht Mini-college: complexe netwerken Workshop Efficiëntie vs. prestaties van netwerken Workshop Efficiënt hersennetwerk? Reken maar! Workshop Efficiëntie vs. prestaties van netwerken Mini-college complexe netwerken

3 Mini-college complexe netwerken Mini-college complexe netwerken

4 Mini-college complexe netwerken Netwerken worden gerepresenteerd als grafen Elementen van een graaf Knopen Verbindingen Mini-college complexe netwerken Kortste pad tussen knoop i en knoop j Pad met minimum aantal links tussen knoop i en knoop j Lengte kortste pad tussen knoop en is

5 Mini-college complexe netwerken Karakteristieke pad lengte (= L) Kortste pad lengte: gemiddeld over alle paren knopen Paar Kortste pad lengte L =. Mini-college complexe netwerken Clusteringcoefficient C i van knoop i mate van clustering van buren van knoop i C = 6 Clusteringcoefficient van graaf C = N C i

6 Efficiëntie van hersennetwerken Efficiëntie van hersennetwerken Netwerkanalyse van ± 900 functionele hersengebieden Relatie IQ en netwerkkarakteristieken L C Significante correlatie tussen L en IQ! 6

7 Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Workshop Efficiëntie vs. prestaties van netwerken Workshop 7

8 Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Workshop Workshop 6 8

9 Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Workshop 7 Workshop 8 9

10 Workshop Juf Jeannette gaat op vakantie. Ze gaat een verre reis maken. Ze gaat naar Afrika en ze blijft zes weken weg. Jullie klas krijgt dan les van Nick en Simon. Als ze terugkomt, neemt ze voor jullie allemaal een babytijgertje mee om thuis te knuffelen. 9 Workshop Iris heeft een zoon. Hij houdt enorm van gitaar spelen. Om een leraar te vinden, heeft ze een advertentie geplaatst op het Internet. Binnen drie weken heeft ze gevonden wat ze zocht. De jongen speelt nu de sterren van de hemel. 0 0

11 Workshop Fabiënne zit op tennis. Ze heeft x per week les van Loek. Met haar forehand slaat ze een stuk harder dan met haar backhand. Vorig jaar deed ze mee met een toernooi. Daar heeft ze de finale gehaald. Workshop Efficiënt hersennetwerk? Reken maar! Visualiseren Clustering coefficient Karakteristieke pad lengte Optimale extra verbinding

12 Workshop Cytoscape Workshop

13 Workshop Workshop

14 Workshop Opgave Voer netwerk in in Cytoscape. Pas visualisatie aan. Opgave Bepaal clustering coefficient Opgave Bepaal karakteristieke pad lengte Opgave Welke extra verbinding minimaliseert de karakteristieke pad lengte? 7 Workshop 8

15 9