Klinische checklist aanbevolen Achondroplasie FGFR3 E of gdna

Transcriptie

1 Achondrogenesis COL2A1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Achondroplasie FGFR3 6 Paul Coucke Acrocapitofemorale dysplasie IHH DNA-sequenering 8 Paul Coucke Alagille syndroom 20p12 arraycgh 6 Angelman syndroom 15q11-15q13 AS, Happy Puppet Syndrome, methylatie MS-MLPA 6 chromosoom 15 Aniridia PAX6 DNA-sequenering en MLPA 3 maand Anterieure segment dysgenese FOXC1, PITX2 Axenfeld -Rieger malformatie DNA-sequenering en MLPA 3 maand Rieger syndroom Anterieure segment dysgenese PITX3 Axenfeld -Rieger malformatie DNA-sequenering en MLPA 3 maand Rieger syndroom Aortic valve disease NOTCH1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Apert Syndroom FGFR2 8 Paul Coucke Arterieel tortuositeit syndroom gen panel SLC2A10, FBLN4(=EFEMP2) DNA-sequenering 8 Paul Coucke Ataxia telangiectasia ATM DNA-sequenering 3 maand Beals-Hecht syndroom, Congenitale Contracturele Arachnodactylie, Arthrogryposis Distal Type 9 FBN2 DNA-sequenering 8 Best maculaire dystrofie (vitelliforme) BEST1 DNA-sequenering en MLPA 3 maand Bij voorkeur eerst alfafoetoproteïne bepalen COL6A3 geaccrediteerd Bethlem myopathie gen panel COL6A3, COL12A1 DNA-sequenering 8 Klinische informatie Bicuspid aortic valve (BAV) disease gen panel SMAD6, NOTCH1, NKX2,5 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Birt-Hogg-Dubé syndroom FLCN BHD DNA-sequenering 3 maand Blepharophimosis (BPES) type I / II FOXL2 BPES 1 / 2 DNA-sequenering coderende sequentie en MLPA 3 maand Brachydactyly, type A1 IHH DNA-sequenering 8 Paul Coucke Brittle Cornea Syndroom gen panel ZNF469, PRDM5 DNA-sequenering 8 Bruck syndroom gen panel FKBP10, PLOD2 E, gdna of F Brugada syndroom SCN5A DNA-sequenering 8 Paul Coucke Klinische informatie Klinische informatie

2 Buschke-Ollendorff LEMD3 DNA-sequenering 8 Paul Coucke CADASIL NOTCH3 Cerebral arteriopathy wih subcortical infarcts and leukencephalopathy DNA-sequenering van alle exonen met EGFL-domeinen (exonen 2-24) 3 maand Charcot-Marie-Tooth type 1A, ziekte van PMP22 CMT type 1A PMP22-duplicatie MLPA 8 Choroïderemie CHM DNA-sequenering 3 maand GUCY2D, AIPL1, CRX, ABCA4, Cone Rod Dystrophy dominant CERKL, CNNM4, RPGRIP1, PROM1, PRPH2 staafjes-kegeltjesdystrofie DNA-sequenering 3 maand Cone Rod Dystrophy - recessief ABCA4 staafjes-kegeltjesdystrofie DNA-sequenering 3 maand Congenitaal Centraal Hypoventilatie syndroom PHOX2B - DNA-sequenering drie coderende exonen 3 maand Congenital heart disease nonsyndromic 2 TAB2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke kortere uitslagtermijn bij neonaat, na overleg Cowden disease PTEN Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrome (BRRS). Proteus DNA-sequenering en MLPA 3 maand syndrome. Craniosynostosis FGFR2 8 Paul Coucke Craniosynostosis Boston type MSX2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Cri-du-Chat syndroom 5p12 arraycgh 6 ELN, FBLN4(=EFEMP2), FBLN5, LTBP4, ATP6V0A2, Cutis Laxa gen panel PYCR1, ALDH18A1, ATP7A, COG7, TALDO1, SCYL1BP1(=GORA B), NAA10 DNA-sequenering 8 Deficiency of Vitamin K-Dependent Clotting VKORC1, GGCX Factors DNA-sequenering 8 Paul Coucke NR5A1 (= SF1), Disorder of sex development SOX9, WT1, SRY, DSD DNA-sequenering en MLPA 3 maand DMRT1, AR Distale Spinale Musculaire atrofie (X-linked ATP7A distal SMA) DNA-sequenering 8

3 DNA-sequenering GJB2 exon 1 + Doofheid ( DFNB1) GJB2 (Cx26), GJB6 exon 2 + detectie twee (Cx30) recurrente grote deleties in 3 maand GJB6 Ectopia lentis et pupillae ADAMTSL4 DNA-sequenering 8 Ectopia lentis gen panel EDS, arthrochalasis type (type VIIA type VIIB) LTBP2, ADAMTSL4, FBN1 COL1A1, COL1A2 (exons 5-8) DNA-sequenering 8 E, gdna of F EDS, hypermobiele type F Biochemische analyse 4 maand EDS, klassieke type (type I/II) COL5A1, COL5A2 E, gdna of F EDS, recessieve EDS panel B3GALT6, XYLT1, B3GAT3, B4GALT7, PLOD1, FKBP14, SLC39A13, CHST14, DSE, ADAMTS2 DNA-sequenering 8 EDS, vasculaire type (type IV) COL3A1 E, gdna of F Enhanced S-cone syndrome NR2E3 ESCS DNA-sequenering 3 maand Erfelijke borst- en ovariumkanker BRCA1 / BRCA2 / PALB2 DNA-sequenering / MLPA 3 maand Erfelijke colonkanker Familiale adenomateuze polypose van het colon APC FAP DNA-sequenering en MLPA 3 maand (FAP) Erfelijke colonkanker non-polyposis, MLH1, MSH2, mutatie-onderzoek van MLH1. HNPCC mutatie-onderzoek MSH6 MSH2. MSH6 3 maand Erfelijke colonkanker non-polyposis, HNPCC onderzoek naar microsatellietinstabiliteit - microsatellite instability, en P fragment-analyse 3 maand (MSI)

4 Fabry, ziekte van GLA alpha galactosidase A deficiëntie DNA-sequenering en MLPA 3 maand Genetisch onderzoek bij mannen is enkel zinvol in geval de activiteit van het alfa-galactosidase-enzyme verlaagd is. Graag de resultaten van dit onderzoek bezorgen samen met de aanvraag. Voor vrouwen is het verstrekken van de klinische informatie een vereiste. FBN1, COL3A1, TGFBR1, TGFBR2, Familial Thoracic Aortic Aneurysm (FTAA) ACTA2, SMAD3, gen panel 1 TGFB2 geaccrediteerd FBN1, COL3A1, TGFBR1, TGFBR2, ACTA2, SMAD3, TGFB2, MYH11, SKI (exon1), TGFB3 DNA-sequenering; MLPA in 2e instantie voor FBN1 en TGFBR1/TGFBR2 (nieuwe aanvraag vereist) 8 Paul Coucke Familial Thoracic Aortic Aneurysm (FTAA) gen panel 2 MYLK, SLC2A10,NOTCH1, FBN2 (relevant exons), ADAMTS10, FBLN4(=EFEMP2), FLNA, ELN, PRKG1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Fanconi anemia PALB2 DNA sequenering 3 maand Indicatie erfelijke borstkanker: enkel na uitsluiten BRCA1/2 mutatie Farmacogenetisch onderzoek: Butyryl cholinesterase deficiëntie Farmacogenetisch onderzoek: Hepatitis C behandelingsprognose BCHE DNA-sequenering 3 maand IL28B Hepatitis C virus, susceptibility to Interleukine 28B IL28B polymorfismen DNA-sequenering van SNP1 (rs ) en SNP2 (rs ) 2 Feingold syndroom MYCN DNA-sequenering 8 Paul Coucke Feochromocytomen, hereditaire SDHB, SDHC, DNA-sequenering + MLPA 3 maand paragangliomen SDHD Fertiliteitsprobleem herhaald miskraam - High Resolution Melting-Curve MTHFR MTHFR c.677c>t 3 MTHFR Analysis

5 Fertiliteitsprobleem man azoöspermia door CAVD CFTR C(B)AVD congenitale (bilaterale) afwezigheid van de vas deferens INNO-LiPA CFTR 19 en INNO- LiPA CFTR 17+Tn 3 Fertiliteitsprobleem man verstoorde spermatogenese Yq11 DAZ deletie. opsporen deleties AZFa, AZFb, AZFc multiplex PCR voor STS op Yq11 6 Fertiliteitsprobleem vrouw prematuur ovarieel falen Fertiliteitsprobleem: subfertiliteit, infertiliteit, herhaald miskraam Foetaal genetisch onderzoek DNAonderzoek voor familiale aandoening Foetaal genetisch onderzoek - karyotypering FMR1 vermoeden van chromosoomafwijking POF Prematuur ovariaal falen, FMR1-gerelateerd Prenataal onderzoek - Prenataal onderzoek, en H PCR en TP-PCR en fragmentanalyse H conventionele karyotypering 6 Chorionvlokken of vruchtwater Chorionvlokken of vruchtwater meestal DNA-sequenering; methodologie naargelang aandoening Conventionele karyotypering 6 10 werkdagen 1 week (chorionvlokke n) / 3 (vruchtwater) Paul Coucke Foetaal genetisch onderzoek - miskraam Miskraamweefsel arraycgh 6 Foetaal genetisch onderzoek - arraycgh Prenataal onderzoek Fragiele X geassocieerd Tremor-Ataxie syndroom Chorionvlokken of vruchtwater FMR1 FXTAS Fragiele X syndroom FMR1 arraycgh 7 dagen PCR en TP-PCR en fragmentanalyse PCR en TP-PCR en fragmentanalyse 6 6 FRMD7 gerelateerde infantiele nystagmus FRMD7 nystagmus DNA-sequenering 3 maand Gameetdonor (eiceldonor, spermadonor) Gameetdonor (eiceldonor, spermadonor) CFTR Gameetdonor (eiceldonor, spermadonor) SMN1 Generalized Arterial Calcification of Infancy chromosomenonderzoek dragerschap mucoviscidose dragerschap Spinale Musculaire Atrofie (SMA) H conventionele karyotypering 6 Inno-LiPA CFTR19 en Inno-LiPA CFTR17+Tn 3 MLPA 6 ENPP1, ABCC6 DNA-sequenering 8 Paul Coucke familiale mutatie moet voor de zwangerschap gekarakteriseerd zijn accreditatie geldt voor karyotypering van een vruchtwaterpunctie

6 ELN, FBLN4(=EFEMP2), FBLN5, LTBP4, ATP6V0A2, Geroderma osteodysplasticum gen panel PYCR1, DNA-sequenering 8 ALDH18A1, ATP7A, COG7, TALDO1, SCYL1BP1(=GORA B), NAA10 Hemorragische stroke COL4A1, COL4A2 DNA-sequenering 8 Klinische informatie Hereditaire drukneuropathie PMP22 HNPP PMP22-deletie MLPA 8 Hereditaire hemochromatose type I HFE Hereditary Cardiomyopathy gen panel Homocystiniuria, MTHFR MTHFR MYBPC3, MYH7, TNNT2 HRM-CA voor detectie van Cys282Tyr, His63Asp, Ser65Cys 3 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Thermolabiele MTHFR, Methylenetetrahydrofolat e reductase Thrombofilie Huntington, ziekte van HD Huntington chorea HRM-CA met ongelabelde probes voor de 677C>T mutatie 3 PCR en fragment-analyse voor bepalen lengte CAG repeat in HD-gen 3 Hypochondrogenesis COL2A1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Hypochondroplasia FGFR3 6 Paul Coucke Identiteitsbepaling paterniteitsbepaling PCR + fragment-analyse 2 maand Paul Coucke Identiteitsbepaling PCR + fragment-analyse 2 maand Paul Coucke Klinefelter syndroom XXY 47,XXY H Karyotyperen en FISH 6 Kniest dysplasia COL2A1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Langer-Giedion syndroom 8q24 arraycgh 6 voor diagnostische testen, volgende klinische informatie nodig: ferritine, transferrine saturatie klinisch neurologisch verslag vereist; presymptomatische test enkel na genetische raadpleging

7 Leber congenitale amaurosis CEP290, GUCY2D, AIPL1, CRX, CRB1, RPE65, IQCB1, LCA5, LRAT, NMNAT1, RDH12 LCA DNA-sequenering 3 maand Leri-Weill dyschondrosteosis SHOX qpcr 8 Limb-girdle dystrophy type 2I FKRP DNA-sequenering 4 maand Long QT syndroom SCN5A, KCNH2, KCNQ1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Maculaire dystrofie PRPH2 (RDS) DNA-sequenering 3 maand Megalocornea LTBP2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Melanoom, familiaal maligne CDKN2A coderend MLM; melanoma, voor p16(ink4) en cutaneous malignant p14(arf) DNA-sequenering CDKN2A-gen 3 maand Melorheostosis LEMD3 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Mentale retardatie array-cgh arraycgh 6 Microspherophakia LTBP2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Miller-Dieker syndroom 17p13.3 arraycgh 6 COL6A3 geaccrediteerd Mucoviscidose, volledig coderende sequentie CFTR-gen Mucoviscidose; InnoLiPA CFTR 19&CFTR17+Tn CFTR CFTR Muenke syndroom FGFR3 Multipele endocriene neoplasie (MEN) type 2A, type 2B Multiple epiphysaire dysplasie dominant type Multiple epiphysaire dysplasie recessief type Myosclerosis Myopathy gen panel RET Multiple endocriene neoplasie type 2A. type 2B; medullair schildkliercarcinoom. familiale Hirschsprung of B DNA-sequenering van de volledige coderende sequentie van het CFTR-gen Inno-LiPA CFTR19 en Inno-LiPA CFTR17+Tn DNA-sequenering (exonen ) 3 maand 3 6 Paul Coucke 3 maand COL2A1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke SLC26A2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke wordt pas uitgevoerd indien geen mutatie met de InnoLiPA 19&17 testen werd geïdentificeerd COL6A3, COL12A1 DNA-sequenering 8 Klinische informatie Myotone dystrofie type 1 DMPK ziekte van Steinert PCR-fragmentanalyse CTG repeat en TP-PCR 6

8 Neurofibromatose type 1 NF1 ziekte van von sequenering totaal cdna en vers EDTA-bloed! Recklinghausen MLPA 3 maand klinische checklist gewenst Neurofibromatose type 2 NF2 DNA-sequenering en MLPA 3 maand Occipital horn syndroom ATP7A DNA-sequenering 8 Oculair albinisme type 1 OA1 OA1 DNA-sequenering en MLPA 3 maand TYRP1, SLC45A2, Oculocutaan albinisme type 3, 4, 6 en 7 SLC24A2, OCA3, OCA4, OCA6, OCA7 DNA-sequenering en MLPA 3 maand C10ORF11 Oculocutaan albinisme type I / II TYR-gen en OCA-2 OCA1, OCA2 gen (P-gen) DNA-sequenering en MLPA 3 maand Optische atrofie type 1 OPA1 OPA1 DNA-sequenering en MLPA 3 maand Osteogenesis imperfecta gen panel 1 COL1A1, COL1A2 E, gdna of F Osteogenesis imperfecta gen panel 2 CRTAP, LEPRE1, PPIB, SERPINH1, FKBP10, SP7, SERPINF1, CREB3L1, TMEM38B, WNT1, IFITM5, PLOD2, BMP1, PLS3 E, gdna of F Osteopoikilosis LEMD3 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Ouder van kind met chromosomale afwijking - - H/ E karyotypering / arraycgh 6 Pancreatitis, hereditaire PRSS1 sequenering exon maand Pancreatitis, ideopatische CFTR InnoLipa19&17 3 maand FBN1, COL3A1, FBN1, COL3A1, TGFBR1, TGFBR2, DNA-sequenering; MLPA in 2e TGFBR1, TGFBR2, ACTA2, SMAD3, instantie voor FBN1 en ACTA2, SMAD3, Peripheral vascular disease gen panel TGFB2, MYH11, TGFBR1/TGFBR2 (nieuwe TGFB2 SKI (exon1), aanvraag vereist) geaccrediteerd TGFB3 8 Paul Coucke Pharmacogenetics Abacavir Multiplex PCR en fragmentanalyse HLA5701 hypersensitivity 2 Paul Coucke specifieer de chromosomale afwijking op het aanvraagformulier Polycystische nieren PKD1, PKD2 DNA sequenering 3-4 maand DNA sequenering Klinische informatie Porencephaly gen panel COL4A1, COL4A2 DNA-sequenering 8 methylatie chromosoom Prader-Willi syndroom 15q11-15q13 MS-MLPA 6 15 Primary congenital Glaucoma LTBP2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Proteïne S (alfa) deficiëntie PROS1 DNA-sequenering 3 maand

9 Proteus syndroom AKT1, en F DNA sequenering en bepalen van graad mosaïcisme d.m.v. restrictie en fragment-analyse voor c.49g A, (p.glu17lys) 3 maand Graag ook fibroblasten bezorgen van de aangedane regio Pseudoxanthoma Elasticum (PXE) gen panel ABCC6, ENPP1, GGCX, VEGFA(hotspots) DNA-sequenering; in 2e instantie MLPA voor ABCC6 (nieuwe aanvraag vereist) 8 Paul Coucke PXE-like syndrome with clotting deficiency GGCX DNA-sequenering 8 Paul Coucke Retinale dystrofie, early-onset RDH12 DNA-sequenering 3 maand RHO, PRPH2, PRPF31, CRX, RP, autosomaal dominant NR2E3, PRPF6, Retinitis pigmentosa, autosomaal dominant staafjesdystrofie PRPF8, RDH12, AD RP RP1, RPE65, DNA-sequenering 3 maand SNRNP200 Retinitis pigmentosa, autosomaal recessief Retinitis pigmentosa, X-gebonden USH2A, ABCA4, CERKL, CNGA1, CRB1, EYS, LRAT, MERTK, PDE6B, PROM1, RHO, RLBP1, RP1, RPE65 RPGR ORF15, RPGR exon 1-14, RP2, OFD1 RP, autosomaal recessief; AR RP; staafjesdystrofie DNA-sequenering 3 maand RP, X-gebonden DNA-sequenering 3 maand sequenering exonen 1-4 en Rett syndroom MECP2 3 maand MLPA RIN2 syndroom RIN2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Rubinstein-Taybi syndroom 16p13.3 dikke duim-hallux syndroom of syndroom van Rubinstein arraycgh 6 Rubinstein-Taybi syndroom: UPD analyse chromosoom 7 chr 7 dikke duim-hallux syndroom of syndroom van Rubinstein fragment-analyse microsatellieten chromosoom 7 2 maand bloed van beide ouders vereist Saethre-Chotzen syndroom TWIST ACS III DNA-sequenering coderende sequentie en MLPA 3 maand Smith-Magenis syndroom 17p11.2 arraycgh 6 Sorsby fundus dystrofie TIMP3 DNA-sequenering 3 maand Sotos syndroom - chromosomaal 5q35 H arraycgh 6

10 SMA; SMA type I, SMA Spinale musculaire atrofie SMN1 type II, SMA type III en SMA type IV MLPA 6 Werdnig-Hoffmann, Kugelberg-Welander Spondyloepiphyseal dysplasia congenita COL2A1 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Spondylo-megaepiphyseal-metaphyseal dysplasia NKX3-2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Stargardt, ziekte van ABCA4 DNA-sequenering 3 clomaand COL2A1, COL2A1 geaccrediteerd Stickler syndrome gen panel COL11A1, COL11A2 Thanatoforic dysplasia FGFR3 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Trisomie 13 chr 13 Patau syndroom array-cgh 1 week Trisomie 18 chr 18 Edwards syndroom array-cgh 1 week Trisomie 21 chr 21 syndroom van Down array-cgh 1 week Turner syndroom chr X H karyotypering en FISH 6 COL6A3 geaccrediteerd Ullrich congenital muscular dystrophy gen panel Uniparentale disomie (UPD) analyse chromosoom 11 Uniparentale disomie (UPD) analyse chromosoom 14 Uniparentale disomie (UPD) analyse chromosoom 15 Uniparentale disomie (UPD) analyse chromosoom 16 8 Paul Coucke COL6A3, COL12A1 DNA-sequenering 8 Klinische informatie chr 11 chr 14 chr 15 chr 16 Beckwith-Wiedemann syndroom fragment-analyse microsatellieten chromosoom 11 fragment-analyse microsatellieten chromosoom 14 fragment-analyse microsatellieten chromosoom 15 fragment-analyse microsatellieten chromosoom 16 2 maand 2 maand 2 maand 2 maand Usher syndroom, type IIA USH2A DNA-sequenering 3 maand VCFS. DiGeorge. 22q11.2 Velocardiofaciaal syndroom 22q11.2 microdeletie syndroom. arraycgh 6 CATCH22 Vermoeden van chromosomale afwijking array-cgh max. 6 moleculaire karyotypering bloed van beide ouders vereist bloed van beide ouders vereist bloed van beide ouders vereist bloed van beide ouders vereist

11 Vermoeden van chromosomale afwijking - conventionele karyotypering H conventionele karyotypering max. 6 Von Hippel-Lindau syndroom VHL DNA-sequenering en Q-PCR 3 maand Voorbereiding PGD (FISH op aanvraagformulier te specifiëren) - - H FISH 6 WAGR syndroom 11p13 arraycgh 6 Weill-Marchesani syndrome 1, recessive ADAMTS10 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Weill-Marchesani syndrome 3 recessive type LTBP2 DNA-sequenering 8 Paul Coucke Williams-Beuren syndroom 7q11.23 arraycgh 6 Wolf-Hirschhorn syndroom 4ptel arraycgh 6 specifieer de chromosomale afwijking op het aanvraagformulier