Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie

Transcriptie

1 Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie I

2 De opleiding Biologie richt zich op de bestudering van alle verschijningsvormen van leven en natuur en de processen die zich daarbinnen afspelen, op het doen van wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de zo verworven kennis. De opleiding wordt gekenmerkt door het aanbieden van algemene kennis op alle in de biologie te onderscheiden organisatieniveaus (van molecuul tot ecosysteem) en daaropvolgend een specialisatie in één der subdisciplines van de biologie: moleculaire biologie, ontwikkelingsbiologie, neurobiologie, ecologie, bio-informatica, wetenschapscommunicatie, en beleid, management en ondernemen. Studenten volgen eerst een brede bacheloropleiding van drie jaar, daarna stromen ze door naar een meer gespecialiseerde masteropleiding. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de biologie dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een algemene, brede of specialistische masteropleiding in de biologie. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede biologische basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het biologisch onderzoek. Het jaarschema is te vinden op de FALW-website. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FALW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FALW-website. Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie II

3 Inhoudsopgave Honours Programme Biologie 1 Facultaire deel Honours programma 1 Stervariant cursussen Health & Life Sc. 1 Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen 1 soverstijgend deel HP 2 Interdepartmental Honours Courses 2 Vervallen vakken bacheloropleidingen FALW 3 Bsc Biologie, jaar 1 5 Bsc Biologie, jaar 2 6 Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken 6 Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken 6 Bsc Biologie, jaar 3 7 FALW-minoren voor Biologiestudenten 7 Minor Biomedical and Health Intervent. 7 Minor Biomolecular and Neurosc. track NS 8 Minor Biomolecular and Neurosc. track BS 8 Minor Brain and Mind 8 Minor Evolutionary Biology and Ecology 9 Minor Topics in Biomedical Sciences 9 Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken 9 Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau 10 Vak: Algemene vaardigheden en encyclopedie 10 Vak: Allergieën en autoimmuunziekten 11 Vak: Allergy and Autoimmunity 13 Vak: Analyseren van biologisch onderzoek 14 Vak: Bachelorstage Biologie 16 Vak: Bedreiging en bescherming II 17 Vak: Beheer en beleid in de gezondheidswetenschappen 18 Vak: Biochemical Regulation in Health and Disease 20 Vak: Biochemie 21 Vak: Biochemistry of Diseases 22 Vak: Bioinformatica 23 Vak: Bioinformatica * 25 Vak: Biomedisch beleid & kennismanagement 25 Vak: Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek 27 Vak: Brain and Behavior 28 Vak: Climate Change 28 Vak: Clinical Trials and Health Care 29 Vak: Cognitive Neuroscience 30 Vak: Communicatietheorie en gezondheid 31 Vak: Current Issues in Psychopathology 32 Vak: Cyclus van het leven 32 Vak: De microbiële cel 34 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie III

4 Vak: Drugs en verslaving 35 Vak: Dynamiek van het historische landschap 36 Vak: Ecologie, mens en natuur 37 Vak: Ecologie, mens en natuur I 39 Vak: Ecologie, mens en natuur II 40 Vak: Ecotoxicologie 42 Vak: Educating for the good life 43 Vak: Environmental Toxicology 43 Vak: Ergonomie 44 Vak: Evolutie en diversiteit van leven 46 Vak: Evolutie van de mens 48 Vak: Evolution and Human Behavior 49 Vak: Evolutionaire ecologie en gedrag 49 Vak: Evolutionaire genetica 51 Vak: Evolutionaire genetica * 52 Vak: Evolutionary Genetics 52 Vak: Experimental Cell Biology I 54 Vak: Experimental Cell Biology II 55 Vak: Experimental Immunology 55 Vak: Experimentele immunologie 56 Vak: Farmacologie en medicijnontwikkeling 57 Vak: Five O Clock Neurosciences (Honours) 59 Vak: From Protein to Cell 60 Vak: Future Challenges in Global Health 61 Vak: Future Entrepreneur 63 Vak: Genen, hersenen en gedrag 63 Vak: Geschiedenis van de levenswetenschappen 64 Vak: Gezondheid in grootstedelijke gebieden 65 Vak: Gezondheidsrecht 66 Vak: Global change 67 Vak: God-Man-World 67 Vak: Governing Security 68 Vak: Health and Psychosocial Factors 68 Vak: Histologie, pathologie en toxicologie 68 Vak: Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences 68 Vak: Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces 69 Vak: Honours Individueel Vak 70 Vak: Honours Leadership 70 Vak: How to survive Vak: HP AUC: Programming your World 71 Vak: HP UvA: Carte Blanche 71 Vak: HP UvA: Creativiteit 71 Vak: HP UvA: Governance of Aquatic 71 Vak: HP UvA: Intelligence Studies 71 Vak: HP UvA: Labyrint 72 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie IV

5 Vak: HP UvA: Learning Lab 72 Vak: HP UvA: Love 72 Vak: HP UvA: Master of Suspicion 72 Vak: HP UvA: wereldliteratuur 72 Vak: Human Evolution 72 Vak: Humane anatomie en fysiologie 74 Vak: Humane Anatomie en Fysiologie * 76 Vak: Humane genetica 76 Vak: Humane neurofysiologie 78 Vak: Humane ontwikkeling * 79 Vak: Illness-Image-Metaphor 79 Vak: Immunologie 80 Vak: Impact of an Empire 80 Vak: Individueel werk 80 Vak: Individueel werk ALW 80 Vak: Individueel werk ALW 80 Vak: Individueel werk ALW 81 Vak: Individuele onderwijsmodule 81 Vak: Infectieziekten en vaccinontwikkeling 81 Vak: Infectious Diseases and Vaccine Development 83 Vak: Inleiding mineralogie 84 Vak: Integratieve tumorcelbiologie 85 Vak: Interculturalisatie van de zorg 86 Vak: Key Strategies in Disability and Neuropathy 88 Vak: Kust en mariene ecosystemen 89 Vak: Levensvragen en wetenschap 91 Vak: Life and Work 92 Vak: Management en beleid in de gezondheidszorg 93 Vak: Mechanisms of Brain Diseases 94 Vak: Medische farmacologie 95 Vak: Mens en evolutie (G&L) 97 Vak: Methodologie en onderzoek in de biologie 98 Vak: Methodologie en statistiek I 99 Vak: Microbiologie 100 Vak: Mind and Machine 101 Vak: Moleculaire celbiologie 101 Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie 102 Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie * 104 Vak: Molecular Cell Biology 105 Vak: Molecular Microbiology 106 Vak: Molecular Principles of Brain Disorders 107 Vak: Multimedia 108 Vak: Nature versus Nurture 109 Vak: Natuur, leven en techniek I 110 Vak: Natuur, leven en techniek II 110 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie V

6 Vak: Neuronal Networks and Behavior 111 Vak: Neuronale en hormonale regulatie II 112 Vak: Neuronale en psychische pathologie 113 Vak: Neurowetenschappen I 114 Vak: Neurowetenschappen I * 115 Vak: Neurowetenschappen II: Genes and the brain 115 Vak: Neurowetenschappen III: monitoring the brain 117 Vak: New Anatomy 119 Vak: Oncologie * 119 Vak: Ontwikkeling en voortplanting van de mens 120 Vak: Oriëntatie op onderzoek 120 Vak: Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij 121 Vak: Paleontologie 122 Vak: Pathologie 123 Vak: Pathologie * 124 Vak: Power and Change 125 Vak: Preklinische neurowetenschappen stervariant 125 Vak: Regulatie en afweer bij dieren 125 Vak: Religion, Identity, Conflict 126 Vak: Ruimtelijke beeldvorming 127 Vak: Seksualiteit en gezondheid 127 Vak: Sport, beweging en gezondheid 129 Vak: Stervariant gezondheidseconomie 130 Vak: Structuurbiologie 130 Vak: Systeemecologie 132 Vak: Systems Ecology 132 Vak: Tailoring Medicine and Telemedicine 134 Vak: The Adaptive Brain 136 Vak: The Developing Brain 136 Vak: The Roman Empire 137 Vak: The use of statistics in legal court cases 137 Vak: Theories of Consciousness 138 Vak: Trends in plantenwetenschappen 138 Vak: Trends in volksgezondheid 139 Vak: Uitbreiding bachelorthesis 140 Vak: Van gen tot gewas 141 Vak: Van molecuul tot mens 143 Vak: Veldwerk 1e jaar 144 Vak: Veldwerk aarde en economie 145 Vak: Voeding en gezondheid stervariant 147 Vak: Volksgezondheid en genetica 147 Vak: Voorspellen en analyseren in de biologie 148 Vak: Water Governance: Full Course 150 Vak: Water Governance: Lectures 150 Vak: Wijsbegeerte en wetenschap 150 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie VI

7 Honours Programme Biologie Opleidingsdelen: - - Facultaire deel Honours programma soverstijgend deel HP Facultaire deel Honours programma Opleidingsdelen: - - Stervariant cursussen Health & Life Sc. Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken: Naam Periode Credits Code Uitbreiding bachelorthesis Periode A_HP-I-3 Stervariant cursussen Health & Life Sc. Vakken: Naam Periode Credits Code Moleculaire ontwikkelingsbiologie * Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen 3.0 A_HP Neurowetenschappen I * 3.0 A_HP Oncologie * Ac. Jaar (september) 3.0 A_HP Pathologie * 3.0 A_HP Preklinische neurowetenschappen stervariant Stervariant gezondheidseconomie Voeding en gezondheid stervariant Ac. Jaar (september) 3.0 A_HP Ac. Jaar (september) 3.0 A_HP Ac. Jaar (september) 3.0 A_HP Vakken: Naam Periode Credits Code Five O Clock Neurosciences (Honours) 6.0 A_HP003 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 1 van 150

8 Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences Ac. Year (September) 6.0 A_HP002 Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces soverstijgend deel HP Ac. Year (September) 6.0 A_HP001 Individuele onderwijsmodule Ac. Jaar (september) 6.0 A_HP-I-1 Opleidingsdelen: - Interdepartmental Honours Courses Interdepartmental Honours Courses Vakken: Naam Periode Credits Code Brain and Behavior Semester OH_BAB Climate Change Periode OH_CC Current Issues in Psychopathology Periode OH_CIP Educating for the good life Periode OH-EFG Evolution and Human Behavior Semester OH-EHB Future Entrepreneur Semester OH_FE God-Man-World 6.0 OH_GMW Governing Security 6.0 OH_GS Health and Psychosocial Factors Semester OH_HPF Honours Individueel Vak Ac. Jaar (september) 8.0 OH_EXT1 Honours Leadership Periode OH_LEAD How to survive OH_HTS HP AUC: Programming your World 6.0 OH_APYW HP UvA: Carte Blanche Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UCB HP UvA: Creativiteit Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UCREA HP UvA: Governance of Aquatic HP UvA: Intelligence Studies Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UGOAQ Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UINST HP UvA: Labyrint Ac. Jaar (september) 6.0 OH_ULA HP UvA: Learning Lab Ac. Jaar (september) 6.0 OH_ULL HP UvA: Love Ac. Jaar (september) 6.0 OH_ULOVE Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 2 van 150

9 HP UvA: Master of Suspicion Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UMS HP UvA: wereldliteratuur Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UWL Illness-Image-Metaphor Semester OH_IIM Impact of an Empire Semester OH_IE Life and Work 6.0 OH_LAW New Anatomy Periode OH_NA Power and Change Ac. Jaar (september) 6.0 OH_UPC Religion, Identity, Conflict Semester OH_RIC The Roman Empire 6.0 OH_TRE The use of statistics in legal court cases Semester 2, Periode OH-SLC Theories of Consciousness 6.0 OH_TOC Vervallen vakken bacheloropleidingen FALW De vakken die hieronder zijn gepresenteerd werden in studiejaar voor het laatst aangeboden. Voor de vakken (.. nader) wordt in studiejaar nog een herkansingsmogelijkheid aangeboden. Voor aanvang van het studiejaar wordt onderstaande lijst gecomplementeerd. Vakken: Naam Periode Credits Code Algemene vaardigheden en encyclopedie Allergieën en autoimmuunziekten Bedreiging en bescherming II Ac. Jaar (september) 4.0 AB_ AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Beheer en beleid in de Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ gezondheidswetenschappen Biochemical Regulation in Health and Disease 6.0 AB_ Biochemie Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Bioinformatica Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Bioinformatica * 3.0 A_HP Biomedisch beleid & kennismanagement Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek Communicatietheorie en gezondheid Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ AB_ Drugs en verslaving 6.0 AB_ Dynamiek van het historische landschap Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ecologie, mens en natuur 12.0 AB_ Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 3 van 150

10 Ecotoxicologie 6.0 AB_ Ergonomie Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Evolutie van de mens 6.0 AB_ Evolutionaire genetica 6.0 AB_ Evolutionaire genetica * 3.0 A_HP Experimentele immunologie 6.0 AB_ Farmacologie en medicijnontwikkeling Gezondheid in grootstedelijke gebieden Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Gezondheidsrecht 6.0 AB_ Global change Ac. Jaar (september) 4.0 AB_ Histologie, pathologie en toxicologie Humane anatomie en fysiologie Humane Anatomie en Fysiologie * Ac. Jaar (september) 6.0 A_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ A_HP Humane genetica Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Humane ontwikkeling * 3.0 A_HP Immunologie Ac. Jaar (september) 6.0 A_ Infectieziekten en vaccinontwikkeling 6.0 AB_ Inleiding mineralogie Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Integratieve tumorcelbiologie Interculturalisatie van de zorg Levensvragen en wetenschap Management en beleid in de gezondheidszorg Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Medische farmacologie Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Mens en evolutie (G&L) 6.0 AB_ Methodologie en statistiek I Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Microbiologie Ac. Jaar (september) 6.0 A_ Moleculaire celbiologie 6.0 AB_ Multimedia Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Natuur, leven en techniek I Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Natuur, leven en techniek II Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Neuronale en hormonale regulatie II Neuronale en psychische pathologie Neurowetenschappen I Neurowetenschappen II: Genes and the brain Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Ac. Jaar (september), Periode AB_ AB_ AB_ Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 4 van 150

11 Neurowetenschappen III: monitoring the brain Ontwikkeling en voortplanting van de mens Bsc Biologie, jaar AB_ Ac. Jaar (september) 6.0 A_ Oriëntatie op onderzoek Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Paleontologie Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Pathologie Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ruimtelijke beeldvorming Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Seksualiteit en gezondheid 6.0 AB_ Sport, beweging en gezondheid 6.0 AB_ Structuurbiologie 6.0 AB_ Systeemecologie 6.0 AB_ Trends in plantenwetenschappen Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Trends in volksgezondheid Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Van molecuul tot mens 12.0 AB_ Veldwerk 1e jaar 5.0 AB_ Veldwerk aarde en economie Volksgezondheid en genetica 7.0 AB_ AB_ In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Biologie en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding van de biologische kennis. De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten. De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers aan het eind van het eerste jaar ontvangt elke eerstejaars een bindend studieadvies. Vakken: Naam Periode Credits Code Cyclus van het leven Periode AB_ Ecologie, mens en natuur I Periode AB_1001 Ecologie, mens en natuur II Periode AB_1002 Evolutie en diversiteit van leven Periode AB_ Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 5 van 150

12 Genen, hersenen en gedrag Periode AB_ Methodologie en onderzoek in de biologie Voorspellen en analyseren in de biologie Bsc Biologie, jaar 2 Periode AB_ Periode AB_ Het tweede jaar van de bacheloropleiding is een verdere oriëntatie binnen de biologie. Daarnaast wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de biologie tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In het tweede jaar zijn alle vakken tot en met week 16 (2010) verplicht. Daarna, in de blokken van week en 22-26, kunnen studenten tweemaal kiezen uit keuzecursussen. Opleidingsdelen: - - Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken Vakken: Naam Periode Credits Code Evolutionaire ecologie en gedrag Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken Periode AB_ Humane neurofysiologie Periode AB_ Moleculaire ontwikkelingsbiologie Periode AB_ Vakken: Naam Periode Credits Code De microbiële cel Periode AB_ Kust en mariene ecosystemen Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij Regulatie en afweer bij dieren Periode AB_ Periode AB_ Periode AB_ Van gen tot gewas Periode AB_ Wijsbegeerte en wetenschap Periode AB_ Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 6 van 150

13 Bsc Biologie, jaar 3 Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken, daarnaast zijn er voornamelijk keuzecursussen. De onderdelen Methodologie en statistiek 2, Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij en de Bachelorstage zijn verplicht. Tijdens de bachelorstage wordt naast het doen van onderzoek veel aandacht gegeven aan de algemene vaardigheden van de student. Hieraan gekoppeld is het schrijven van een onderzoeksverslag. Het derde jaar vormt samen met het tweede jaar de tweede fase van de bacheloropleiding. In deze tweede fase is er ruimte voor een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden. In het derde jaar kiezen studenten voor een groot deel hun eigen programma, waaronder een minor. Daarbij wordt ook tijd besteed aan oriëntatie op de verschillende richtingen die de masteropleiding biedt, zodat studenten aan het eind van het derde jaar een verantwoorde keuze maken uit verschillende differentiaties in de vervolg masteropleiding. Belangrijk onderdeel van het derde jaar is de bachelorstage. Opleidingsdelen: FALW-minoren voor Biologiestudenten Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau FALW-minoren voor Biologiestudenten Opleidingsdelen: Minor Biomedical and Health Intervent. Minor Biomolecular and Neurosc. track NS Minor Biomolecular and Neurosc. track BS Minor Brain and Mind Minor Evolutionary Biology and Ecology Minor Topics in Biomedical Sciences Minor Biomedical and Health Intervent. Vakken: Naam Periode Credits Code Clinical Trials and Health Care Future Challenges in Global Health Infectious Diseases and Vaccine Development Key Strategies in Disability and Neuropathy Period AB_1043 Period AB_1042 Period AB_1046 Period AB_1045 Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 7 van 150

14 Tailoring Medicine and Telemedicine Period AB_1044 Minor Biomolecular and Neurosc. track NS Vakken: Naam Periode Credits Code Experimental Cell Biology I Period AB_1047 Experimental Cell Biology II Period AB_1048 Molecular Principles of Brain Disorders Neuronal Networks and Behavior Minor Biomolecular and Neurosc. track BS Period AB_1049 Period AB_1051 The Adaptive Brain Period AB_1050 Vakken: Naam Periode Credits Code Experimental Cell Biology I Period AB_1047 Experimental Cell Biology II Period AB_1048 From Protein to Cell Period AB_1052 Molecular Cell Biology Period AB_1053 Molecular Microbiology Period AB_ Minor Brain and Mind The minor Brain and Mind is offered by the Faculty of Earth and Life Sciences in collaboration with other leading centres both in the Netherlands and abroad, including the FC Donders Centre in Nijmegen, University of Amsterdam, The University of North Carolina Chapel Hill and the State University of New York. The student will gain insight into the latest knowledge of how the brain works and also how this knowledge can be used to understand cognitive processes, social interactions between individuals, antisocial behavior as well as different brain diseases, such as depression, addictions, attention, or eating disorders. The nature-nurture debate will be discussed as well as recent updates in human genome research. In addition, the minor provides an introduction into the fields of neuroeconomics (decision making) and gaming behavior as well as into recent scientific technological advances in brain-machine interfaces, deep brain stimulation, and robotics. Integration between disciplines The integration between disciplines, such as biology, psychology, sociology and genetics plays a central role in this minor. Students learn to think critically about how knowledge of the brain and the human Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 8 van 150

15 genome can be applied to deal with societal issues. Target population: Third year BSc students alpha and gamma topics (sociology, psychology, economics, law etc.) and students from Life sciences (Biology, Biomedical sciences, Health & Life) with a broad interest. Students in the life sciences that plan to pursue a career in Neuroscience may also follow a more specialised minor in Cell- and Neuroscience. Vakken: Naam Periode Credits Code Cognitive Neuroscience Period AB_1056 Mechanisms of Brain Diseases Minor Evolutionary Biology and Ecology Period AB_1058 Mind and Machine Period AB_1060 Nature versus Nurture Period AB_1057 The Developing Brain Period AB_1059 Vakken: Naam Periode Credits Code Environmental Toxicology Period AB_1020 Evolutionary Genetics Period AB_1022 Human Evolution Period AB_1021 Systems Ecology Period AB_1019 Minor Topics in Biomedical Sciences Vakken: Naam Periode Credits Code Allergy and Autoimmunity Period AB_1024 Biochemistry of Diseases Period AB_1054 Experimental Immunology Period AB_1055 Mechanisms of Brain Diseases Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken Period AB_1058 Vakken: Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 9 van 150

16 Naam Periode Credits Code Analyseren van biologisch onderzoek Periode AB_1003 Bachelorstage Biologie Periode AB_ Geschiedenis van de levenswetenschappen Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij Periode AB_1004 Periode AB_ Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau Vakken: Naam Periode Credits Code Individueel werk Ac. Jaar (september) 0.0 ABE_001 Individueel werk ALW Ac. Jaar (september) 0.0 ABE_005 Individueel werk ALW Ac. Jaar (september) 0.0 ABE_006 Individueel werk ALW Ac. Jaar (september) 0.0 ABE_020 Water Governance: Full Course Water Governance: Lectures Algemene vaardigheden en encyclopedie Ac. Jaar (september) 6.0 AB_ Ac. Jaar (september) 3.0 AB_ Vakcode AB_ (450003) Periode Ac. Jaar (september) Credits 4.0 Engels dr. A.C. Lankreijer Doel vak De opleiding Aarde en Economie leidt je op tot een "academische professional". Dat betekent dat je zelfstandig kunt opereren op academisch niveau. Of je er nu voor kiest om een onderzoeker te worden of een loopbaan ambieert buiten de universiteit, je zult een aantal academische vaardigheden moeten beheersen. Kennisontwikkeling op een universiteit betekent niet alleen leren uit boeken en van hoorcolleges, maar ook om samen met onderzoekers of docenten te zoeken naar antwoorden op wetenschappelijke vragen. Wetenschap is continue in beweging, en ieder antwoord roept weer nieuwe vragen op, waarop je met elkaar en de begeleiders de antwoorden moet zoeken. Om mee te kunnen doen in de academische wereld zul je de regels van het spel moeten kennen en een aantal essentiële academische vaardigheden moeten beheersen. Hiervoor is deze cursus bedoeld. Deze vaardigheden zul je niet alleen tijdens je studie gebruiken, maar ook later in je professionele loopbaan. Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 10 van 150

17 Inhoud vak Aan het eind van deze cursus heb je kennis van, en geoefend met de volgende praktische academische vaardigheden: wetenschappelijk schrijven presenteren van onderzoekresultaten toepassen van interviewtechnieken Daarnaast heb je theoretische kennis van: de wetenschappelijke cyclus het opzetten en uitvoeren van een wetenschappelijk onderzoek ethische normen en waarden in onderzoek De cursus bestaat uit de volgende onderdelen: Een theoretische module over het opzetten van wetenschappelijk onderzoek aangevuld door een drietal practische workshops en een centrale opdracht De workshop Presenteren: Structuur van de presentatie, afstemming op het publiek, interactie met het publiek, oefeningen De workshop Wetenschappelijk Schrijven: over het systematisch schrijven van een goed opgebouwde wetenschappelijk tekst en het ontwikkelen en weergeven van een eigen visie op basis van literatuur De workshop Interviewtechnieken. Naast de theoretische achtergrond van het interviewen als onderzoeksmethode, wordt concreet geoefend met het ontwerpen van interviews en het concreet afnemen van interviews Practische opdracht wetenschappelijk schrijven Onderwijsvorm Werk- en hoorolleges, practische werkgroepen, en groepsopdracht. Studenten wonen tenminste 5 GeoVUsie Geoflex-lezingen bij. Deze lezingen dienen als oriëntatie op de wetenschap en beroepskeuze. De Geoflex-lezingen vinden plaats op de donderdagmiddag om uur. Toetsvorm Werkstuk (60%) en schriftelijk tentamen (40%). Voor de workshops is deelname verplicht. Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen. Literatuur Nader te bepalen. Allergieën en autoimmuunziekten Vakcode AB_ () Engels dr. M.P. Bergman Docent(en) dr. M.P. Bergman Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep Doel vak Allergieën en auto-immuunziekten zijn aandoeningen van het immuunsysteem, waar velen van ons direct of indirect mee te maken krijgen (denk aan bijv. astma, hooikoorts, type 1 diabetes of reuma). Het hoofddoel van de cursus is op moleculair niveau kennis te Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 11 van 150

18 verkrijgen van de mechanismen die een rol spelen in het ontstaan van allergieën en auto-immuunziekten. Daarnaast zullen epidemiologie, sociale en economische gevolgen van allergieën en auto-immuunziekten aan de orde komen. Leerdoelen: Na het volgen van de cursus kan de student: Een aantal sociale en economische implicaties van allergieën en auto-immuunziekten (op zowel individueel als maatschappelijk niveau) beschrijven; De epidemiologie van een aantal allergieën en auto-immuunziekten beschrijven; De mechanismen benoemen en uitleggen, welke ten grondslag liggen aan ziekten die het gevolg zijn van een mankerend immuunsysteem (i.h.b. overgevoeligheid en auto-immuniteit); Aangeven welke erfelijke- en/of externe factoren en processen ten grondslag liggen aan ontsporingen (allergieën en auto-immuun reacties) van het immuunsysteem; Beschrijven hoe micro-organismen en gastheerfactoren kunnen bijdragen tot ontwikkeling van - of juist bescherming tegen auto-immuunziekten; De 'hygiëne-hypothese' verwoorden en kritisch kunnen beschouwen middels voor- en tegen-argumenten; Wetenschappelijke literatuur over immunologische onderwerpen lezen en begrijpen, daarbij de hoofdzaken van de bijzaken scheidend. Niveau 3: specialisatie Onderwijsvorm Hoorcolleges (23 uur) met interactieve elementen; Werkcolleges (7 uur), waarin op basis van geselecteerde literatuur in kleine groepen, een 'modelziekte' tot in detail bestudeerd wordt. Toetsvorm Het eindproduct van de werkcolleges - bestaande uit een powerpoint presentatie en een schriftelijk rapport - maakt 30% uit van het eindcijfer. Een afsluitend schriftelijk examen bepaalt de overige 70% van het eindcijfer. Voor het krijgen van een eindcijfer dient voor beide onderdelen een 5,5 of hoger behaald te worden. Literatuur Peter Parham, The Immune System, 3rd edition, Garland Science, New York and London, ISBN Geselecteerde wetenschappelijke artikelen. Aanbevolen voorkennis Voor het kunnen volgen van deze cursus dient men basale kennis te hebben van immunologische concepten, op het niveau van de basiscursussen Immunologie (voor GZW vakcode en voor BMW vakcode ; laatste cursus is overigens in voor het laatst aangeboden) en Bedreiging en Bescherming I (G&L). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars bachelorstudenten Gezondheid en Leven en Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Gezondheidswetenschappen met belangstelling voor moleculaire vakken. Overige informatie De cursus Allergieën en Auto-immuunziekten heeft dit jaar een maximum van 100 deelnemers. Toelating vindt plaats op basis van volgorde van inschrijving. Vervolgens krijgen derdejaars studenten voorrang bij Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 12 van 150

19 plaatsing. Tweedejaars studenten die niet worden toegelaten kunnen de cursus in het volgende jaar in de minor kiezen. Bij overschrijding van het maximum aantal plaatsen legt het studiesecretariaat een wachtlijst aan, van waaruit aanvulling plaats vindt op basis van bovenstaande regels. Belangrijk: het maximum van 100 deelnemers heeft alleen betrekking op studenten die de cursus voor de eerste keer volgen! Recidivisten die de werkgroepen met een voldoende rapport hebben afgesloten kunnen zich een maand voor aanvang van de cursus aanmelden via de cursuscoördinator en krijgen dan altijd toegang tot de cursussite en de colleges. Allergy and Autoimmunity Course code AB_1024 () Period Period 1 Language of tuition English Faculty Coordinator dr. M.P. Bergman Teaching method(s) Lecture, Study Group, Seminar Course objective Asthma, hay fever, type 1 diabetes and rheumatoid arthritis are wellknown examples of immune-mediated diseases in Western populations. In fact, allergic and autoimmune diseases are likely to affect our lives sooner or later, directly or indirectly. The main purpose of this course is to gain knowledge of the molecular mechanisms that play a role in the onset of allergic and autoimmune diseases. In addition, we will touch upon epidemiology and the social and economical impact of allergic and autoimmune diseases on society. Level 3: specialisation Course content After following this course, students will be able to: Describe social and economical implications of important allergies and autoimmune diseases, for an individual patient, as well as the society; Describe the epidemiology of a few important allergies and autoimmune diaseases; Explain how immunological tolerance and homeostasis is established and maintained; Explain the molecular events that underly disturbances of the immune system and the effector mechanisms that ultimately result in disease; Indicate and explain the role of genetic predisposition and external factors that increase the risk of developing allergic or autoimmune disease(s); Explain how microbial and host factors either predispose or protect individuals from developing autoimmune diseases; Formulate and critically reflect on different versions of the 'hygiene hypothesis theory'; Read, understand, summarize and interpret scientific papers in the field of immunology Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 13 van 150

20 Form of tuition Lectures by experts/clinicians in the field of allergy or autoimmunity (23 hrs); Project groups in which students study an allergic or autoimmune model disease (7 hrs), resulting an oral presentation, written report and research proposal. Type of assessment Evaluation consists of a written examination (70%) in English, comprising both multiple choice questions and essay questions, and the project group report (30%). Course reading Peter Parham, The Immune System, 3rd edition, Garland Science, New York and London, ISBN ; Selected scientific papers Entry requirements Basic knowledge of human immunology is essential to follow this course. VU students meet this requirement when they have successfully completed one of the following courses: Bedreiging en Afweer (BMW), Immunologie (GZW), Bedreiging & Bescherming 1 (Gezondheid & Leven). Students from outside the VU are requested to consult the course co-ordinator, Mathijs Bergman (mathijs.bergman@falw.vu.nl). Target group This is a course in the Biomedical Sciences minor Medical Biology and the Health Sciences minor Biomedical Trends in Public Health. Analyseren van biologisch onderzoek Vakcode AB_1003 () Periode Periode 4 Credits 3.0 Nederlands drs. P. Vos Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum Doel vak Voortbouwend op de statistiek onderwerpen behandeld in Voorspellen en Analyseren in de Biologie wordt een aantal meer geavanceerde statistische methoden voor complexe analyses in de biologische wetenschappen, met name factoriële variantieanalyse geintroduceerd en uitgewerkt, en de uitvoering daarvan wordt geoefend m.b.v. SPSS als voorbereiding op de BSc stage. Uitgezonderd deze uitbreiding van de gereedschapskist ligt het accent in deze cursus op verdieping. Ten dele betreft het een verdieping van de theorie (bijv. de behandeling van statistische power en de problemen bij meervoudig testen). Daarnaast zullen we aandacht besteden aan het kritisch beschouwen van methodologie en statistiek zoals die in de primaire onderzoeksliteratuur worden gepresenteerd. Tot slot wordt in korte projecten verdieping gezocht door onder andere m.b.v. simulatiestudies in Excel de relaties te onderzoeken tussen de (gesimuleerde) werkelijkheid en de resultaten van statistische analyse. Eindtermen Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 14 van 150

21 De student kan kritisch analyseren hoe metingen tot stand zijn gekomen en welke consequenties dat heeft voor een statistische analyse van de gegevens; centrale begrippen uit 'experimental design' (randomisatie, stratificatie, blocking e.d.) hanteren; nagaan of een gegeven dataset voldoet aan de vooronderstellingen van een bepaalde statistische analyse; zelf statistische analyses uitvoeren bij een gegeven experimenteel ontwerp zoals dat voor kan komen bij een BSc stage, de resultaten daarvan interpreteren, en de gegevens grafisch weergeven; herkennen wanneer een non-parametrische techniek gebruikt moet worden; de relatie tussen een statistische hypothese en een wetenschappelijke theorie verklaren; simulaties in Excel uitvoeren en daarmee eigenschappen van een experimenteel design, een toets e.d. (e.g., power) onderzoeken onder verschillende condities gekozen analyse-technieken en gepresenteerde resultaten in de wetenschappelijke literatuur kritisch beschouwen. Inhoud vak Variantieanalyse (genest, factoriëel); Regressieanalyse; Experimental Design; Statistische power en optimal design Onderwijsvorm Hoorcolleges Werkgroepen Computerpractica met Excel en SPSS Zelfstudie Onderzoeksproject, waarin zelfstandig of in kleine groepjes gegevens worden verzameld en geanalyseerd; het project wordt afgesloten met een verslag. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70% van het eindcijfer); Verslag over project (30% van het eindcijfer); Beide onderdelen moeten voldoende zijn. Literatuur Brigitte Baldi & David S. Moore (2009). The Practice of Statistics in the Life Sciences. W.H. Freeman and Company, New York. ISBN (prijs ongeveer 60 euro) (N. B: Dit is hetzelfde boek als gebruikt in eerdere cursussen) Diverse artikelen; tijdens de cursus zullen de URL's hiervoor op Blackboard verschijnen Vereiste voorkennis De cursus Voorspellen en Analyseren in de Biologie (AB_470212) moet met een voldoende zijn afgerond. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie Overige informatie Deze cursus geldt als ingangseis voor het volgen van de masteropleiding Biologie. Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 15 van 150

22 Bachelorstage Biologie Vakcode AB_ () Periode Periode Credits 23.0 Nederlands dr. M.P. Bergman Doel vak De bachelorstage heeft de volgende doelstellingen: Meewerken aan onderzoek in een omgeving waar Biomedisch en-/of Biologisch werk wordt verricht Training in academische vaardigheden. Hiertoe behoren: Een analyse maken van een Biomedisch/ Biologisch probleem Het schrijven van een individueel onderzoeksverslag Het geven van een mondelinge presentatie over onderzoeksresultaten Het maken en presenteren van een congresposter Oriënteren op een keuze voor een masteropleiding Eindtermen: Vakspecifiek: De student kan onder goede begeleiding zelfstandig onderzoek doen in het gekozen vakgebied en beschikt over praktische vaardigheden die hem daartoe in staat stellen. Met betrekking tot algemene academische vaardigheden: De student is in staat de wetenschappelijke literatuur m.b.t een nieuw onderwerp te ontsluiten en in korte tijd aan de hand van relevante artikelen kennis te nemen van de belangrijkste ontwikkelingen in het betreffende vakgebied; De student is in staat een projectvoorstel voor het eigen onderzoek te schrijven; De student heeft geleerd de voortgang tijdens de stage op een overzichtelijke wijze vast te leggen in een journaal; De student is in staat om over de door hem/haar behaalde wetenschappelijke resultaten tijdens de stage op een heldere wijze schriftelijk en mondeling te rapporteren, daarbij adequaat gebruik makend van diverse audiovisuele hulpmiddelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De bachelorstage vormt een belangrijk onderdeel van de bacheloropleiding. Tijdens deze stage oriënteert en specialiseert de student zich in een door hem/haar gekozen richting. De stage wordt afgesloten met het schrijven van een bachelorthesis. Tevens biedt de bachelorstage de student de gelegenheid zich te oriënteren op de keuzes die gemaakt moeten worden voor een masteropleiding en - binnen die opleiding - voor een keuze voor een onderzoekers- of maatschappijgerichte variant, of een afstudeertraject in de richting van communicatie en/of educatie. Onderwijsvorm De student loopt de onderzoeksstage op een wetenschappelijke afdeling of bij een onderzoeksinstelling of bedrijf waar wetenschappelijk onderzoek wordt gedaan Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 16 van 150

23 Toetsvorm Het eindcijfer bestaat uit het cijfer van de stage, te bepalen door de stagebegeleiders. Hiervoor wordt een beoordelingsformulier gebruikt die beschikbaar is op de website van de faculteit. Literatuur Startliteratuur wordt aangedragen door de begeleider. De student zoekt vervolgens zelf verdere literatuur die nodig is om de stage tot een succes te maken. Informatie rond de stage is te vinden op de Blackboardsite. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Overige informatie Studenten worden aangemoedigd reeds in het 2e jaar te beginnen met het oriënteren op - en voorbereiden van - hun onderzoeksstage om zich nog bewuster in hun toekomst (keuzevakken en masteropleiding) te verdiepen. Meer informatie over de gang van zaken tijdens de bachelorstage is te vinden op de Blackboard Community Bachelorstage BMW/BIO 201x-201x (jaar waarin je stage loopt) en op de facultaire website > Studenten > Regelingen). Op de Blackboard stagecommunity kunnen tweedejaars zichzelf inschrijven vanaf medio februari. Bedreiging en bescherming II Vakcode AB_ () Periode Ac. Jaar (september) Nederlands dr. M.P. Bergman Docent(en) dr. M.P. Bergman Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege Doel vak Studenten kennis en inzicht bij te brengen van diverse biologische processen verantwoordelijk voor het in stand houden van het 'milieu interieur' en van enkele hierbij relevante deeldisciplines van de gezondheidswetenschappen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Tijdens Bedreiging en Bescherming II is darmkanker (multifactoriële en soms ook erfelijke bedreiging) het model voor "bedreiging van binnen uit", die bestudeerd wordt. Cel cyclus, apoptose, regulatie en cellulaire communicatie, boodschapper moleculen, receptoren, signaal transductie, immunologische tolerantie tegen 'zelf', en een introductie in de tumor-immunologie komen aan de orde. De student kan uitleggen hoe de celcyclus verloopt en hoe die gecontroleerd wordt, uitleggen wat apoptose is en hoe dat wordt gereguleerd en voorbeelden geven van cellulaire communicatie en Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 17 van 150

24 deze uitleggen. Tevens kan de student effecten van ioniserende straling en toxische stoffen op cellen en weefsels uitleggen en beschrijven welke processen een rol spelen bij de immunologische afweer tegen tumoren. Bij elk van deze bedreigingen zal een gezondheidswetenschappelijk aspect worden behandeld: Preventie: de student kan aan de hand van praktijkvoorbeelden doel en motief van preventie aangeven en de begrippen primaire, secundaire en tertiaire preventie onderscheiden. Tevens kan de student de stappen beschrijven voor een screenings programma en aan de hand van praktijkvoorbeelden doel en motief van preventie aangeven. Epidemiologie: de student kan de begrippen expositie, risicofactoren, mortaliteit, morbiditeit, incidentie, prevalentie en relatief risico onderscheiden. Tevens kan de student registratie van kankergevallen opzoeken. Vaardigheden: het maken van een conceptmap; presentatie; samenwerken; literatuurstudie; in histologische preparaten van de darm verschillende typen cellen herkennen en benoemen en gezonde cellen onderscheiden. Onderwijsvorm Hoorcolleges (18 uur), werkgroepen (14 uur) en zelfstudie Toetsvorm De beoordeling vindt plaats op grond van een rapport (50%) en een schriftelijk tentamen (50%). Voor het krijgen van een eindcijfer dienen beide onderdelen afgerond te worden met een 5,5 of hoger. Literatuur Alberts et al.: Essential Cell Biology, 3rd ed., Taylor & Francis Group; Lewis, Human Genetics, concepts and Applications; Martini, Essentials of Anatomy and Physiology, 8th ed.; Pearson (de boeken van Lewis en Martini et al. zijn al aangeschaft voor de cursus Humane Levenscyclus I en hoeven niet speciaal voor Bedreiging en Bescherming II te worden gekocht). Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven Overige informatie Bedreiging en Bescherming II kan afzonderlijk van B&B-I gevolgd worden Beheer en beleid in de gezondheidswetenschappen Vakcode AB_ () Periode Ac. Jaar (september) Engels prof. dr. J.T. de Cock Buning Docent(en) prof. dr. J.T. de Cock Buning Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 18 van 150

25 Doel vak Inzicht verwerven hoe de maatschappij, politiek en media invloed hebben op, en reageren op, wetenschappelijke ontwikkelingen. Praktijk illustraties hoe in werkelijkheid het beleidsproces wordt aangestuurd en wat de verschillende bestuurlijke visies zijn op beleid. Inzicht verwerven in de interactieve beleidsprocessen. Kennismaken met gangbare managementmodellen en -stijlen en projectmanagement. In de praktijk oefenen met het analyseren van beleid via actornetwerkanalyses en causaalanalyses en het identificeren van beleidsopties. Ervaring opdoen met projectmatig werken in een team voor een externe opdrachtgever op een actuele probleemstelling. Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het formuleren van een onderzoeksopzet, uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren. Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management, Policy Analysis and Entrepreneurship. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak In deze cursus krijg je in het eerste deel colleges over diverse beleids- en managementaspecten, die geïllustreerd worden aan de hand van casussen uit de gezondheidszorg en het gezondheidsonderzoek met een focus op doelmatig geneesmiddelenbeleid. Daarbij maak je specifiek kennis met diverse beleidstheorieën, o.a. de theorie van interactief beleid. Je leert een causaalanalyse te maken om beleidsproblemen te analyseren en je leert diverse managementmodellen te herkennen en de stappen van projectmanagement. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. Het tweede deel van de cursus vorm je in teams kleine consultancybureautjes die zich gespecialiseerd hebben in beleidsadvies. Jullie krijgen van een opdrachtgever de vraag om een concurrerend onderzoeksvoorstel te schrijven voor een later uit te voeren beleidsonderzoek rondom een actueel, maatschappelijk 'medisch' of 'volksgezondheids' vraagstuk in het kader van (overheids)beleid. Voorbeelden zijn de privatisering in de zorg of moeder-kind-transmissie van HIV. Je leert, als consultancy-team, in dit project omgaan met de interdisciplinaire praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd volgens de modellen en instrumenten uit het eerste deel. De resultaten, analyses, conclusies en aanbevelingen worden vormgegeven in een officieel beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd en aangeboden wordt aan de opdrachtgever. Onderwijsvorm De eerste helft van de cursus zal bestaan uit (werk)colleges, de tweede helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. contacturen: 19 uur (werk)colleges en uur begeleiding in projectteams Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) tentamen (50%), en (2) projectopdracht. Individuele beoordeling van de projectopdracht (25%) Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 19 van 150

26 vindt plaats op basis van individuele (tussen)producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten (25%). Beide onderdelen (1 en 2) moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Boek: Hoogerwerf, A. & M. Herweijer: Overheidsbeleid; Een inleiding in de beleidswetenschap. Kluwer, Alphen a/d/ Rijn. 8ste druk en hoger Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen Biochemical Regulation in Health and Disease Vakcode AB_ () Docent(en) Lesmethode(n) Nederlands dr. I.M. van Die prof. dr. B. Teusink, dr. I.M. van Die, dr. A.J.G. Horrevoets, Dr. I.M. van Die Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum Doel vak De cursus is een goede basis voor die studenten die zich in hun masterfase willen richten op immunologie, celbiologie, biochemie, infectieziekten en oncologie. Doel van de cursus is het verwerven van kennis en inzicht in moleculair biochemische aspecten van Regulatie mechanismen die verantwoordelijk zijn voor de communicatie tussen verschillende cellen van het menselijke lichaam Veranderingen van deze moleculaire mechanismen bij (chronische) ontstekingsreacties, en diverse ziekten, zoals hart en vaatziekten, tumor-metastasering en infectieziekten zoals Aids en bacteriële/parasitaire infecties. Er zal inzicht worden verkregen in fundamentele biochemische processen en hun rol in verschillende ziekten. Er zal aandacht worden besteed aan het belang van biochemische kennis voor het ontwikkelen van diagnostische testen en therapieën. Hierbij wordt de weg geopend naar "drugdesign". Meer gedetailleerde informatie over de cursus zal op blackboard worden bekendgemaakt. Niveau 2: verdieping Onderwijsvorm Colleges en practica, en een keuzeproject bestaande uit een praktische opdracht en literatuuronderzoek dat wordt afgesloten met een presentatie en/of poster. In de studiehandleiding zijn uitgebreide aanwijzingen opgenomen m.b.t. de studiestof. Het praktisch deel van de cursus omvat drie laboratoriumexperimenten m.b.t. de samenstelling van het bloedplasma t.a.v. lipoproteïnen, (glyco)proteïnen, bloedgroepen en metabolieten onder verschillende (patho)fysiologische omstandigheden. Daarnaast worden enkele computerpractica aangeboden (drugdesign, massa- spectometry). Tijdens het practicum zal ook vaardigheid worden aangeleerd in het bijhouden van een labjournaal. Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 20 van 150

27 Toetsvorm Schriftelijke toets; practicum en project worden afzonderlijk beoordeeld en tellen mee bij de bepaling van het eindcijfer. Daarbij telt het tentamen voor 65%, het practicum voor 25% en het project voor 10% mee. Literatuur Medical Biochemistry van John Baynes en Marek H. Dominiczak, Uitgeverij Mosby, London (ISBN ), 2e druk (wordt mogelijk gewijzigd, zie tzt blackbord). Studiehandleiding met aanvullende studiestof. Doelgroep De cursus is een keuzecursus voor tweede- en derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen Overige informatie Maximum aantal studenten is 110, op volgorde van inschrijving. Algemene communicatie verloopt via Blackboard. Studenten die deze cursus volgen dienen te zijn gevaccineerd tegen hepatitis B. Biochemie Vakcode AB_ () Periode Docent(en) Lesmethode(n) Ac. Jaar (september) Engels M.J.C. Scholts prof. H. Lill, M.J.C. Scholts, prof. dr. B. Teusink, dr. I.M. van Die, dr. A.J.G. Horrevoets Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Practicum Doel vak Begrip van hoe de macromoleculen in de levende cel in netwerken functioneren en hoe ze daarin samenwerken om de belangrijke levensprocessen uit te voeren. Bijzondere aandacht ligt op de cellulaire energiehuishouding, en op de samenhang en regulatie van metabole routes in de mens. Het practicum omvat voornamelijk proeven uit dit gebied. Eindtermen De student kan: - de ordenende en chaotische krachten die het leven bepalen benoemen; - de centrale rol van ATP in cellulaire systemen beschrijven; - aan de hand van voorbeelden in grote lijnen beschrijven welke mechanismen voor de productie van ATP gebruikt worden; - verschillen tussen chemische en chemiosmotische productie van ATP opnoemen en beschrijven; - mechanismen en drijvende krachten van elektronen transport ketens beschrijven; - de efficiëntie van Gibbs- energietransductie en Gibbsenergiedissipatie in oxidatieve fosforylering, ademhalingsketens, actieve transportprocessen en fotosynthese berekenen; - de paradox tussen de 2de hoofdwet en de ordening van levende Vrije Universiteit Amsterdam - - B Biologie Pagina 21 van 150